Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02135
- Subject:
- NM_001305437.1
- Aligned Length:
- 1086
- Identities:
- 890
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ------------------------------------ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAGTCCAAACCGTTTTGGG 38
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||
Sbjct 1 ATGAGTTCAAAGAAAATCCCTGAGACACTATCAGGAATGTCTTCCTTAAGTGGGAAAGTACAAACAGTTCTGGG 74
Query 39 CCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGACCCATGAACACCTGGCCATGACCTTTGACTGCTGTTACT 112
|||||||||.||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.||||||||||||.|.|.|||||
Sbjct 75 CCTTGTAGAACCCAGCCAACTGGGACGCACCCTGACCCACGAGCATCTGACAATGACCTTTGACAGTTTTTACT 148
Query 113 GTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAGAACCTATCGTGATGAAAAATTTATATTGGATTCAGAAA 186
|.||||||||.||.|||||.||||..|..|||||.|||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 149 GCCCACCTCCTCCATGCCACGAAGTCACCTCCAAGGAACCTATCATGATGAAAAATCTATTTTGGATTCAGAAA 222
Query 187 AACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAATCAGGAGACAGAAGCCATAAAGGAAGAACTGTTGTATTT 260
|||.|||||||||||..|||.||||||||.||.|||||||||..||.||||||||..|||||.|||||||||||
Sbjct 223 AACCCCTATTCCCATCGAGAGAACCTTCAGTTGAATCAGGAGGTAGGAGCCATAAGAGAAGAGCTGTTGTATTT 296
Query 261 TAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACACAACCACTGGGATTAGCCGAGACACACAGACGTTGAAGA 334
.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.||||||.|.|||.|.|||...||.|||.|||||.
Sbjct 297 CAAGGCTAAGGGCGGAGGAGCCTTGGTGGAGAATACGACAACTGGGCTCAGCAGGGACGTGCATACGCTGAAGT 370
Query 335 GGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTGGAGCCGGGTTTTATGTGGATGCAACTCACTCCTCAGAG 408
||||.|||||..|||||||.|||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||..
Sbjct 371 GGCTGGCAGAGCAGACTGGAGTCCACATCATAGCTGGAGCTGGGTTTTATGTTGATGCAACTCACTCTGCAGCA 444
Query 409 ACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTCCTTATGAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGAACCAG 482
|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 ACCAGAGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACAGATGTCCTTATTAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGCACCAG 518
Query 483 TATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTCCTGGCCTTTGACTGAGAGTGAAAGAAAGGTTCTCCAGG 556
.|||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.||..|||
Sbjct 519 CATCAAGTGTGGAGTTATTGGAGAAATTGGCTGCTCCTGGCCTTTGACTGACAGCGAGAGAAAGATACTTGAGG 592
Query 557 CCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTGTTATTATCCATCCTGGACGGAGCTCCAGG-GCACCATT 629
|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||.| ||||| ||||||||
Sbjct 593 CTACAGCTCACGCCCAGGCTCAGCTTGGCTGTCCTGTCATCATCCATCCTGGACGGAAC-CCAGGTGCACCATT 665
Query 630 TCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCACACCTGGATAGGACTA 703
.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 666 CCAGATAATCCGTATACTGCAAGAAGCAGGAGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCCCACCTTGACAGGACTA 739
Query 704 TTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAACTTGGCTGCTACTTGGAATATGATCTCTTTGGTACTGAA 777
|..||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 740 TATTTGATAAGAAAGAGCTGCTGGAGTTTGCTCAACTTGGCTGCTACTTGGAATACGATCTCTTTGGTACGGAA 813
Query 778 CTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTGCGTCTCCT 851
||.|||.|||||||..|..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|.||
Sbjct 814 CTCCTTAATTACCAGTTGAGCCCAGATATTGATATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTCCATTTTCT 887
Query 852 GGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGCACATGACATACATACGAAAACC--CGGCTGATGAAATA 923
.|||||.|||||||.|||||||||.|||||..|.||||||||||||||.|| |||.| |||.|||||||.||
Sbjct 888 AGTGGATGAGGGCTATGAAGATCGGATTCTCATGGCACATGACATACACAC--AAAGCATCGGTTGATGAAGTA 959
Query 924 TGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGTTGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGCATAACTGAGAATG 997
.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||..||||||||||.|||.|.||.|||||..|.|||||||..|
Sbjct 960 CGGAGGTCACGGCTACTCACACATCCTTACCAACATTGTTCCTAAGATGCTCCTTAGAGGTCTGACTGAGAGGG 1033
Query 998 TGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAATGGCTAACTTTCAAA 1047
|||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1034 TGCTTGACAAGATACTCATAGAAAACCCTAAACAATGGCTGACTTTTAAA 1083