Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02295
• Subject: NM_025662.5
• Aligned Length: 1194
• Identities: 996
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCACCGACAGCCTCA----GCCG--GGCTGC---GACTGTCTTGGCAACTGTGTTGCTCTTGTCCTT  65
            |||||.|.|.||..|..|||||    ||.|  ||||.|   |.|.|.||||||         |||||||||..|
Sbjct    1  ATGGCGGCCCCCTGCTTCCTCACTCTGCGGGTGGCTACCCTGGCCGCCTTGGC---------GCTCTTGTCTCT  65

Query   66  CGGCAGCGTGGCCGCTAGTCATATCGAGGATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGG  139
            |||||||...||||||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct   66  CGGCAGCTCTGCCGCTGGACACATCGAGGATCAAGCCGAACAGTTCTTTAGAAGTGGACACACAAATAACTGGG  139

Query  140  CTGTTCTGGTGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACATGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGT  213
            |||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  140  CTGTTTTGGTGTGCACATCCCGATTCTGGTTTAACTACCGACATGTTGCAAATACTCTTTCTGTTTATAGAAGC  213

Query  214  GTCAAGAGGCTAGGTATTCCTGACAGTCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCCTGTAATCCTAGAAA  287
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||.||.|.||
Sbjct  214  GTCAAGAGGCTAGGTATCCCGGACAGTCACATTGTCCTGATGCTTGCTGATGACATGGCGTGCAATGCTCGGAA  287

Query  288  TCCCAAACCAGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATATGGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATT  361
            .|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  288  CCCCAAGCCAGCCACAGTGTTCAGCCACAAGAACATGGAGCTCAATGTGTATGGAGACGATGTGGAAGTGGACT  361

Query  362  ATAGAAGTTATGAGGTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGAGGATCCCACCTAGTACTCCTCGG  435
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  362  ACAGAAGCTATGAGGTAACTGTGGAGAACTTTTTAAGGGTATTGACCGGGAGGGTTCCACCCAGTACCCCTCGC  435

Query  436  TCAAAACGTCTTCTTTCTGATGACAGAAGCAATATTCTAATTTATATGACAGGGCATGGTGGAAATGGTTTCTT  509
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  436  TCAAAGCGTCTTCTTTCCGACGACAGAAGCAATATCCTCATTTATATGACAGGTCATGGAGGGAATGGTTTCTT  509

Query  510  AAAATTTCAAGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGATGCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGAC  583
            .|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  510  GAAATTCCAAGATTCTGAAGAAATCACCAACATAGAACTTGCAGATGCGTTTGAACAGATGTGGCAGAAGAGAC  583

Query  584  GCTACAATGAGCTACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTTATTCTCCTAAC  657
            |||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct  584  GCTACAATGAGCTGCTGTTCATTATTGACACTTGCCAGGGCGCGTCCATGTACGAGCGGTTCTACTCTCCTAAC  657

Query  658  ATAATGGCTCTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCACTCTCGCATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCA  731
            ||.|||||..|.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  658  ATCATGGCCTTGGCTAGTAGCCAGGTGGGAGAGGATTCGCTGTCGCACCAGCCTGACCCTGCGATTGGAGTTCA  731

Query  732  TCTTATGGATAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAGCTAGCCAAACTAATATGA  805
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  732  TCTTATGGATAGGTACACGTTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAATCCAGCTAGCCAAACTAACATGA  805

Query  806  ATGACCTTTTTCAGGTATGTCCCAAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAGG  879
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.
Sbjct  806  ACGACCTTTTTCAAGTGTGTCCCAAAAGTCTCTGTGTGTCGACCCCTGGACATCGCACTGACCTTTTCCAGCGA  879

Query  880  GATCCTAAAAATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAGTGGAAATTACAACAGAGACTATTAA  953
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||..||.|.
Sbjct  880  GATCCAAAAAATGTCCTGATCACCGATTTCTTCGGAAGTGTGCGCAAGGTGGAAATCACAACAGAGAAGATCAG  953

Query  954  ATTGCAACAGGATTCAGAAATCATGGAAAGCAGCTATAAGGAAGACCAGATGGATGAGAAACTAATGGAACCTC  1027
            .|||||...|||||||.||.||.||||.|||||.|.|||.||||||...|.||..|||.|.|..||||.|||||
Sbjct  954  TTTGCAGTGGGATTCACAAGTCGTGGACAGCAGTTCTAAAGAAGACGGCACGGCCGAGGAGCGCATGGGACCTC  1027

Query 1028  TGAAATATGCTGAACAACTTCCTGTAGCTCAGATAATACACCAGAAACCGAAGCTGAAAGACTGGCATCCTCCT  1101
            |.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||.||.|||||||||.|||||.
Sbjct 1028  TCAAGTATGCTGAGCAGCTCCCGGTGGCTCAGATAATACACCAGAAGCCAAAGCCGAGAGACTGGCACCCTCCC  1101

Query 1102  GGGGGCTTTATTCTGGGATTATGGGCACTTATTATCATGGTTTTCTTCAAAACTTATGGAATTAAGCATATGAA  1175
            ||.|||||.||.|||||..|.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1102  GGAGGCTTCATCCTGGGGCTGTGGGCGCTCATCATCATGGTCTTCTTCAAGACCTATGGGATCAAGCATATGAA  1175

Query 1176  GTTCATTTTT  1185
            |||||||||.
Sbjct 1176  GTTCATTTTC  1185