Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02426
• Subject: NM_001349226.2
• Aligned Length: 1479
• Identities: 1226
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  ATGTCAGTGGACATGAATAGCCAGGGGTCTGACAGCAATGAAGAGGACTATGACCCAAATTGTGAGGAAGAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAAGAAGAAGAAGACGACCCTGGGGACATAGAGGACTATTACGTGGGAGTAGCCAGCGATGTGGAGCAGCAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGGCTGATGCCTTTGATCCCGAGGAGTACCAGTTCACTTGCTTGACCTACAAGGAATCTGAGGGTGCCCTCAAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGCACATGACCAGCTTAGCTTCTGTCCTAAAGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTAATTTCCA  296
                                          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------ATGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTAATTTCCA  44

Query  297  CTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGAGTTCAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   45  CTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGAGTTCAGC  118

Query  371  CTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGTGCGAAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  CTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGTGCGAAAG  192

Query  445  GAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAGTTCTCGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  193  GAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAGTTCTCGT  266

Query  519  CAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGACTTTGTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  267  CAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGACTTTGTGT  340

Query  593  TTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGAGAGTCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  341  TTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGAGAGTCAT  414

Query  667  TACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTCGCCGAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  TACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTCGCCGAGT  488

Query  741  ACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGACTGTGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  ACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGACTGTGCCA  562

Query  815  CAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACACTAAAGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  CAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACACTAAAGAC  636

Query  889  TGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTAAACACGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  TGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTAAACACGA  710

Query  963  CTTCTGCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTACAAGGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  CTTCTGCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTACAAGGAGA  784

Query 1037  ATCCTGACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTACTTTGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  ATCCTGACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTACTTTGAG  858

Query 1111  AGGTGGGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGATTCAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  AGGTGGGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGATTCAGGA  932

Query 1185  GAGGGTCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTGGCCAAGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  GAGGGTCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTGGCCAAGT  1006

Query 1259  GTCGATACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCTGTTTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  GTCGATACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCTGTTTGAA  1080

Query 1333  TACCAGCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCTATGACAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  TACCAGCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCTATGACAG  1154

Query 1407  AGGGGACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCATGACACC  1479
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  AGGGGACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCATGACACC  1227