Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02211
• Subject: NR_147240.2
• Aligned Length: 1964
• Identities: 1362
• Gaps: 602

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGGACAAGGCCGGAGCCTGTGTCCGCCCGGCAGCCGCCCGCAGCTGCAGAGAGTCCCGCTGCGTCTCCGCCGCG  74

Query    1  ----------------------------------------------ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGG  28
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCGCCCTCCTCGACCAGCAGACCCGCGCTGCGCTCCGCCGCTGACATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGG  148

Query   29  CGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCCCATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTC  102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCCCATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTC  222

Query  103  GGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTCAACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTG  176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTCAACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTG  296

Query  177  CTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTCATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCC  250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTCATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCC  370

Query  251  ATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACTCTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTT  324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACTCTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTT  444

Query  325  CCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTATATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAA  398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTATATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAA  518

Query  399  GAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGACTCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAG  472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGACTCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAG  592

Query  473  ATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTTGAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAG  546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTTGAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAG  666

Query  547  ACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAATGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAA  620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAATGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAA  740

Query  621  GCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTGATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAA  694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTGATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAA  814

Query  695  CCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGAAGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCC  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGAAGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCC  888

Query  769  AGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGACAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTG  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGACAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTG  962

Query  843  CTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCATCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATT  916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCATCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATT  1036

Query  917  TATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACATGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGAC  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACATGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGAC  1110

Query  991  GTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAGCAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAAT  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAGCAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAAT  1184

Query 1065  TAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGACTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCC  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGACTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCC  1258

Query 1139  TGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATTTGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCA  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATTTGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCA  1332

Query 1213  TCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATATTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCT  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATATTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCT  1406

Query 1287  CTATCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGAAAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAG  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTATCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGAAAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAG  1480

Query 1361  TG------------------------------------------------------------------------  1362
            ||                                                                        
Sbjct 1481  TGTAAGACCCTCGGGCGTCTACAAAGTTCTCCTGGGATTAGCGTGGTTCTGCATCTCCCTTGTGCCCAGGAAAG  1554

Query 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362
                                                                                      
Sbjct 1555  AAACAATTCACTTACCAGCCTCCTCACCCCATCCTCCACCATTTCCTTAATGTTCCATGGTATTTTCAACGGAA  1628

Query 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362
                                                                                      
Sbjct 1629  TACACTTTGAAAGTTCTCAGAATAACTGTAGAATGTGCTGGAAATGGAACATTCTCAGATAAGGAGGAACTGGC  1702

Query 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362
                                                                                      
Sbjct 1703  CAGATCAAACTAAGCTGTGTTCCCATCCCTCCTGAAACAGGATCTTATGGTGCTTTAGCCCAGGACGTCAAGTA  1776

Query 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362
                                                                                      
Sbjct 1777  TCCCCTAGGTATGAAACCCAGAGTGGAGCATGCTTTGAAGGTCCCTCAGCTACATGCAGACTAGACTGCATGTA  1850

Query 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362
                                                                                      
Sbjct 1851  GCTGACTCTAACTGCCCTGGGAAACTATCCTGAGCTTTGACAGACCTGCCATGAATCTTAAGCTTTTATTGTCC  1924

Query 1363  ----------------------------------------  1362
                                                    
Sbjct 1925  CTTGCTGCCTATCTGTGAGGAATAAAGTTGCTTCACTTAC  1964