Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02426
- Subject:
- NM_001349217.2
- Aligned Length:
- 1486
- Identities:
- 1247
- Gaps:
- 230
Alignment
Query 1 ATGTCAGTGGACATGAATAGCCAGGGGTCTGACAGCAATGAAGAGGACTATGACCCAAATTGTGAGGAAGAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGAAGAAGAAGAAGACGACCCTGGGGACATAGAGGACTATTACGTGGGAGTAGCCAGCGATGTGGAGCAGCAGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGGCTGATGCCTTTGATCCCGAGGAGTACCAGTTCACTTGCTTGACCTACAAGGAATCTGAGGGTGCCCTCAAT 222
||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
Query 223 GAGCACATG--ACCAGCTTAGCTTCTGTCCT-----AAAGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTA 289
|..||| || |.||||| ||.||...||| |..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3 GCTCAC-TGCCATCAGCT--GCATCCTCCCTATGGCACTGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTA 73
Query 290 ATTTCCACTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGA 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 ATTTCCACTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGA 147
Query 364 GTTCAGCCTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGT 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 GTTCAGCCTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGT 221
Query 438 GCGAAAGGAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAG 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GCGAAAGGAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAG 295
Query 512 TTCTCGTCAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGAC 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 TTCTCGTCAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGAC 369
Query 586 TTTGTGTTTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 TTTGTGTTTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGA 443
Query 660 GAGTCATTACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTC 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GAGTCATTACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTC 517
Query 734 GCCGAGTACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGAC 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GCCGAGTACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGAC 591
Query 808 TGTGCCACAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACAC 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TGTGCCACAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACAC 665
Query 882 TAAAGACTGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTA 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 TAAAGACTGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTA 739
Query 956 AACACGACTTCTGCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTAC 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 AACACGACTTCTGCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTAC 813
Query 1030 AAGGAGAATCCTGACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTA 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AAGGAGAATCCTGACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTA 887
Query 1104 CTTTGAGAGGTGGGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGA 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CTTTGAGAGGTGGGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGA 961
Query 1178 TTCAGGAGAGGGTCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTG 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TTCAGGAGAGGGTCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTG 1035
Query 1252 GCCAAGTGTCGATACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCT 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GCCAAGTGTCGATACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCT 1109
Query 1326 GTTTGAATACCAGCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCT 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 GTTTGAATACCAGCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCT 1183
Query 1400 ATGACAGAGGGGACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCAT 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 ATGACAGAGGGGACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCAT 1257
Query 1474 GACACC 1479
||||||
Sbjct 1258 GACACC 1263