Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02319
• Subject: NM_001330485.1
• Aligned Length: 1251
• Identities: 1077
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGGGCCGGCGCCGGGCGCCAGAGCTGTACCGGGCTCCGTTCCCGTTGTACGCGCTTCAGGTCGACCCCAGCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCGGCGCCGGGCGCCAGAGCTGTACCGGGCTCCGTTCCCGTTGTACGCGCTTCAGGTCGACCCCAGCAC  74

Query   75  TGGGCTGCTCATCGCTGCGGGCGGAGGAGGCGCCGCCAAGACAGGCATAAAGAATGGCGTGCACTTTCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGCTGCTCATCGCTGCGGGCGGAGGAGGCGCCGCCAAGACAGGCATAAAGAATGGCGTGCACTTTCTGCAGC  148

Query  149  TAGAGCTGATTAATGGGCGCTTGAGTGCCTCCTTGCTGCACTCCCATGACACAGAGACACGGGCCACCATGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGAGCTGATTAATGGGCGCTTGAGTGCCTCCTTGCTGCACTCCCATGACACAGAGACACGGGCCACCATGAAC  222

Query  223  TTGGCACTGGCTGGTGACATCCTTGCTGCAGGGCAGGATGCCCACTGTCAGCTCCTGCGCTTCCAGGCACATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGCACTGGCTGGTGACATCCTTGCTGCAGGGCAGGATGCCCACTGTCAGCTCCTGCGCTTCCAGGCACATCA  296

Query  297  ACAGCAGGGCAACAAGGCAGAGAAGGCCGGTTCCAAGGAGCAGGGGCCTCGACAAAGGAAGGGAGCAGCCCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAGCAGGGCAACAAGGCAGAGAAGGCCGGTTCCAAGGAGCAGGGGCCTCGACAAAGGAAGGGAGCAGCCCCAG  370

Query  371  CAGAGAAGAAATGTGGAGCGGAAACCCAGCACGAGGGGCTAGAACTCAGGGTAGAGAATTTGCAGGCGGTGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAGAAGAAATGTGGAGCGGAAACCCAGCACGAGGGGCTAGAACTCAGGGTAGAGAATTTGCAGGCGGTGCAG  444

Query  445  ACAGACTTTAGCTCCGATCCACTGCAGAAAGTTGTGTGCTTCAACCACGATAATACCCTGCTTGCCACTGGAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACAGACTTTAGCTCCGATCCACTGCAGAAAGTTGTGTGCTTCAACCACGATAATACCCTGCTTGCCACTGGAGG  518

Query  519  AACAGATGGCTACGTCCGTGTCTGGAAGGTGCCCAGCCTGGAGAAGGTTCTGGAGTTCAAAGCCCACGAAGGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACAGATGGCTACGTCCGTGTCTGGAAGGTGCCCAGCCTGGAGAAGGTTCTGGAGTTCAAAGCCCACGAAGGGG  592

Query  593  AGATTGAAGACCTGGCTTTAGGGCCTGATGGCAAGTTGGTAACCGTGGGCCGGGACCTTAAGGCCTCTGTGTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATTGAAGACCTGGCTTTAGGGCCTGATGGCAAGTTGGTAACCGTGGGCCGGGACCTTAAGGCCTCTGTGTGG  666

Query  667  CAGAAGGATCAGCTGGTGACACAGCTGCACTGGCAAGAAAATGGACCCACCTTTTCCAGCACACCTTACCGCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAAGGATCAGCTGGTGACACAGCTGCACTGGCAAGAAAATGGACCCACCTTTTCCAGCACACCTTACCGCTA  740

Query  741  CCAGGCCTGCAGGTTTGGGCAGGTTCCAGACCAGCCTGCTGGCCTGCGACTCTTCACAGTGCAAATTCCCCACA  814
            |||||||||                                                                 
Sbjct  741  CCAGGCCTG-----------------------------------------------------------------  749

Query  815  AGCGCCTGCGCCAGCCCCCTCCCTGCTACCTCACAGCCTGGGATGGCTCCAACTTCTTGCCCCTTCGGACCAAG  888
                                                                                      
Sbjct  750  --------------------------------------------------------------------------  749

Query  889  TCCTGTGGCCATGAAGTCGTCTCCTGCCTCGATGTCAGTGAATCCGGCACCTTCCTAGGCCTGGGCACAGTCAC  962
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  750  -----------------------------------CAGTGAATCCGGCACCTTCCTAGGCCTGGGCACAGTCAC  788

Query  963  TGGCTCTGTTGCCATCTACATAGCTTTCTCTCTCCAGTGCCTCTACTACGTGAGGGAGGCCCATGGCATTGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  TGGCTCTGTTGCCATCTACATAGCTTTCTCTCTCCAGTGCCTCTACTACGTGAGGGAGGCCCATGGCATTGTGG  862

Query 1037  TGACGGATGTGGCCTTTCTACCTGAGAAGGGTCGTGGTCCAGAGCTCCTTGGGTCCCATGAAACTGCCCTGTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  TGACGGATGTGGCCTTTCTACCTGAGAAGGGTCGTGGTCCAGAGCTCCTTGGGTCCCATGAAACTGCCCTGTTC  936

Query 1111  TCTGTGGCTGTGGACAGTCGTTGCCAGCTGCATCTGTTGCCCTCACGGCGGAGTGTTCCTGTGTGGCTCCTGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  937  TCTGTGGCTGTGGACAGTCGTTGCCAGCTGCATCTGTTGCCCTCACGGCGGAGTGTTCCTGTGTGGCTCCTGCT  1010

Query 1185  CCTGCTGTGTGTCGGGCTTATTATTGTGACCATCCTGCTGCTCCAGAGTGCCTTTCCAGGTTTCCTT  1251
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  CCTGCTGTGTGTCGGGCTTATTATTGTGACCATCCTGCTGCTCCAGAGTGCCTTTCCAGGTTTCCTT  1077