Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02211
• Subject: XM_024447720.1
• Aligned Length: 1409
• Identities: 1325
• Gaps: 76

Alignment

Query    1  ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGTGCCGCTCAGATGCCGCCCCTGGCGCACATCTTCCGAGGGACGTTCGTCCACTCCACCTGGACCTGCCC  74

Query   75  CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGGAGGTGCTGCGGGATCACCTCCTCGGCGTGAGCGACAGCGGCAAAATAGTGTTTTTAGAAGAAGCATCTC  148

Query  149  AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACAGGAAAAACTGGCCAAAGAATGGTGCTTCAAGCCGTGTGAAATAAGAGAACTGAGCCACCATGAGTTCTTC  222

Query  223  ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCCTGGGCTGGTTGATACACACATCCATGCCTCTCAGTATTCCTTTGCTGGAAGTAGCATAGACCTGCCACT  296

Query  297  CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTGGAGTGGCTGACCAAGTACACATTTCCTGCAGAACACAGATTCCAGAACATCGACTTTGCAGAAGAAGTAT  370

Query  371  ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATACCAGAGTTGTCAGGAGAACACTAAAGAATGGAACAACCACAGCTTGTTACTTTGCAACAATTCACACTGAC  444

Query  445  TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCATCTCTGCTCCTTGCCGACATTACAGATAAATTTGGACAGCGGGCATTTGTGGGCAAAGTTTGCATGGATTT  518

Query  519  GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAATGACACTTTTCCAGAATACAAGGAGACCACTGAGGAATCGATCAAGGAAACTGAGAGATTTGTGTCAGAAA  592

Query  593  TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCAAAAGAACTATTCTAGAGTGAAGCCCATAGTGACACCACGTTTTTCCCTCTCCTGCTCTGAGACTTTG  666

Query  667  ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGGTGAACTGGGCAACATTGCTAAAACCCGTGATTTGCACATTCAGAGCCATATAAGTGAAAATCGTGATGA  740

Query  741  AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTGAAGCTGTGAAAAACTTATACCCCAGTTATAAAAACTACACATCTGTGTATGATAAAAACAATCTTTTGA  814

Query  815  CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAAATAAGACAGTGATGGCACACGGCTGCTACCTCTCTGCAGAAGAACTGAACGTATTCCATGAACGAGGAGCA  888

Query  889  TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCATCGCACACTGTCCCAATTCTAATTTATCGCTCAGCAGTGGATTTCTAAATGTGCTAGAAGTCCTGAAACA  962

Query  963  TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAGTCAAGATAGGGCTGGGTACAGACGTGGCTGGTGGCTATTCATATTCCATGCTTGATGCAATCAGAAGAG  1036

Query 1037  CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTGATGGTTTCCAATATCCTTTTAATTAATAAGGTAAATGAGAAAAGCCTCACCCTCAAAGAAGTCTTCAGA  1110

Query 1111  CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTAGCTACTCTTGGAGGAAGCCAAGCCCTGGGGCTGGATGGTGAGATTGGAAACTTTGAAGTGGGCAAGGAATT  1184

Query 1185  TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGATGCCATCCTGATCAACCCCAAAGCATCCGACTCTCCCATTGACCTGTTTTATGGGGACTTTTTTGGTGATA  1258

Query 1259  TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAGATGATCGAAA-TATTGA------AG----------  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|     |||| .|||.|      ||          
Sbjct 1259  TTTCTGAGGCTGTTATCCAGAAGTTCCTCTATCTAGGAAA-----GAAACAATTCACTTACCAGCCTCCTCACC  1327

Query 1316  ------------AGGTTT-----ATG-----TGG--------GCGGAAAGCAGGTGGTTCCGTTTTCCAGCTCA  1359
                        |  |||     |||     |||        .|||||..||..|                   
Sbjct 1328  CCATCCTCCACCA--TTTCCTTAATGTTCCATGGTATTTTCAACGGAATACACTT-------------------  1380

Query 1360  GTG  1362
               
Sbjct 1381  ---  1380