Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02317
• Subject: NM_016276.3
• Aligned Length: 1281
• Identities: 1101
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCAGGGGTTGCTTACCTCGGGTAGGAAACCCTCAGGCGGTGGCAGGTGCACAGGTAGGGGAGGATGGAGAGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCAGTGGTGCCTGAAGCCCTGGATGGGCGGAGCTGACCCCCCAACACCAACTCTCTCATGCCTGCTCCTCCCTG  148

Query    1  --------------------------------ATGAACTCTAGCCCAGCTGGGACCCCAAGTCCACAGCCCTCC  42
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCCCCCAGAGCTGCCTGATCATTGCTACAGAATGAACTCTAGCCCAGCTGGGACCCCAAGTCCACAGCCCTCC  222

Query   43  AGGGCCAATGGGAACATCAACCTGGGGCCTTCAGCCAACCCAAATGCCCAGCCCACGGACTTCGACTTCCTCAA  116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGGCCAATGGGAACATCAACCTGGGGCCTTCAGCCAACCCAAATGCCCAGCCCACGGACTTCGACTTCCTCAA  296

Query  117  AGTCATCGGCAAAGGGAACTACGGGAAGGTCCTACTGGCCAAGCGCAAGTCTGATGGGGCGTTCTATGCAGTGA  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTCATCGGCAAAGGGAACTACGGGAAGGTCCTACTGGCCAAGCGCAAGTCTGATGGGGCGTTCTATGCAGTGA  370

Query  191  AGGTACTACAGAAAAAGTCCATCTTAAAGAAGAAAGAGCAGAGCCACATCATGGCAGAGCGCAGTGTGCTTCTG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTACTACAGAAAAAGTCCATCTTAAAGAAGAAAGAGCAGAGCCACATCATGGCAGAGCGCAGTGTGCTTCTG  444

Query  265  AAGAACGTGCGGCACCCCTTCCTCGTGGGCCTGCGCTACTCCTTCCAGACACCTGAGAAGCTCTACTTCGTGCT  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAACGTGCGGCACCCCTTCCTCGTGGGCCTGCGCTACTCCTTCCAGACACCTGAGAAGCTCTACTTCGTGCT  518

Query  339  CGACTATGTCAACGGGGGAGAGCTCTTCTTCCACCTGCAGCGGGAGCGCCGGTTCCTGGAGCCCCGGGCCAGGT  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGACTATGTCAACGGGGGAGAGCTCTTCTTCCACCTGCAGCGGGAGCGCCGGTTCCTGGAGCCCCGGGCCAGGT  592

Query  413  TCTACGCTGCTGAGGTGGCCAGCGCCATTGGCTACCTGCACTCCCTCAACATCATTTACAGGGATCTGAAACCA  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTACGCTGCTGAGGTGGCCAGCGCCATTGGCTACCTGCACTCCCTCAACATCATTTACAGGGATCTGAAACCA  666

Query  487  GAGAACATTCTCTTGGACTGCCAGGGACACGTGGTGCTGACGGATTTTGGCCTCTGCAAGGAAGGTGTAGAGCC  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAACATTCTCTTGGACTGCCAGGGACACGTGGTGCTGACGGATTTTGGCCTCTGCAAGGAAGGTGTAGAGCC  740

Query  561  TGAAGACACCACATCCACATTCTGTGGTACCCCTGAGTACTTGGCACCTGAAGTGCTTCGGAAAGAGCCTTATG  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAGACACCACATCCACATTCTGTGGTACCCCTGAGTACTTGGCACCTGAAGTGCTTCGGAAAGAGCCTTATG  814

Query  635  ATCGAGCAGTGGACTGGTGGTGCTTGGGGGCAGTCCTCTACGAGATGCTCCATGGCCTGCCGCCCTTCTACAGC  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCGAGCAGTGGACTGGTGGTGCTTGGGGGCAGTCCTCTACGAGATGCTCCATGGCCTGCCGCCCTTCTACAGC  888

Query  709  CAAGATGTATCCCAGATGTATGAGAACATTCTGCACCAGCCGCTACAGATCCCCGGAGGCCGGACAGTGGCCGC  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGATGTATCCCAGATGTATGAGAACATTCTGCACCAGCCGCTACAGATCCCCGGAGGCCGGACAGTGGCCGC  962

Query  783  CTGTGACCTCCTGCAAAGCCTTCTCCACAAGGACCAGAGGCAGCGGCTGGGCTCCAAAGCAGACTTTCTTGAGA  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGTGACCTCCTGCAAAGCCTTCTCCACAAGGACCAGAGGCAGCGGCTGGGCTCCAAAGCAGACTTTCTTGAGA  1036

Query  857  TTAAGAACCATGTATTCTTCAGCCCCATAAACTGGGATGACCTGTACCACAAGAGGCTAACTCCACCCTTCAAC  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTAAGAACCATGTATTCTTCAGCCCCATAAACTGGGATGACCTGTACCACAAGAGGCTAACTCCACCCTTCAAC  1110

Query  931  CCAAATGTGACAGGACCTGCTGACTTGAAGCATTTTGACCCAGAGTTCACCCAGGAAGCTGTGTCCAAGTCCAT  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAAATGTGACAGGACCTGCTGACTTGAAGCATTTTGACCCAGAGTTCACCCAGGAAGCTGTGTCCAAGTCCAT  1184

Query 1005  TGGCTGTACCCCTGACACTGTGGCCAGCAGCTCTGGGGCCTCAAGTGCATTCCTGGGATTTTCTTATGCGCCAG  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGCTGTACCCCTGACACTGTGGCCAGCAGCTCTGGGGCCTCAAGTGCATTCCTGGGATTTTCTTATGCGCCAG  1258

Query 1079  AGGATGATGACATCTTGGATTGC  1101
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGATGATGACATCTTGGATTGC  1281