Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02211
• Subject: XM_017015338.1
• Aligned Length: 1530
• Identities: 1172
• Gaps: 351

Alignment

Query    1  ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATA---AGAGAACTGAGCCACCATGAGTTC  219
                                  ||||||   .||.|.|| ||.|..|   ||||    |||     .|||||||
Sbjct    1  ----------------------ATGGTG---GAAACGGT-TGGAGGATGGAGAG----GAG-----GTGAGTTC  39

Query  220  TTCATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCC  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   40  TTCATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCC  113

Query  294  ACTCTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  ACTCTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAG  187

Query  368  TATATACCAGAGTTGT----------------------------------------------------------  383
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct  188  TATATACCAGAGTTGTCACACTTGAGCTTCTGATGTCTGTACTAGTCAAGAAAACCCTGTTTTTTCACAAAGGA  261

Query  384  --------------------------------------------------------CAGGAGAACACTAAAGAA  401
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  262  GGAAACATGGAATGTAAGCAACCTTCTCAAGGTCACGTAGCTAATAACAGGCAAAACAGGAGAACACTAAAGAA  335

Query  402  TGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGACTCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATA  475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  TGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGACTCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATA  409

Query  476  AATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTTGAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  AATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTTGAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACC  483

Query  550  ACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAATGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCC  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  ACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAATGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCC  557

Query  624  CATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTGATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  CATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTGATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCC  631

Query  698  GTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGAAGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGT  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  GTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGAAGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGT  705

Query  772  TATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGACAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTA  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  TATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGACAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTA  779

Query  846  CCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCATCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTAT  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  CCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCATCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTAT  853

Query  920  CGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACATGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTG  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  CGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACATGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTG  927

Query  994  GCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAGCAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAA  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  GCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAGCAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAA  1001

Query 1068  TAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGACTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGG  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  TAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGACTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGG  1075

Query 1142  GGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATTTGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCC  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076  GGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATTTGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCC  1149

Query 1216  GACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATATTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTA  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150  GACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATATTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTA  1223

Query 1290  TCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGAAAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTG-  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1224  TCTAGGAGATGATCGAAATATTGAAGAGGTTTATGTGGGCGGAAAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCAGTGA  1297

Query 1363  --------------------------------------------------  1362
                                                              
Sbjct 1298  AAGAAACAATTCACTTACCAGCCTCCTCACCCCATCCTCCACCATTTCCT  1347