Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02153
- Subject:
- XM_017002845.1
- Aligned Length:
- 4278
- Identities:
- 3485
- Gaps:
- 780
Alignment
Query 1 ATGGAGAATTACTTCCAAGCAGAAGCTTACAACCTGGACAAGGTGTTAGATGAATTTGAACAAAACGAAGATGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAATTACTTCCAAGCAGAAGCTTACAACCTGGACAAGGTGTTAGATGAATTTGAACAAAACGAAGATGA 74
Query 75 AACAGTTTCTTCTACTTTATTGGATACAAAGTGGAATAAGATTCTAGATCCCCCTTCTCACCGGCTGTCATTTA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACAGTTTCTTCTACTTTATTGGATACAAAGTGGAATAAGATTCTAGATCCCCCTTCTCACCGGCTGTCATTTA 148
Query 149 ACCCTACTTTGGCCAGTGTGAATGAATCTGCAGTTTCTAATGAGTCACAACCACAACTGAAAGTCTTCTCCCTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCCTACTTTGGCCAGTGTGAATGAATCTGCAGTTTCTAATGAGTCACAACCACAACTGAAAGTCTTCTCCCTG 222
Query 223 GCTCATTCAGCTCCCCTGACCACAGAGGAAGAGGATCACTGTGCTAATGGACAGGACTGTAATCTAAATCCAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTCATTCAGCTCCCCTGACCACAGAGGAAGAGGATCACTGTGCTAATGGACAGGACTGTAATCTAAATCCAGA 296
Query 297 GATTGCCACAATGTGGATTGATGAAAATGCTGTTGCAGAAGACCAGTTAATTAAGAGAAACTATAGTTGGGATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATTGCCACAATGTGGATTGATGAAAATGCTGTTGCAGAAGACCAGTTAATTAAGAGAAACTATAGTTGGGATG 370
Query 371 ATCAATGCAGTGCTGTTGAAGTGGGAGAGAAGAAATGTGGAAACCTGGCTTGTCTGCCAGATGAGAAGAATGTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCAATGCAGTGCTGTTGAAGTGGGAGAGAAGAAATGTGGAAACCTGGCTTGTCTGCCAGATGAGAAGAATGTT 444
Query 445 CTTGTTGTAGCCGTCATGCATAACTGTGATAAAAGGACATTACAAAACGATTTACAGGATTGTAATAATTATAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTGTTGTAGCCGTCATGCATAACTGTGATAAAAGGACATTACAAAACGATTTACAGGATTGTAATAATTATAA 518
Query 519 TAGTCAATCCCTTATGGATGCTTTTAGCTGTTCACTGGATAATGAAAACAGACAAACTGATCAATTTAGTTTTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAGTCAATCCCTTATGGATGCTTTTAGCTGTTCACTGGATAATGAAAACAGACAAACTGATCAATTTAGTTTTA 592
Query 593 GTATAAATGAGTCCACTGAAAAAGATATGAATTCAGAGAAACAAATGGATCCATTGAATAGACCGAAAACAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTATAAATGAGTCCACTGAAAAAGATATGAATTCAGAGAAACAAATGGATCCATTGAATAGACCGAAAACAGAG 666
Query 667 GGGAGATCTGTTAACCATCTGTGTCCTACTTCATCTGATAGTCTAGCCAGTGTCTGTTCCCCTTCACAATTAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGAGATCTGTTAACCATCTGTGTCCTACTTCATCTGATAGTCTAGCCAGTGTCTGTTCCCCTTCACAATTAAA 740
Query 741 GGATGACGGAAGTATAGGTAGAGACCCCTCCATGTCTGCGATTACAAGTTTAACGGTTGATTCAGTAATCTCAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGATGACGGAAGTATAGGTAGAGACCCCTCCATGTCTGCGATTACAAGTTTAACGGTTGATTCAGTAATCTCAT 814
Query 815 CCCAGGGAACAGATGGATGTCCTGCTGTTAAAAAGCAAGAGAACTATATACCAGATGAGGACCTCACTGGCAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCAGGGAACAGATGGATGTCCTGCTGTTAAAAAGCAAGAGAACTATATACCAGATGAGGACCTCACTGGCAAA 888
Query 889 ATCAGCTCTCCTAGGACAGATCTAGGGAGTCCAAATTCCTTTTCCCACATGAGTGAGGGGATTTTGATGAAAAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCAGCTCTCCTAGGACAGATCTAGGGAGTCCAAATTCCTTTTCCCACATGAGTGAGGGGATTTTGATGAAAAA 962
Query 963 AGAGCCAGCAGAGGAGAGCACCACTGAAGAATCCCTCCGGTCTGGTTTACCTTTGCTTCTCAAACCAGACATGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGAGCCAGCAGAGGAGAGCACCACTGAAGAATCCCTCCGGTCTGGTTTACCTTTGCTTCTCAAACCAGACATGC 1036
Query 1037 CTAATGGGTCTGGAAGGAATAATGACTGTGAACGGTGTTCAGATTGCCTTGTGCCTAATGAAGTTAGGGCTGAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTAATGGGTCTGGAAGGAATAATGACTGTGAACGGTGTTCAGATTGCCTTGTGCCTAATGAAGTTAGGGCTGAT 1110
Query 1111 GAAAATGAAGGTTATGAACATGAAGAAACTCTTGGCACTACAGAATTCCTTAATATGACAGAGCATTTCTCTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAAAATGAAGGTTATGAACATGAAGAAACTCTTGGCACTACAGAATTCCTTAATATGACAGAGCATTTCTCTGA 1184
Query 1185 ATCTCAGGACATGACTAATTGGAAGTTGACTAAACTAAATGAGATGAATGATAGCCAAGTAAACGAAGAAAAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATCTCAGGACATGACTAATTGGAAGTTGACTAAACTAAATGAGATGAATGATAGCCAAGTAAACGAAGAAAAGG 1258
Query 1259 AAAAGTTTCTACAGATTAGTCAGCCTGAGGACACTAATGGTGATAGTGGAGGACAGTGTGTTGGATTGGCAGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAAGTTTCTACAGATTAGTCAGCCTGAGGACACTAATGGTGATAGTGGAGGACAGTGTGTTGGATTGGCAGAT 1332
Query 1333 GCAGGTCTAGATTTAAAAGGAACTTGCATTAGTGAAAGTGAAGAATGTGATTTCTCCACTGTTATAGACACACC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCAGGTCTAGATTTAAAAGGAACTTGCATTAGTGAAAGTGAAGAATGTGATTTCTCCACTGTTATAGACACACC 1406
Query 1407 AGCAGCAAATTATCTATCTAATGGTTGTGATTCCTATGGAATGCAAGACCCAGGTGTTTCTTTTGTTCCAAAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGCAGCAAATTATCTATCTAATGGTTGTGATTCCTATGGAATGCAAGACCCAGGTGTTTCTTTTGTTCCAAAGA 1480
Query 1481 CTTTACCCTCCAAAGAAGATTCAGTAACAGAAGAAAAAGAAATAGAGGAAAGCAAGTCAGAATGCTACTCAAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTTTACCCTCCAAAGAAGATTCAGTAACAGAAGAAAAAGAAATAGAGGAAAGCAAGTCAGAATGCTACTCAAAT 1554
Query 1555 ATTTATGAACAGAGAGGAAATGAGGCCACAGAAGGGAGTGGACTACTTTTAAACAGCACTGGTGACCTAATGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATTTATGAACAGAGAGGAAATGAGGCCACAGAAGGGAGTGGACTACTTTTAAACAGCACTGGTGACCTAATGAA 1628
Query 1629 GAAAAATTATTTACATAATTTCTGTAGTCAAGTTCCATCAGTGCTTGGGCAATCTTCCCCCAAGGTAGTAGCAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAAAAATTATTTACATAATTTCTGTAGTCAAGTTCCATCAGTGCTTGGGCAATCTTCCCCCAAGGTAGTAGCAA 1702
Query 1703 GCCTGCCATCTATCAGTGTTCCTTTTGGTGGTGCAAGACCCAAGCAACCTTCTAATCTTAAACTTCAAATTCCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCCTGCCATCTATCAGTGTTCCTTTTGGTGGTGCAAGACCCAAGCAACCTTCTAATCTTAAACTTCAAATTCCA 1776
Query 1777 AAGCCATTATCAGACCATTTACAAAATGACTTTCCTGCAAACAGTGGAAATAATACTAAAAATAAAAATGATAT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAGCCATTATCAGACCATTTACAAAATGACTTTCCTGCAAACAGTGGAAATAATACTAAAAATAAAAATGATAT 1850
Query 1851 TCTTGGGAAAGCAAAATTAGGGGAAAACTCAGCAACCAATGTATGCAGTCCATCTTTGGGAAACATCTCTAATG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCTTGGGAAAGCAAAATTAGGGGAAAACTCAGCAACCAATGTATGCAGTCCATCTTTGGGAAACATCTCTAATG 1924
Query 1925 TCGATACAAATGGGGAACATTTAGAAAGTTATGAGGCTGAGATCTCCACTAGACCATGCCTTGCATTAGCTCCA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TCGATACAAATGGGGAACATTTAGAAAGTTATGAGGCTGAGATCTCCACTAGACCATGCCTTGCATTAGCTCCA 1998
Query 1999 GATAGCCCAGATAATGATCTCAGAGCTGGTCAGTTTGGAATTTCTGCCAGAAAGCCATTCACCACTCTGGGTGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GATAGCCCAGATAATGATCTCAGAGCTGGTCAGTTTGGAATTTCTGCCAGAAAGCCATTCACCACTCTGGGTGA 2072
Query 2073 GGTGGCTCCAGTATGGGTACCGGATTCTCAGGCTCCAAATTGCATGAAATGTGAAGCCAGGTTTACATTCACCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGTGGCTCCAGTATGGGTACCGGATTCTCAGGCTCCAAATTGCATGAAATGTGAAGCCAGGTTTACATTCACCA 2146
Query 2147 AAAGGAGGCATCACTGCAGAGCATGTGGGAAGGTTTTCTGTGCTTCCTGCTGTAGCCTGAAATGTAAACTGTTA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AAAGGAGGCATCACTGCAGAGCATGTGGGAAGGTTTTCTGTGCTTCCTGCTGTAGCCTGAAATGTAAACTGTTA 2220
Query 2221 TACATGGACAGAAAGGAAGCTAGAGTGTGTGTAATCTGCCATTCAGTGCTAATGAATGCTCAAGCCTGGGAGAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TACATGGACAGAAAGGAAGCTAGAGTGTGTGTAATCTGCCATTCAGTGCTAATGAATGCTCAAGCCTGGGAGAA 2294
Query 2295 CATGATGAGTGCCTCAAGCCAGAGCCCTAACCCTAACAATCCTGCTGAATACTGTTCTACTATCCCTCCCTTGC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CATGATGAGTGCCTCAAGCCAGAGCCCTAACCCTAACAATCCTGCTGAATACTGTTCTACTATCCCTCCCTTGC 2368
Query 2369 AGCAAGCTCAGGCCTCAGGAGCTCTGAGCTCTCCACCTCCCACTGTGATGGTACCTGTGGGAGTTTTAAAGCAC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGCAAGCTCAGGCCTCAGGAGCTCTGAGCTCTCCACCTCCCACTGTGATGGTACCTGTGGGAGTTTTAAAGCAC 2442
Query 2443 CCTGGAGCAGAAGTGGCTCAGCCCAGAGAGCAGAGGCGAGTTTGGTTTGCTGATGGGATCTTGCCCAATGGAGA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCTGGAGCAGAAGTGGCTCAGCCCAGAGAGCAGAGGCGAGTTTGGTTTGCTGATGGGATCTTGCCCAATGGAGA 2516
Query 2517 AGTTGCTGATGCAGCCAAATTAACAATGAATGGAACTTCCTCTGCAGGAACCCTGGCTGTGTCACACGACCCAG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AGTTGCTGATGCAGCCAAATTAACAATGAATGGAACTTCCTCTGCAGGAACCCTGGCTGTGTCACACGACCCAG 2590
Query 2591 TCAAGCCAGTAACTACCAGTCCTCTACCAGCAGAGACGGATATTTGTCTATTCTCTGGGAGTATAACTCAGGTT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCAAGCCAGTAACTACCAGTCCTCTACCAGCAGAGACGGATATTTGTCTATTCTCTGGGAGTATAACTCAGGTT 2664
Query 2665 GGAAGTCCTGTTGGAAGTGCAATGAATCTTATTCCTGAAGATGGCCTTCCTCCCATTCTCATCTCCACTGGTGT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GGAAGTCCTGTTGGAAGTGCAATGAATCTTATTCCTGAAGATGGCCTTCCTCCCATTCTCATCTCCACTGGTGT 2738
Query 2739 AAAAGGAGACTATGCTGTGGAAGAGAAACCATCACAGATTTCAGTAATGCAGCAGTTGGAGGATGGTGGCCCTG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 AAAAGGAGACTATGCTGTGGAAGAGAAACCATCACAGATTTCAGTAATGCAGCAGTTGGAGGATGGTGGCCCTG 2812
Query 2813 ACCCACTTGTATTTGTTTTAAATGCAAATTTGTTGTCAATGGTTAAAATTGTAAATTATGTGAACAGGAAGTGC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ACCCACTTGTATTTGTTTTAAATGCAAATTTGTTGTCAATGGTTAAAATTGTAAATTATGTGAACAGGAAGTGC 2886
Query 2887 TGGTGTTTCACAACCAAGGGAATGCATGCAGTGGGTCAGTCTGAGATAGTCATTCTTCTACAGTGTTTACCGGA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TGGTGTTTCACAACCAAGGGAATGCATGCAGTGGGTCAGTCTGAGATAGTCATTCTTCTACAGTGTTTACCGGA 2960
Query 2961 TGAAAAGTGTTTGCCAAAGGATATCTTTAATCACTTTGTGCAGCTTTATCGGGATGCTCTGGCAGGGAATGTGG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TGAAAAGTGTTTGCCAAAGGATATCTTTAATCACTTTGTGCAGCTTTATCGGGATGCTCTGGCAGGGAATGTGG 3034
Query 3035 TGAGCAACTTGGGACATTCCTTCTTCAGTCAAAGTTTCCTTGGCAGTAAAGAACATGGTGGATTCTTATATGTG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TGAGCAACTTGGGACATTCCTTCTTCAGTCAAAGTTTCCTTGGCAGTAAAGAACATGGTGGATTCTTATATGTG 3108
Query 3109 ACATCTACCTACCAGTCACTGCAAGACCTAGTACTCCCAACCCCACCTTACTTGTTTGGGATTCTTATCCAGAA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ACATCTACCTACCAGTCACTGCAAGACCTAGTACTCCCAACCCCACCTTACTTGTTTGGGATTCTTATCCAGAA 3182
Query 3183 ATGGGAAACTCCTTGGGCTAAAGTATTTCCTATCCGTCTGATGTTGAGACTTGGAGCTGAATATCGACTTTATC 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 ATGGGAAACTCCTTGGGCTAAAGTATTTCCTATCCGTCTGATGTTGAGACTTGGAGCTGAATATCGACTTTATC 3256
Query 3257 CATGCCCACTATTCAGTGTCAGATTTCGGAAGCCATTGTTTGGAGAGACGGGGCATACCATCATGAATCTTCTT 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CATGCCCACTATTCAGTGTCAGATTTCGGAAGCCATTGTTTGGAGAGACGGGGCATACCATCATGAATCTTCTT 3330
Query 3331 GCAGACTTCAGAAATTACCAGTATACCTTGCCAGTAGTTCAAGGTTTGGTGGTTGATATGGAAGTTCGGAAAAC 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GCAGACTTCAGAAATTACCAGTATACCTTGCCAGTAGTTCAAGGTTTGGTGGTTGATATGGAAGTTCGGAAAAC 3404
Query 3405 TAGCATCAAAATTCCCAGCAACAGATACAATGAGATGATGAAAGCCATGAACAAGTCCAATGAGCATGTCCTGG 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||.| || |||.|.||| |...|||.|
Sbjct 3405 TAGCATCAAAATTCCCAGCAACAGATACAATGAGGT-AT------CATCAGCAA-----------ACACCCTAG 3460
Query 3479 CA-GGAGGTGCCTGCTT--CAATGAAAAGGCAGACTCTCATCTTGTGTGTGTACAGAATGATGATGGAAACTAT 3549
.| ||| ||| |.|| ||| |||| .||||..|| |||||
Sbjct 3461 TACGGA-GTG---GGTTAGCAA-GAAA-----------TATCTGTTG------------GATGA---------- 3496
Query 3550 CAGACCCAGGCTATCAGTATTCACAATCAGCCCAGAAAAGTGACTGGTGCCAGTTTCTTTGTGTTCAGTGGCGC 3623
||||.
Sbjct 3497 -AGACA-------------------------------------------------------------------- 3501
Query 3624 TCTGAAATCCTCTTCTGGATACCTTGCCAAGTCCAGTATTGTGGAAGATGGTGTTATGGTCCAGATTACTGCAG 3697
Sbjct 3502 -------------------------------------------------------------------------- 3501
Query 3698 AGAACATGGATTCCTTGAGGCAGGCACTGCGAGAGATGAAGGACTTCACCATCACCTGTGGGAAGGCGGACGCG 3771
Sbjct 3502 -------------------------------------------------------------------------- 3501
Query 3772 GAGGAACCCCAGGAGCACATCCACATCCAGTGGGTGGATGATGACAAGAACGTTAGCAAGGGTGTCGTAAGTCC 3845
Sbjct 3502 -------------------------------------------------------------------------- 3501
Query 3846 TATAGATGGGAAGTCCATGGAGACTATAACAAATGTGAAGATATTCCATGGATCAGAATATAAAGCAAATGGAA 3919
Sbjct 3502 -------------------------------------------------------------------------- 3501
Query 3920 AAGTAATCAGATGGACAGAGGTGTTTTTCCTAGAAAACGATGACCAGCACAATTGCCTCAGTGATCCTGCAGAT 3993
Sbjct 3502 -------------------------------------------------------------------------- 3501
Query 3994 CACAGTAGATTGACTGAGCATGTTGCCAAAGCTTTTTGCCTTGCTCTCTGTCCTCACCTGAAACTTCTGAAGGA 4067
Sbjct 3502 -------------------------------------------------------------------------- 3501
Query 4068 AGATGGAATGACCAAACTGGGACTACGTGTGACACTTGACTCAGATCAGGTTGGCTATCAAGCAGGGAGCAATG 4141
Sbjct 3502 -------------------------------------------------------------------------- 3501
Query 4142 GCCAGCCCCTTCCCTCGCAGTACATGAATGATCTGGACAGCGCCTTGGTGCCGGTGATCCATGGAGGGGCCTGC 4215
Sbjct 3502 -------------------------------------------------------------------------- 3501
Query 4216 CAGCTTAGTGAGGGCCCCGTTGTCATGGAACTCATCTTTTATATTCTGGAAAACATCGTA 4275
Sbjct 3502 ------------------------------------------------------------ 3501