Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02202
• Subject: NM_181281.1
• Aligned Length: 1152
• Identities: 864
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAAAGTGGGACTGGATGCTACAAACTGTTTGAGGATAACTGACTTAAAATCTGGCTGCACATCATTGACTCCTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATACCATATG---CTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTC  219
                                              ||.||   |||.|             ||||.||.||||||
Sbjct    1  ----------------------------------ATGTGTGCCTGTA-------------GGGACATAATTTTC  27

Query  220  AATGCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTATCTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGC  293
            |||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct   28  AATGCTCAGTACCCAGAGCTGCCTCCTGATTTCATCTTTGGAGAGGATGCTGAGTTTCTGCCAGACCCCTCTGC  101

Query  294  TTTGCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATCCTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAAC  367
            ..||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  102  GCTGCACAACCTTGCCTCCTGGAACCCTTCAAACCCTGAGTGCCTGTTGCTCGTGGTGAAGGAGCTGGTGCAGC  175

Query  368  AATATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAGAGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAG  441
            |.||.|||||.|||||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||..|.|||||.
Sbjct  176  AGTACCACCAGTTCCAGTGCGGCCGCCTCCGTGAGAGCTCGCGCCTCATGTTTGAGTACCAGACGCTCCTGGAA  249

Query  442  GAGCCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCG  515
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250  GAGCCTCAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGCTGGAAAGAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCG  323

Query  516  TTTCCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATATCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTG  589
            |||.||.||||||.|.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  TTTTCTATTGAAGTTACCAGTAGATTTCAGCAACATTCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTG  397

Query  590  GAGAAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAGGACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTG  663
            ||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  398  GAGAAGATGTGGCCCTTCTTTCTGTCAGTTTTGAGGATACTGAAGCTACCCAGGTGTACCCCAAGTTGTACTTG  471

Query  664  TCACCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTCAGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCT  737
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  472  TCACCCCGAATTGAGCATGCACTCGGAGGCTCCTCTGCTCTTCACATCCCTGCTTTCCCCGGAGGAGGATGTCT  545

Query  738  CATTGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCACCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAA  811
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  546  CATTGATTATGTGCCTCAAGTGTGCCACCTGCTCACCAACAAGGTACAGTATGTGATTCAAGGCTATCACAAAA  619

Query  812  GAAGAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACA  885
            ||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  620  GAAGAGAGTACATCGCAGCTTTCCTCAGTCACTTTGGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTCACA  693

Query  886  AAACTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTGTTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCG  959
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  694  AAACTTACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGACTTTTGTTTTCTTGTCCACATTGACCTGCCCCTGTTTTTCCCTCG  767

Query  960  AGACCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAA  1033
            |||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  768  AGATCAGCCTACGCTCACATTTCAGTCAGTCTATCACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAAGCACAAA  841

Query 1034  AAAATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAAAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTT  1107
            ||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  AAAACTACCCATACAGCCCCAGATGGGATGGAAATGAAATGGCCAAGAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTT  915

Query 1108  GTCCCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGGAAAGCTC  1149
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  916  GTCCCTCAGTTCCAGGAGGCCGCATTTGCCAATGGAAAGCTC  957