Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02378
Subject:
NM_019719.3
Aligned Length:
912
Identities:
809
Gaps:
3

Alignment

Query   1  ATGAAGGGCAAGGAGGAGAAGGAGGGCGGCGCACGGCTGGGC---GCTGGCGGCGGAAGCCCCGAGAAGAGCCC  71
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Sbjct   1  ATGAAGGGCAAGGAGGAAAAGGAGGGCGGCGCGCGGCTGGGCACTGGTGGCGGCGGCAGCCCTGATAAGAGCCC  74

Query  72  GAGCGCGCAGGAGCTCAAGGAGCAGGGCAATCGTCTGTTCGTGGGCCGAAAGTACCCGGAGGCGGCGGCCTGCT  145
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Sbjct  75  GAGTGCGCAAGAGCTCAAGGAGCAGGGAAACCGGCTCTTCGTGGGCCGCAAGTACCCGGAGGCGGCGGCCTGCT  148

Query 146  ACGGCCGCGCGATCACCCGGAACCCGCTGGTGGCCGTGTATTACACCAACCGGGCCTTGTGCTACCTGAAGATG  219
           ||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 149  ACGGCCGCGCCATCACTCGGAACCCACTTGTGGCAGTGTACTACACTAACCGGGCCCTGTGCTATCTGAAGATG  222

Query 220  CAGCAGCACGAGCAGGCCCTGGCCGACTGCCGGCGCGCCCTGGAGCTGGACGGGCAGTCTGTGAAGGCGCACTT  293
           |||||||..||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CAGCAGCCTGAACAGGCACTTGCTGACTGCCGGCGAGCCCTGGAGCTGGACGGGCAGTCTGTGAAGGCGCACTT  296

Query 294  CTTCCTGGGGCAGTGCCAGCTGGAGATGGAGAGCTATGATGAGGCCATCGCCAATCTGCAGCGAGCTTACAGCC  367
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||..
Sbjct 297  CTTCCTGGGGCAGTGCCAGCTGGAGATGGAGAGTTATGATGAGGCCATTGCCAATCTGCAGCGAGCCTATAGTT  370

Query 368  TGGCCAAGGAGCAGCGGCTGAACTTCGGGGACGACATCCCCAGCGCTCTTCGAATCGCGAAGAAGAAGCGCTGG  441
           ||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 371  TGGCCAAGGAGCAGCGACTCAACTTTGGGGATGATATTCCTAGTGCCCTTCGCATTGCTAAGAAGAAGCGCTGG  444

Query 442  AACAGCATTGAGGAGCGGCGCATCCACCAGGAGAGCGAGCTGCACTCCTACCTCTCCAGGCTCATTGCCGCGGA  515
           |||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||.|||||||||||||.||.||
Sbjct 445  AACAGTATCGAGGAACGGCGCATCCACCAGGAGAGTGAGCTGCATTCATATCTCACCAGGCTCATTGCTGCTGA  518

Query 516  GCGTGAGAGGGAGCTGGAAGAGTGCCAGCGAAACCACGAGGGTGATGAGGACGACAGCCACGTCCGGGCCCAGC  589
           |||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.||.||..|||||.||||||||||||
Sbjct 519  GCGAGAGAGGGAACTGGAGGAGTGTCAGCGGAACCACGAGGGTCATGAAGATGATGGCCACATCCGGGCCCAGC  592

Query 590  AGGCCTGCATTGAGGCCAAGCACGACAAGTACATGGCGGACATGGACGAGCTTTTTTCTCAGGTGGATGAGAAG  663
           |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 593  AGGCCTGCATTGAGGCCAAGCACGATAAATACATGGCAGATATGGATGAGCTCTTCTCTCAGGTGGACGAGAAA  666

Query 664  AGGAAGAAGCGAGACATCCCCGACTACCTGTGTGGCAAGATCAGCTTTGAGCTGATGCGGGAGCCGTGCATCAC  737
           ||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 667  AGAAAGAAGCGAGATATCCCTGACTACTTGTGTGGCAAGATTAGCTTTGAGCTGATGCGGGAACCCTGCATTAC  740

Query 738  GCCCAGTGGCATCACCTACGACCGCAAGGACATCGAGGAGCACCTGCAGCGTGTGGGTCATTTTGACCCCGTGA  811
           .||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 741  ACCCAGTGGTATCACCTATGACCGCAAGGACATTGAGGAGCACCTGCAGCGTGTGGGCCACTTTGACCCTGTGA  814

Query 812  CCCGGAGCCCCCTGACCCAGGAACAGCTCATCCCCAACTTGGCTATGAAGGAGGTTATTGACGCATTCATCTCT  885
           ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 815  CCCGGAGCCCTCTGACCCAGGAACAGCTCATCCCCAACTTGGCCATGAAGGAAGTCATTGACGCTTTCATCTCT  888

Query 886  GAGAATGGCTGGGTGGAGGACTAC  909
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Sbjct 889  GAGAACGGCTGGGTAGAGGACTAT  912