Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02266
- Subject:
- XM_011540428.1
- Aligned Length:
- 2090
- Identities:
- 1586
- Gaps:
- 502
Alignment
Query 1 ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT 74
Query 75 GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG 148
Query 149 TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT 222
Query 223 GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG 296
Query 297 GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC 370
Query 371 CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC 444
Query 445 CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA 518
Query 519 AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG 592
Query 593 ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG 666
Query 667 AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA 740
Query 741 GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC 814
Query 815 TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT 888
Query 889 TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA 962
Query 963 GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT 1036
Query 1037 GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT 1110
Query 1111 TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG 1184
Query 1185 GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA 1258
Query 1259 CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT 1332
Query 1333 TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT 1406
Query 1407 AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG 1480
Query 1481 GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT 1554
Query 1555 GTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATC--TCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCAGTATTGGATTAT 1626
||||||||||||||||||||| |.| ||| || ||.||
Sbjct 1555 GTGGAAAGTGCCAACAGTGAG----AGCCGTCC-----------------TC-ATCCA---------------- 1590
Query 1627 CTCTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTG 1700
Sbjct 1591 -------------------------------------------------------------------------- 1590
Query 1701 CCTGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGAACAGCATGCCGTTCAGGAGTTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGG 1774
Sbjct 1591 -------------------------------------------------------------------------- 1590
Query 1775 GCATTGACGGAGAAGTGCTCTCTTACTTGGAATTGGCTCAGTTTCACAATGCCCACCAGTTGGCCGCCTGGTGT 1848
Sbjct 1591 -------------------------------------------------------------------------- 1590
Query 1849 TTGCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCCAAGTTCCGTAAGGAAATCAAATCAAAATCTGCAGA 1922
Sbjct 1591 -------------------------------------------------------------------------- 1590
Query 1923 CAACCAGGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAGAAGATCACTACCAGCGTG 1996
Sbjct 1591 -------------------------------------------------------------------------- 1590
Query 1997 TGAAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCACTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGGTGCTTCTGGAAT 2070
Sbjct 1591 -------------------------------------------------------------------------- 1590
Query 2071 TCATCTCCAGCAGTGGCC 2088
Sbjct 1591 ------------------ 1590