Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02116
- Subject:
- NM_030900.3
- Aligned Length:
- 1893
- Identities:
- 1563
- Gaps:
- 330
Alignment
Query 1 ATGGCAGCTCACCTGGTAAAGCGATGCACGTGCCTCCTGAGAGAAGCTGCTCGTCAGGCCCCTGCCATGGCTCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCTCACCTGGTAAAGCGATGCACGTGCCTCCTGAGAGAAGCTGCTCGTCAGGCCCCTGCCATGGCTCC 74
Query 75 AGTTGGCCGACTGAGACTTGCCTGGGTAGCCCATAAGACTCTGACTTCCTCAGCCACCTCACCCATTTCCCACC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTTGGCCGACTGAGACTTGCCTGGGTAGCCCATAAGACTCTGACTTCCTCAGCCACCTCACCCATTTCCCACC 148
Query 149 TCCCAGGTTCCTTGATGGAGCCGGTGGAGAAGGAACGAGCATCTACTCCCTACATAGAGAAGCAGGTGGACCAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCCAGGTTCCTTGATGGAGCCGGTGGAGAAGGAACGAGCATCTACTCCCTACATAGAGAAGCAGGTGGACCAC 222
Query 223 CTCATCAAGAAGGCCACAAGGCCAGAGGAGCTCCTGGAGCTACTTGGTGGCAGTCACGACTTGGACAGCAATCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTCATCAAGAAGGCCACAAGGCCAGAGGAGCTCCTGGAGCTACTTGGTGGCAGTCACGACTTGGACAGCAATCA 296
Query 297 AGCAGCAATGGTACTTATCCGGCTCTCTCACTTGCTGTCTGAGAAGCCAGAAGATAAAGGCTTGCTCATACAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGCAGCAATGGTACTTATCCGGCTCTCTCACTTGCTGTCTGAGAAGCCAGAAGATAAAGGCTTGCTCATACAGG 370
Query 371 ATGCCCACTTTCATCAACTTCTCTGTCTGCTCAACAGTCAGATTGCCTCGGTCTGGCATGGTACCCTCTCGAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGCCCACTTTCATCAACTTCTCTGTCTGCTCAACAGTCAGATTGCCTCGGTCTGGCATGGTACCCTCTCGAAG 444
Query 445 CTGCTGGGAAGCCTGTATGCTCTGGGCATCCCCAAGGCCTCCAAGGAGCTGCAGTCGGTGGAGCAGGAGGTCCG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGCTGGGAAGCCTGTATGCTCTGGGCATCCCCAAGGCCTCCAAGGAGCTGCAGTCGGTGGAGCAGGAGGTCCG 518
Query 519 CTGGCGCATGCGGAAGCTCAAGTACAAGCACCTGGCCTTCCTGGCAGAGTCCTGTGCCACCCTCTCACAGGAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTGGCGCATGCGGAAGCTCAAGTACAAGCACCTGGCCTTCCTGGCAGAGTCCTGTGCCACCCTCTCACAGGAGC 592
Query 593 AGCACTCGCAGGAGCTGCTGGCTGAGCTGCTCACACACCTGGAAAGGCGTTGGACAGAAATTGAAGATTCCCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCACTCGCAGGAGCTGCTGGCTGAGCTGCTCACACACCTGGAAAGGCGTTGGACAGAAATTGAAGATTCCCAC 666
Query 667 ACATTAGTGACCGTCATGATGAAGGTGGGACACCTCTCGGAGCCACTAATGAACCGCCTGGAAGACAAGTGCCT 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACATTAGTGACCGTCATGATGAAGGTGGGACACCTCTCGGAGCCACTAATGAACCGCCTGGAAGACA------- 733
Query 741 GGAGTTGGTGGAGCACTTTGGCCCCAATGAGCTGCGGAAGGTGCTGGTGATGCTGGCAGCTCAGAGCCGGCGGT 814
Sbjct 734 -------------------------------------------------------------------------- 733
Query 815 CCGTGCCCTTGCTGCGGGCCATCTCCTACCACCTGGTGCAGAAGCCCTTCTCTCTGACGAAAGATGTGCTCTTG 888
Sbjct 734 -------------------------------------------------------------------------- 733
Query 889 GACGTGGCCTATGCCTATGGCAAACTCAGCTTTCACCAGACCCAGGTGTCCCAGCGCCTGGCCACCGACCTGCT 962
Sbjct 734 -------------------------------------------------------------------------- 733
Query 963 ATCCCTCATGCCCAGCCTGACTTCTGGTGAGGTGGCCCACTGTGCCAAGTCCTTCGCCTTACTCAAGTGGCTCA 1036
Sbjct 734 -------------------------------------------------------------------------- 733
Query 1037 GCCTGCCCCTGTTTGAGGCCTTTGCCCAGCACGTCCTGAACAGAGCGCAGGACATCACCCTGCCCCACCTGTGC 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 ---------------------------AGCACGTCCTGAACAGAGCGCAGGACATCACCCTGCCCCACCTGTGC 780
Query 1111 AGCGTACTTCTGGCTTTTGCGCGTCTGAACTTCCATCCAGACCAAGAGGATCAGTTCTTCAGCCTGGTACATGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGCGTACTTCTGGCTTTTGCGCGTCTGAACTTCCATCCAGACCAAGAGGATCAGTTCTTCAGCCTGGTACATGA 854
Query 1185 GAAGCTGGGGTCAGAGCTGCCAGGCCTGGAGCCAGCCCTGCAGGTGGACCTGGTGTGGGCCCTGTGTGTGCTGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 GAAGCTGGGGTCAGAGCTGCCAGGCCTGGAGCCAGCCCTGCAGGTGGACCTGGTGTGGGCCCTGTGTGTGCTGC 928
Query 1259 AGCAGGCACGGGAAGCAGAGCTGCAAGCCGTCCTCCACCCTGAATTTCACATCCAATTTCTAGGGGGCAAGTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 AGCAGGCACGGGAAGCAGAGCTGCAAGCCGTCCTCCACCCTGAATTTCACATCCAATTTCTAGGGGGCAAGTCT 1002
Query 1333 CAGAAGGATCAGAACACCTTCCAGAAGCTGCTCCACATCAACGCCACTGCCCTGCTGGAGTACCCCGAGTACTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 CAGAAGGATCAGAACACCTTCCAGAAGCTGCTCCACATCAACGCCACTGCCCTGCTGGAGTACCCCGAGTACTC 1076
Query 1407 GGGTCCCCTTCTGCCTGCCTCGGCTGTGGCCCCTGGGCCCTCAGCCCTTGACAGGAAGGTGACCCCCCTGCAAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 GGGTCCCCTTCTGCCTGCCTCGGCTGTGGCCCCTGGGCCCTCAGCCCTTGACAGGAAGGTGACCCCCCTGCAAA 1150
Query 1481 AGGAGCTGCAGGAGACGCTGAAGGGGCTGCTGGGGAGCGCCGACAAGGGCAGCCTCGAGGTGGCCACGCAGTAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 AGGAGCTGCAGGAGACGCTGAAGGGGCTGCTGGGGAGCGCCGACAAGGGCAGCCTCGAGGTGGCCACGCAGTAT 1224
Query 1555 GGCTGGGTGCTGGATGCTGAGGTGCTGCTGGACAGTGACGGCGAGTTTCTGCCCGTAAGGGACTTTGTGGCACC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225 GGCTGGGTGCTGGATGCTGAGGTGCTGCTGGACAGTGACGGCGAGTTTCTGCCCGTAAGGGACTTTGTGGCACC 1298
Query 1629 TCACCTTGCCCAGCCAACTGGGAGCCAGTCACCACCTCCAGGGTCTAAGAGGCTAGCGTTCTTGCGGTGGGAGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299 TCACCTTGCCCAGCCAACTGGGAGCCAGTCACCACCTCCAGGGTCTAAGAGGCTAGCGTTCTTGCGGTGGGAGT 1372
Query 1703 TCCCCAACTTCAACAGCCGAAGCAAGGACTTGCTGGGTCGCTTTGTTCTGGCCCGGCGACACATAGTGGCTGCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 TCCCCAACTTCAACAGCCGAAGCAAGGACTTGCTGGGTCGCTTTGTTCTGGCCCGGCGACACATAGTGGCTGCA 1446
Query 1777 GGCTTCCTGATAGTGGACGTCCCATTCTATGAGTGGCTGGAACTCAAGTCTGAATGGCAGAAAGGCGCCTACCT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 GGCTTCCTGATAGTGGACGTCCCATTCTATGAGTGGCTGGAACTCAAGTCTGAATGGCAGAAAGGCGCCTACCT 1520
Query 1851 CAAGGACAAGATGCGCAAAGCGGTGGCTGAGGAGCTGGCCAAG 1893
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521 CAAGGACAAGATGCGCAAAGCGGTGGCTGAGGAGCTGGCCAAG 1563