Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02398
• Subject: NM_001190984.1
• Aligned Length: 1197
• Identities: 1046
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCTCAAAGGGCCTTCCCGAATCCTTATGCTGATTATAACAAATCCCTGGCCGAAGGCTACTTTGATGCTGC  74
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||..||||||||||.||.|
Sbjct    1  ATGGCTCAGAGGGCCTTTCCGAATCCTTATGCCGATTATAACAAGTCGCTGGCCGAAAACTACTTTGATTCTAC  74

Query   75  CGGGAGGCTGACTCCTGAGTTCTCACAACGCTTGACCAATAAGATTCGGGAGCTTCTTCAGCAAATGGAGAGAG  148
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGAGGCTGACTCCTGAGTTCTCACATCGCTTGACCAATAAGATCCGAGAGCTCCTTCAGCAAATGGAGAGAG  148

Query  149  GCCTGAAATCAGCAGACCCTCGGGATGGCACCGGTTACACTGGCTGGGCAGGTATTGCTGTGCTTTACTTACAT  222
            ||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||.
Sbjct  149  GCCTAAAGTCTGCAGACCCTCGGGATGGCACTGGGTACACTGGCTGGGCAGGCATCGCTGTGCTTTACCTCCAC  222

Query  223  CTTTATGATGTATTTGGGGACCCTGCCTACCTACAGTTAGCACATGGCTATGTAAAGCAAAGTCTGAACTGCTT  296
            ||..|..||||.|||||||||||.|||||.||||||.|.||.||..||||||||||||||||.||.|||||..|
Sbjct  223  CTCCACAATGTGTTTGGGGACCCAGCCTATCTACAGATGGCGCACAGCTATGTAAAGCAAAGCCTCAACTGTCT  296

Query  297  AACCAAGCGCTCCATCACCTTCCTTTGTGGGGATGCAGGCCCCCTGGCAGTGGCCGCTGTGCTATATCACAAGA  370
            .|.||.|||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GAGCAGGCGTTCCATCACCTTCCTGTGTGGCGATGCGGGCCCCCTGGCTGTGGCTGCTGTGCTGTACCACAAGA  370

Query  371  TGAACAATGAGAAGCAGGCAGAAGATTGCATCACACGGCTAATTCACCTAAATAAGATTGATCCTCATGCTCCA  444
            ||||||.||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|..|||
Sbjct  371  TGAACAGTGAGAAGCAGGCCGAGGAGTGCATCACACGGCTCATTCACCTAAATAAGATTGATCCCCACGTACCA  444

Query  445  AATGAAATGCTCTATGGGCGAATAGGCTACATCTATGCTCTTCTTTTTGTCAATAAGAACTTTGGAGTGGAAAA  518
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct  445  AATGAAATGCTCTATGGCCGCATAGGCTACATCTTTGCTCTGCTTTTTGTCAATAAGAACTTTGGAGAGGAGAA  518

Query  519  GATTCCTCAAAGCCATATTCAGCAGATTTGTGAAACAATTTTAACCTCTGGAGAAAACCTAGCTAGGAAGAGAA  592
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||.|||||||||.||||.|||||||
Sbjct  519  GATTCCTCAGAGCCATATTCAGCAGATTTGTGAAAACATCTTAACCTCTGGGGAAAACCTATCTAGAAAGAGAA  592

Query  593  ACTTCACGGCAAAGTCTCCACTGATGTATGAATGGTACCAGGAATATTATGTAGGGGCTGCTCATGGCCTGGCT  666
            ||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.||||.
Sbjct  593  ACTTGGCGGCAAAGTCTCCACTGATGTATGAGTGGTACCAGGAATATTACGTGGGGGCTGCTCATGGCTTGGCA  666

Query  667  GGAATTTATTACTACCTGATGCAGCCCAGCCTTCAAGTGAGCCAAGGGAAGTTACATAGTTTGGTCAAGCCCAG  740
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GGCATTTATTACTACCTGATGCAGCCCAGCCTTCAGGTGAACCAAGGAAAGTTGCATAGTTTGGTGAAGCCCAG  740

Query  741  TGTAGACTACGTCTGCCAGCTGAAATTCCCTTCTGGCAATTACCCTCCATGTATAGGTGATAATCGAGATCTGC  814
            ||||||||..|||||||.||||||.||.|||||.||||||||||||||||||.|.|.|||||...||||.||||
Sbjct  741  TGTAGACTTTGTCTGCCGGCTGAAGTTTCCTTCCGGCAATTACCCTCCATGTTTGGATGATACCAGAGACCTGC  814

Query  815  TTGTCCATTGGTGCCATGGCGCCCCTGGGGTAATCTACATGCTCATCCAGGCCTATAAGGTATTCAGAGAGGAA  888
            ||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||.|||.||.
Sbjct  815  TTGTCCATTGGTGCCACGGTGCTCCTGGGGTCATCTATATGCTCATCCAAGCATACAAGGTGTTCAAAGAAGAG  888

Query  889  AAGTATCTCTGTGATGCCTATCAGTGTGCTGATGTGATCTGGCAATATGGGTTGCTGAAGAAGGGATATGGGCT  962
            ...||.||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  CGTTACCTGTGTGATGCCCAGCAGTGTGCTGACGTGATCTGGCAGTACGGGCTACTGAAGAAGGGCTACGGGCT  962

Query  963  GTGCCACGGTTCTGCAGGGAATGCCTATGCCTTCCTGACACTCTACAACCTCACACAGGACATGAAGTACCTGT  1036
            ||||||.|||.||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||..|||||||.||||
Sbjct  963  GTGCCATGGTGCTGCAGGGAATGCCTACGCTTTCCTGGCACTCTACAACCTCACACAGGATCTGAAGTATCTGT  1036

Query 1037  ATAGGGCCTGTAAGTTTGCTGAATGGTGCTTAGAGTATGGAGAACATGGATGCAGAACACCAGACACCCCTTTC  1110
            |.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||.|.||||||||.|||
Sbjct 1037  ACAGGGCCTGCAAGTTTGCTGAGTGGTGCTTAGACTACGGGGAGCACGGATGCAGGACAGCGGACACCCCCTTC  1110

Query 1111  TCTCTCTTTGAAGGAATGGCTGGAACAATATATTTCCTGGCTGACCTGCTAGTCCCCACAAAAGCCAGGTTCCC  1184
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1111  TCCCTCTTTGAAGGGATGGCTGGAACAATATATTTCTTGGCTGACCTGTTAGTCCCCACAAAGGCCAAGTTCCC  1184

Query 1185  TGCATTTGAACTC  1197
            |||||||||||||
Sbjct 1185  TGCATTTGAACTC  1197