Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02249
- Subject:
- XM_006503006.3
- Aligned Length:
- 1485
- Identities:
- 1249
- Gaps:
- 33
Alignment
Query 1 ATGAAAAAGCGCAAAGAGCTCAATGCATTGATTGGTTTGGCTGGGGACAGCCGGAGAAAGAAGCCCAAGAAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.|||...||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1 ATGAAAAAGCGCAAAGAGCTCAATGCGTTGATCGGCCTGGCTGGTGACCATCGGAGAAAGAAGACCAAGCAAGG 74
Query 75 CCCAAGCAGTCACCGCCTGCTTCGCACTGAGCCTCCCGACTCAGACTCTGAGTCCAGCTCCGAAGAGGAAGAGG 148
|.||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.| |||.|||||||
Sbjct 75 CTCAGGCAGCCACCGCCTGCTTCGCACTGAGCCTCCTGACTCAGACTCAGAGTCCAGCAC---AGACGAAGAGG 145
Query 149 AATTCGGTGTGGTTGGAAATCGCTCTCGCTTTGCCAAGGGAGACTATTTACGATGCTGCAAGATCTGTTATCCG 222
||||.||.|...||||||||||||||||.||||.|||||||||||||...|||||||||||||||||.|.|||.
Sbjct 146 AATTTGGAGCAATTGGAAATCGCTCTCGTTTTGTCAAGGGAGACTATGCCCGATGCTGCAAGATCTGCTGTCCC 219
Query 223 CTCTGTGGTTTTGTCATCCTTGCTGCCTGTGTTGTGGCCTGTGTTGGCTTGGTGTGGATGCAGGTTGCTCTCAA 296
|||||||..|||||||||||.||.|||||.||||||||||.|||.|||||||||||||||||..|.||||||||
Sbjct 220 CTCTGTGCCTTTGTCATCCTCGCAGCCTGCGTTGTGGCCTCTGTGGGCTTGGTGTGGATGCAAATGGCTCTCAA 293
Query 297 GGAGGATCTGGATGCCCTCAAGGAAAAATTTCGAACAATGGAATCTAATCAGAAAAGCTCATTCCAAGAAATCC 370
||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 294 GGAGGATCTGGATGTCCTCAAGGAAAAATTTAGAACAATGGAGTCTAATCAGAAGAGCTCATTCCAGGAAATCC 367
Query 371 CCAAACTTAATGAAGAACTACTCAGCAAGCAAAAACAACTTGAGAAGATTGAATCTGGAGAGATGGGTTTGAAC 444
|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.|.|
Sbjct 368 CCAAACTTAATGAGGAACTTCTCAGCAAACAAAAACAACTTGAGAAGATTGAGTCTGGGGAGCTGGGCTTAAGC 441
Query 445 AAAGTCTGGATAAACATCACAGAAATGAATAAGCAGATTTCTCTGTTGACTTCTGCAGTGAACCACCTCAAAGC 518
|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 442 AGAGTCTGGATCAACATCACAGAAATGAATAAGCAGATTTCTCTCTTGAGTTCTGCAGTAAACCACCTAAAAGC 515
Query 519 CAATGTTAAGTCAGCTGCAGACTTGATTAGCCTGCCTACCACTGTAGAGGGACTTCAGAAGAGTGTAGCTTCCA 592
||..||.||||||||.||||||||..||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 516 CAGCGTCAAGTCAGCCGCAGACTTACTTAGTCTGCCTAGCACTGTAGAAGGACTTCAGAAGAGTGTGGCTTCCA 589
Query 593 TTGGCAATACTTTAAACAGCGTCCATCTTGCTGTGGAAGCACTACAGAAAACTGTGGATGAACACAAGAAAACG 666
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|...|||||||.|||||||||||.||||.||.|||.
Sbjct 590 TTGGCAATACTTTAAACAGTGTCCACCTTGCTGTAGAGGTGATACAGAAGACTGTGGATGAGCACAGGACAACC 663
Query 667 ATGGAATTACTGCAGAGTGATATGAATCAGCACTTCTTGAAGGAGACTCCTGGAAGCAACCAGATCATTCCGTC 740
.|||..|||||||||.|...||| |||||....||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct 664 TTGGGGTTACTGCAGGGCAGTAT------------------GGAGAACAATGGAAGCAACCAGATCTTGCCATC 719
Query 741 ACCTTCAGCCACATCAGAACTTGACAATAAAACCCACAGTGAGAATTTGAAACAGGATATCCTGTACCTTCACA 814
|||||||.|..|||||||.||||||||||||.||||||||||.|.|...||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 720 ACCTTCACCTCCATCAGAGCTTGACAATAAATCCCACAGTGAAAGTGCAAAACAGGATATCCTGTACCTGCACA 793
Query 815 ACTCTTTAGAGGAGGTAAACAGTGCCCTAGTGGGGTACCAGAGACAGAATGATCTTAAACTCGAGGGAATGAAC 888
||||.||||||||.||.||||||.|..||||||..|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||.|
Sbjct 794 ACTCCTTAGAGGAAGTCAACAGTACTGTAGTGGAATACCAGAGACAGAATGACCTTAAACTCAAGGGAATGAGC 867
Query 889 GAGACAGTCAGTAATCTTACCCAGAGAGTCAACCTGATAGAAAGCGATGTGGTTGCTATGAGCAAGGTAGAAAA 962
|||||..|||||||.||.||.||||||.|||.|||||||||||||.||||||||||..|||||||||.||||.|
Sbjct 868 GAGACCCTCAGTAACCTGACACAGAGACTCAGCCTGATAGAAAGCCATGTGGTTGCACTGAGCAAGGCAGAACA 941
Query 963 GAAAGCAAACCTGTCCTTCAGCATGATGGGTGATAGATCTGCCACTCTGAAAAGACAGTCTTTGGATCAAGTCA 1036
||.|.|||||.||..||.|||||.|||||...||||..|||||||||||||||||.|||||||| ||.|
Sbjct 942 GAGAACAAACGTGAGCTCCAGCACGATGGAGAATAGGGCTGCCACTCTGAAAAGAGAGTCTTTG------GTGA 1009
Query 1037 CCAACAGAACAGATACAGTAAAAATCCAAAGCATAAAGAAAGAAGATAGTTCAAATTCTCAGGTATCCAAGCTA 1110
|||||||||..||.||.|||.|....||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1010 CCAACAGAAGTGACACTGTACAGGCGCAAAGCATGAAGAAAGAAGATAATTCAAATTCTCAGGTATCCGAGCTT 1083
Query 1111 AGAGAGAAACTCCAGCTGATCAGTGCTCTTACAAACAAACCTGAGAGCAACAGGCCTCCAGAGACCGCCGATGA 1184
.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1084 CGAGAAAAACTGCAGCTGATCAGTGCTCTCACAAACAAACCTGAAAGCAACAGGCCTCCGGAGACCACAGATGA 1157
Query 1185 AGAGCAAGTAGAGAGTTTCACATCAAAGCCATCAGCATTGCCAAAATTTTCACAGTTTCTTGGAGACCCAGTTG 1258
||||||||||.|||..|||||||||.|.||.||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||.|.|||
Sbjct 1158 AGAGCAAGTACAGAACTTCACATCAGATCCTTCAGCATTGCCAGAATTTTCACAGCTTCTTAGAAACCAAATTG 1231
Query 1259 AGAAAGCTGCCCAACTAAGACCTATCTCCCTACCAGGAGTTTCTAGCACTGAAGATCTTCAGGATTTATTCCGC 1332
||| |||||.|||.||||.|||||||.||.||..|||||||||...|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1232 AGA------CCCAAGTAAAACCTCTCTCCCTGCCTGGGATTTCTAGCATCAAAGATCTTCAGGATTTATTCCAC 1299
Query 1333 AAGACTGGCCAGGACGTGGATGGGAAGCTGACCTACCAGGAAATCTGGACCTCCCTAGGTTCTGCTATGCCAGA 1406
||||||||.||.||.||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||||||..
Sbjct 1300 AAGACTGGTCAAGATGTGGATGGGATGCTGACCTACCAGGAACTCTGGAACTCCCTAGGTTCTGCCATGCCAAG 1373
Query 1407 ACCAGAGAGCTTGAGAGCATTTGATTCCGATGGAGATGGAAGATACTCATTCCTGGAGCTAAGGGTAGCTTTAG 1480
|||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||
Sbjct 1374 ACCAGAGAGCTTGAGAGCATTTGATTCGAATGGAGATGGAAGATACTCTTTCCTGGAACTAAGATTAGCTTTAG 1447
Query 1481 GTATC 1485
|||||
Sbjct 1448 GTATC 1452