Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02398
• Subject: XM_011238435.2
• Aligned Length: 1197
• Identities: 922
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ATGGCTCAAAGGGCCTTCCCGAATCCTTATGCTGATTATAACAAATCCCTGGCCGAAGGCTACTTTGATGCTGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGGAGGCTGACTCCTGAGTTCTCACAACGCTTGACCAATAAGATTCGGGAGCTTCTTCAGCAAATGGAGAGAG  148
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------ATGGAGAGAG  10

Query  149  GCCTGAAATCAGCAGACCCTCGGGATGGCACCGGTTACACTGGCTGGGCAGGTATTGCTGTGCTTTACTTACAT  222
            ||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||.
Sbjct   11  GCCTAAAGTCTGCAGACCCTCGGGATGGCACTGGGTACACTGGCTGGGCAGGCATCGCTGTGCTTTACCTCCAC  84

Query  223  CTTTATGATGTATTTGGGGACCCTGCCTACCTACAGTTAGCACATGGCTATGTAAAGCAAAGTCTGAACTGCTT  296
            ||..|..||||.|||||||||||.|||||.||||||.|.||.||..||||||||||||||||.||.|||||..|
Sbjct   85  CTCCACAATGTGTTTGGGGACCCAGCCTATCTACAGATGGCGCACAGCTATGTAAAGCAAAGCCTCAACTGTCT  158

Query  297  AACCAAGCGCTCCATCACCTTCCTTTGTGGGGATGCAGGCCCCCTGGCAGTGGCCGCTGTGCTATATCACAAGA  370
            .|.||.|||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  159  GAGCAGGCGTTCCATCACCTTCCTGTGTGGCGATGCGGGCCCCCTGGCTGTGGCTGCTGTGCTGTACCACAAGA  232

Query  371  TGAACAATGAGAAGCAGGCAGAAGATTGCATCACACGGCTAATTCACCTAAATAAGATTGATCCTCATGCTCCA  444
            ||||||.||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|..|||
Sbjct  233  TGAACAGTGAGAAGCAGGCCGAGGAGTGCATCACACGGCTCATTCACCTAAATAAGATTGATCCCCACGTACCA  306

Query  445  AATGAAATGCTCTATGGGCGAATAGGCTACATCTATGCTCTTCTTTTTGTCAATAAGAACTTTGGAGTGGAAAA  518
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct  307  AATGAAATGCTCTATGGCCGCATAGGCTACATCTTTGCTCTGCTTTTTGTCAATAAGAACTTTGGAGAGGAGAA  380

Query  519  GATTCCTCAAAGCCATATTCAGCAGATTTGTGAAACAATTTTAACCTCTGGAGAAAACCTAGCTAGGAAGAGAA  592
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||.|||||||||.||||.|||||||
Sbjct  381  GATTCCTCAGAGCCATATTCAGCAGATTTGTGAAAACATCTTAACCTCTGGGGAAAACCTATCTAGAAAGAGAA  454

Query  593  ACTTCACGGCAAAGTCTCCACTGATGTATGAATGGTACCAGGAATATTATGTAGGGGCTGCTCATGGCCTGGCT  666
            ||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.||||.
Sbjct  455  ACTTGGCGGCAAAGTCTCCACTGATGTATGAGTGGTACCAGGAATATTACGTGGGGGCTGCTCATGGCTTGGCA  528

Query  667  GGAATTTATTACTACCTGATGCAGCCCAGCCTTCAAGTGAGCCAAGGGAAGTTACATAGTTTGGTCAAGCCCAG  740
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  529  GGCATTTATTACTACCTGATGCAGCCCAGCCTTCAGGTGAACCAAGGAAAGTTGCATAGTTTGGTGAAGCCCAG  602

Query  741  TGTAGACTACGTCTGCCAGCTGAAATTCCCTTCTGGCAATTACCCTCCATGTATAGGTGATAATCGAGATCTGC  814
            ||||||||..|||||||.||||||.||.|||||.||||||||||||||||||.|.|.|||||...||||.||||
Sbjct  603  TGTAGACTTTGTCTGCCGGCTGAAGTTTCCTTCCGGCAATTACCCTCCATGTTTGGATGATACCAGAGACCTGC  676

Query  815  TTGTCCATTGGTGCCATGGCGCCCCTGGGGTAATCTACATGCTCATCCAGGCCTATAAGGTATTCAGAGAGGAA  888
            ||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||.|||.||.
Sbjct  677  TTGTCCATTGGTGCCACGGTGCTCCTGGGGTCATCTATATGCTCATCCAAGCATACAAGGTGTTCAAAGAAGAG  750

Query  889  AAGTATCTCTGTGATGCCTATCAGTGTGCTGATGTGATCTGGCAATATGGGTTGCTGAAGAAGGGATATGGGCT  962
            ...||.||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  751  CGTTACCTGTGTGATGCCCAGCAGTGTGCTGACGTGATCTGGCAGTACGGGCTACTGAAGAAGGGCTACGGGCT  824

Query  963  GTGCCACGGTTCTGCAGGGAATGCCTATGCCTTCCTGACACTCTACAACCTCACACAGGACATGAAGTACCTGT  1036
            ||||||.|||.||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||..|||||||.||||
Sbjct  825  GTGCCATGGTGCTGCAGGGAATGCCTACGCTTTCCTGGCACTCTACAACCTCACACAGGATCTGAAGTATCTGT  898

Query 1037  ATAGGGCCTGTAAGTTTGCTGAATGGTGCTTAGAGTATGGAGAACATGGATGCAGAACACCAGACACCCCTTTC  1110
            |.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||.|.||||||||.|||
Sbjct  899  ACAGGGCCTGCAAGTTTGCTGAGTGGTGCTTAGACTACGGGGAGCACGGATGCAGGACAGCGGACACCCCCTTC  972

Query 1111  TCTCTCTTTGAAGGAATGGCTGGAACAATATATTTCCTGGCTGACCTGCTAGTCCCCACAAAAGCCAGGTTCCC  1184
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.||||.||||||
Sbjct  973  TCCCTCTTTGAAGGGATGGCTGGAACAATATATTTCTTGGCTGACCTGTTAGTCCCCACAAAGGCCAAGTTCCC  1046

Query 1185  TGCATTTGAACTC  1197
            |||||||||||||
Sbjct 1047  TGCATTTGAACTC  1059