Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02398
• Subject: XM_005246243.2
• Aligned Length: 1233
• Identities: 1197
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGGCTCAAAGGGCCTTCCCGAATCCTTATGCTGATTA  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCTAATATGTACCAGGCTTGCTTCCGGCGTCATGGCTCAAAGGGCCTTCCCGAATCCTTATGCTGATTA  74

Query   39  TAACAAATCCCTGGCCGAAGGCTACTTTGATGCTGCCGGGAGGCTGACTCCTGAGTTCTCACAACGCTTGACCA  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAACAAATCCCTGGCCGAAGGCTACTTTGATGCTGCCGGGAGGCTGACTCCTGAGTTCTCACAACGCTTGACCA  148

Query  113  ATAAGATTCGGGAGCTTCTTCAGCAAATGGAGAGAGGCCTGAAATCAGCAGACCCTCGGGATGGCACCGGTTAC  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAAGATTCGGGAGCTTCTTCAGCAAATGGAGAGAGGCCTGAAATCAGCAGACCCTCGGGATGGCACCGGTTAC  222

Query  187  ACTGGCTGGGCAGGTATTGCTGTGCTTTACTTACATCTTTATGATGTATTTGGGGACCCTGCCTACCTACAGTT  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGGCTGGGCAGGTATTGCTGTGCTTTACTTACATCTTTATGATGTATTTGGGGACCCTGCCTACCTACAGTT  296

Query  261  AGCACATGGCTATGTAAAGCAAAGTCTGAACTGCTTAACCAAGCGCTCCATCACCTTCCTTTGTGGGGATGCAG  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCACATGGCTATGTAAAGCAAAGTCTGAACTGCTTAACCAAGCGCTCCATCACCTTCCTTTGTGGGGATGCAG  370

Query  335  GCCCCCTGGCAGTGGCCGCTGTGCTATATCACAAGATGAACAATGAGAAGCAGGCAGAAGATTGCATCACACGG  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCCCCTGGCAGTGGCCGCTGTGCTATATCACAAGATGAACAATGAGAAGCAGGCAGAAGATTGCATCACACGG  444

Query  409  CTAATTCACCTAAATAAGATTGATCCTCATGCTCCAAATGAAATGCTCTATGGGCGAATAGGCTACATCTATGC  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTAATTCACCTAAATAAGATTGATCCTCATGCTCCAAATGAAATGCTCTATGGGCGAATAGGCTACATCTATGC  518

Query  483  TCTTCTTTTTGTCAATAAGAACTTTGGAGTGGAAAAGATTCCTCAAAGCCATATTCAGCAGATTTGTGAAACAA  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTTCTTTTTGTCAATAAGAACTTTGGAGTGGAAAAGATTCCTCAAAGCCATATTCAGCAGATTTGTGAAACAA  592

Query  557  TTTTAACCTCTGGAGAAAACCTAGCTAGGAAGAGAAACTTCACGGCAAAGTCTCCACTGATGTATGAATGGTAC  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTAACCTCTGGAGAAAACCTAGCTAGGAAGAGAAACTTCACGGCAAAGTCTCCACTGATGTATGAATGGTAC  666

Query  631  CAGGAATATTATGTAGGGGCTGCTCATGGCCTGGCTGGAATTTATTACTACCTGATGCAGCCCAGCCTTCAAGT  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGAATATTATGTAGGGGCTGCTCATGGCCTGGCTGGAATTTATTACTACCTGATGCAGCCCAGCCTTCAAGT  740

Query  705  GAGCCAAGGGAAGTTACATAGTTTGGTCAAGCCCAGTGTAGACTACGTCTGCCAGCTGAAATTCCCTTCTGGCA  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCCAAGGGAAGTTACATAGTTTGGTCAAGCCCAGTGTAGACTACGTCTGCCAGCTGAAATTCCCTTCTGGCA  814

Query  779  ATTACCCTCCATGTATAGGTGATAATCGAGATCTGCTTGTCCATTGGTGCCATGGCGCCCCTGGGGTAATCTAC  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTACCCTCCATGTATAGGTGATAATCGAGATCTGCTTGTCCATTGGTGCCATGGCGCCCCTGGGGTAATCTAC  888

Query  853  ATGCTCATCCAGGCCTATAAGGTATTCAGAGAGGAAAAGTATCTCTGTGATGCCTATCAGTGTGCTGATGTGAT  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGCTCATCCAGGCCTATAAGGTATTCAGAGAGGAAAAGTATCTCTGTGATGCCTATCAGTGTGCTGATGTGAT  962

Query  927  CTGGCAATATGGGTTGCTGAAGAAGGGATATGGGCTGTGCCACGGTTCTGCAGGGAATGCCTATGCCTTCCTGA  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGGCAATATGGGTTGCTGAAGAAGGGATATGGGCTGTGCCACGGTTCTGCAGGGAATGCCTATGCCTTCCTGA  1036

Query 1001  CACTCTACAACCTCACACAGGACATGAAGTACCTGTATAGGGCCTGTAAGTTTGCTGAATGGTGCTTAGAGTAT  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACTCTACAACCTCACACAGGACATGAAGTACCTGTATAGGGCCTGTAAGTTTGCTGAATGGTGCTTAGAGTAT  1110

Query 1075  GGAGAACATGGATGCAGAACACCAGACACCCCTTTCTCTCTCTTTGAAGGAATGGCTGGAACAATATATTTCCT  1148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAGAACATGGATGCAGAACACCAGACACCCCTTTCTCTCTCTTTGAAGGAATGGCTGGAACAATATATTTCCT  1184

Query 1149  GGCTGACCTGCTAGTCCCCACAAAAGCCAGGTTCCCTGCATTTGAACTC  1197
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTGACCTGCTAGTCCCCACAAAAGCCAGGTTCCCTGCATTTGAACTC  1233