Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02211
- Subject:
- XM_011519221.1
- Aligned Length:
- 1413
- Identities:
- 1140
- Gaps:
- 273
Alignment
Query 1 ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT 74
Query 297 CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT 148
Query 371 ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC 222
Query 445 TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT 296
Query 519 GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA 370
Query 593 TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG 444
Query 667 ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA 518
Query 741 AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA 592
Query 815 CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA 666
Query 889 TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA 740
Query 963 TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG 814
Query 1037 CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA 888
Query 1111 CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT 962
Query 1185 TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA 1036
Query 1259 TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGA 1110
Query 1333 AAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTG-------------------------------------------- 1362
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTGAAAGAAACAATTCACTTACCAGCCTCCTCACCCCATCCTCCACC 1184
Query 1363 ------- 1362
Sbjct 1185 ATTTCCT 1191