Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02255
• Subject: XM_011247034.2
• Aligned Length: 2470
• Identities: 2121
• Gaps: 113

Alignment

Query    1  ATGTCCAAGAAAGGGCGAAATAAGGGCGAGAAGCCCGAGGCACTCATTGTTGCCCTTCAAGCTGCCAATGAAGA  74
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCCAAGAAAGGGCGGAATAAGGGCGAGAAGCCCGAGGCACTCATTGTTGCCCTTCAAGCTGCCAACGAAGA  74

Query   75  CCTCAGGACCAAGCTCACAGACATTCAGATAGAGCTGCATCAAGAGAAGTCCAAGGTATCAAAGCTTGAAAGAG  148
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCAGGACCAAACTCACAGACATCCAGATAGAACTGCATCAAGAGAAATCCAAGGTATCAAAGCTTGAAAGAG  148

Query  149  AGAAGACTCAAGAAGCGAAGAGGATTCGTGAGCTGGAGCAGCGCAAGCACACGGTGCTGGTGACAGAACTCAAA  222
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct  149  AGAAGACTCAAGAAGCAAAGAGGATTCGTGAGTTGGAGCAGCGCAAACACACGGTCCTGGTGACCGAGCTTAAA  222

Query  223  GCCAAGCTCCATGAGGAGAAGATGAAGGAGCTGCAGGCTGTGAGGGAGAACCTTATCAAGCAGCACGAGCAGGA  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GCCAAGCTCCACGAGGAGAAGATGAAGGAGCTGCAGGCCGTGAGGGAGAATCTCATCAAACAGCATGAGCAGGA  296

Query  297  AATGTCAAGGACGGTGAAGGTACGTGATGGAGAGATCCAGAGGCTCAAGTCTGCTCTCTGTGCTCTCCGCGACG  370
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct  297  AATGTCAAGGACAGTGAAGGTGCGGGATGGGGAGATTCAGAGACTCAAGTCCGCGCTGTGTGCTCTCCGGGATG  370

Query  371  GCAGCAGTGACAAAGTAAGGACAGCGCTCACCATTGAGGCCCGGGAGGAGGCCCGGAAACTGTTTGACACAGAG  444
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||..|||||
Sbjct  371  GCAGCAGCGACAAAGTAAGGACAGCACTCACCATTGAGGCCCGGGAGGAGGCCCGGAAACAGTTCGATGCAGAG  444

Query  445  CGCCTTAAGCTCTTACAGGAAATTGCGGACCTGAAAACGGCCAAGAAGCAGGTGGACGAGGCTCTGAGCAATAT  518
            |||||.||||||.|.|||||||||.|.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  CGCCTGAAGCTCCTGCAGGAAATTACAGACTTGAAAACTGCCAAGAAGCAGGTGGATGAGGCTCTAAGCAATAT  518

Query  519  GATCCAAGCAGATAAAATCAAGGCTGGGGACCTTCGGAGTGAGCATCAGTCCCACCAAGAAGCCATCTCGAAGA  592
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  GATCCAAGCGGATAAAATCAAAGCTGGGGACCTTAGGAGTGAGCATCAGTCCCACCAGGAAGCCATCTCGAAGA  592

Query  593  TCAAGTGGGAGTCGGAGCGGGATATTCGGAGGCTGATGGATGAAATCAAAGCCAAGGACAGGATCATCTTTTCC  666
            ||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAAGTGGGAATCCGAACGGGATATACGGAGGCTGATGGATGAAATCAAAGCCAAGGACAGGATCATCTTTTCC  666

Query  667  CTGGAAAAGGAACTGGAGACCCAGACAGGCTATGTACAGAAACTCCAACTTCAGAAGGAGGCTTTGGACGAACA  740
            ||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct  667  CTGGAAAAAGAACTGGAGACTCAGACGGGCTATGTGCAGAAACTCCAGCTTCAGAAGGAGGCTCTGGATGAGCA  740

Query  741  ACTCTTTCTGGTCAAGGAGGCTGAGTGCAACATGAGCAGCCCAAAACGAGAAATTCCAGGAAGGGCAGGTGATG  814
            .|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  741  GCTCTTCCTTGTCAAGGAGGCAGAGTGTAACATGAGCAGTCCGAAGAGAGAGATTCCAGGAAGGGCAGGAGACG  814

Query  815  GTTCCGAACACTGCAGCAGTCCTGATTTGCGAAGAAATCAAAAGAGAATAGCTGAATTGAATGCCACTATAAGA  888
            |.||.||.|||||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||
Sbjct  815  GCTCTGAGCACTGCAGCAGCCCCGACCTGCGAAGAAATCAAAAGAGAATAGCTGAGTTGAACGCCACTATACGA  888

Query  889  AAATTAGAAGACAGGAATACCTTGCTTGGAGATGAACGAAATGAACTGTTAAAACGTGTGCGGGAAACCGAAAA  962
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGTTAGAAGACAGGAACACCTTGCTTGGAGATGAGCGGAATGAGTTGTTAAAACGCGTGCGGGAAACCGAAAA  962

Query  963  GCAATGTAAACCTCTCCTGGAAAGGAACAAGTGCCTCGCCAAGAGAAACGATGAACTGATGGTGTCCTTGCAGC  1036
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  963  ACAATGCAAACCTCTCCTGGAAAGGAACAAGTGCCTAGCCAAGAGAAACGATGAACTGATGGTGTCTTTGCAGC  1036

Query 1037  GCATGGAAGAAAAACTAAAAGCCGTTACCAAGGAAAATTCAGAAATGAGAGAAAAAATAACATCCCATCCACCC  1110
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  GCATGGAAGAGAAACTAAAAGCCGTAACCAAGGAAAATTCAGAAATGAGAGAAAAAATAACATCTCACCCACCT  1110

Query 1111  CTGAAGAAATTAAAATCTCTGAATGACCTCGACCAAGCTAATGAAGAACAAGAAACAGAGTTTCTAAAACTTCA  1184
            .||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  TTGAAGAAACTGAAGTCTCTGAACGACCTTGACCAAGCTAATGAAGAACAAGAGACAGAGTTTCTAAAACTGCA  1184

Query 1185  GGTCATTGAGCAACAGAACATTATTGATGAGCTCACAAGGGACCGAGAAAAGCTCATCCGTAGAAGAAAGCATA  1258
            ||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  GGTCATTGAGCAGCAAAACATCATTGATGAGCTCACAAGGGATCGAGAAAAACTCATCCGTAGAAGAAAGCACA  1258

Query 1259  GAAGAAGTTCCAAGCCAATTAAGAGGCCTGTTTTGGACCCGTTTATTGGCTATGATGAGGACTCTATGGATTCA  1332
            |.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  GGAGAAGCTCGAAACCAATCAAGAGGCCTGTTTTAGATCCGTTCATTGGCTATGACGAGGACTCCATGGATTCA  1332

Query 1333  GAGACATCATCCATGGCCTCATTTAGAACAGACAGAACACCAGCTACTCCTGATGATGACTTGGATGAAAGTTT  1406
            ||.||||||||||||.||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1333  GAAACATCATCCATGACCTCCTTTAGAACAGACCGGACACCTGCTACCCCCGATGATGACCTGGATGAAAGTCT  1406

Query 1407  AGCAGCTGAAGAATCTGAACTAAGATTTCGACAATTAACAAAAGAATATCAGGCCCTCCAAAGAGCATATGCCC  1480
            |||.||||||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCTGCTGAAGAATCTGAGCTACGATTTAGACAACTAACAAAAGAATACCAAGCCCTCCAAAGAGCATATGCCC  1480

Query 1481  TCCTACAGGAGCAGACGGGAGGCATCATCGACGCTGAACGAGAAGCCAAGGCTCAAGAACAGCTCCAAGCAGAG  1554
            ||.|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1481  TCTTGCAGGAACAGACTGGCGGCATCATCGATGCTGAAAGAGAAGCCAAGGCACAAGAGCAGCTCCAGGCAGAG  1554

Query 1555  GTGCTAAGGTATAAAGCCAAAATTGAAGACCTGGAAGCGACTCTGGCTCAGAAAGGGCAGGATTCACACTGGGT  1628
            |||||.|||||.|..||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||||||||||                
Sbjct 1555  GTGCTGAGGTACAGGGCCAAAATCGAAGATCTAGAGGCAACGCTGGCTCAGAAAGGGC----------------  1612

Query 1629  AGAAGATAAACAACTTTTCATTAAGAGAAACCAGGAGCTTTTAGAAAAGATAGAAAAACAGGAGGCAGAAAATC  1702
                                                           |||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1613  -----------------------------------------------AGATAGAGAAGCAGGAAGCAGAGAATC  1639

Query 1703  ACCGGTTACAACAAGAACTACAGGACGCCAGAGACCAGAATGAGCTGCTGGAGTTTCGAAACCTAGAGCTAGAA  1776
            |||||.||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1640  ACCGGCTACAGCAGGAACTTCAGGATGCCAGGGACCAGAATGAGCTGCTGGAGTTTCGCAACCTAGAACTGGAA  1713

Query 1777  GAGAGAGAGAGACGATCCCCTCCATTTAATCTCCAAATTCACCCATTCTCAGATGGTGTGAGTGCTCTACAGAT  1850
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1714  GAGAGAGAGAGGCGATCCCCTCCATTTAATCTACAAATTCACCCCTTCTCAGATGGTGTGAGTGCGCTGCAGAT  1787

Query 1851  CTACTGTATGAAAGAAGGTGTTAAGGATGTGAACATCCCTGATCTCATAAAGCAGCTTGATATCTTGGGTGATA  1924
            ||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||.|
Sbjct 1788  CTACTGCATGAAAGAAGGTGTCAAGGATGTCAACATCCCTGACCTCATAAAGCAGCTTGATATCCTAGGTGACA  1861

Query 1925  ATGGGAATTTAAGAAATGAAGAACAAGTGGCCATAATTCAGGCCAGCACTGTGCTGTCCCTGGCAGAGAAGTGG  1998
            |.|||||..||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1862  ACGGGAACCTAAGGAATGAAGAACAGGTGGCCATTATTCAGGCCAGCACTGTGCTGTCCCTGGCAGAAAAGTGG  1935

Query 1999  ATCCAGCAGATTGAAGGAGCTGAGGCTGCCCTACACCAGAAAATGATGGAATTGGAAAGTGACATGGAACAGTT  2072
            |||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1936  ATCCAACAAATTGAAGGAGCGGAGGCTGCCCTGCACCAGAAAATGATGGAACTGGAAAGTGACATGGAACAGTT  2009

Query 2073  CTGCAAAATAAAAGGCTATCTGGAGGAAGAACTAGACTACAGAAAACAAGCTCTTGACCAAGCATATATGAGAA  2146
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2010  CTGCAAAATCAAAGGCTACCTGGAGGAAGAACTAGACTACAGAAAACAGGCTCTTGACCAGGCATATATGAGAA  2083

Query 2147  TCCAGGAACTAGAAGCTACTTTGTACAATGCTCTACAGCAAGAAACTGTTATCAAGTTTGGTGAATTATTAAGT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||.|.||||||
Sbjct 2084  TCCAGGAACTAGAAGCTACTTTGTACAATGCTCTGCAGCAAGAAACTGTGATCAAATTCGGCGAACTGTTAAGT  2157

Query 2221  GAAAAACAGCAAGAGGAGCTGAGGACGGCAGTAGAAAAGTTACGGCGGCAAATGCTGAGGAAGAGCAGAGAGTA  2294
            ||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 2158  GACAAGCAGCAGGAGGAGCTGAGGACGGCTGTGGAAAAGTTACGGCGGCAAATGCTGAGGAAGAGCCGGGAGTA  2231

Query 2295  TGACTGTCAGATTCTTCAGGAGAGAATGGAGCTCTTACAGCAAGCCCATCAGAGAATTCGTGACTTAGAAGATA  2368
            .|||||||||||.||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 2232  CGACTGTCAGATCCTCCAGGAGAGGATGGAGCTCCTGCAGCAAGCGCACCAGAGAATCCGTGACCTAGAAGATA  2305

Query 2369  AAACAGACATCCAGAAAAGACAAATAAAAGACTTAGAAGAAAAGAGTAACCGAAAACATGGA------------  2430
            |||||||||||||.||..||||.|||||.|||.|||||||||||..|          .||..            
Sbjct 2306  AAACAGACATCCAAAAGCGACAGATAAAGGACCTAGAAGAAAAGTTT----------CTGTTTCTATTCTTGTT  2369

Query 2431  ----------------------------  2430
                                        
Sbjct 2370  CTTCTCTCTTGCCTTCATTCTATGGCCT  2397