Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02426
• Subject: NM_001349227.2
• Aligned Length: 1548
• Identities: 930
• Gaps: 618

Alignment

Query    1  ATGTCAGTGGACATGAATAGCCAGGGGTCTGACAGCAATGAAGAGGACTATGACCCAAATTGTGAGGAAGAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAAGAAGAAGAAGACGACCCTGGGGACATAGAGGACTATTACGTGGGAGTAGCCAGCGATGTGGAGCAGCAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGGCTGATGCCTTTGATCCCGAGGAGTACCAGTTCACTTGCTTGACCTACAAGGAATCTGAGGGTGCCCTCAAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGCACATGACCAGCTTAGCTTCTGTCCTAAAGGTATCTCATTCAGTTGCTAAACTTATATTAGTTAATTTCCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTGGCAAGTTTCAGAGATATTGGACAGATACAAGTCCAATTCTGCTCAACTGCTTGTTGAGGCTCGAGTTCAGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTAATCCATCAAAACATGTTCCCACATCCCATCCCCCTCACCACTGTGCAGTGTGTATGCAGTTTGTGCGAAAG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GAAAACCTACTCTCTCTGGCCTGTCAGCACCAGTTTTGCCGCAGCTGCTGGGAGCAGCACTGCTCAGTTCTCGT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CAAGGACGGCGTGGGCGTGGGAGTCTCTTGCATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGACTTTGTGT  592
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------ATGGCTCAGGACTGTCCACTCCGTACACCAGAGGACTTTGTGT  43

Query  593  TTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGAGAGTCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  TTCCATTGCTTCCCAATGAAGAATTGAGAGAGAAATACAGGCGCTACCTCTTCAGGGACTATGTGGAGAGTCAT  117

Query  667  TACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTCGCCGAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  TACCAGCTCCAGCTGTGCCCTGGTGCAGACTGCCCCATGGTTATTCGGGTACAGGAGCCTAGAGCTCGCCGAGT  191

Query  741  ACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGACTGTGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  ACAGTGCAATCGGTGCAACGAGGTCTTCTGTTTCAAGTGTCGTCAGATGTATCACGCACCCACAGACTGTGCCA  265

Query  815  CAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACACTAAAGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  CAATCCGGAAATGGCTCACGAAGTGTGCAGACGACTCTGAAACAGCCAACTACATTAGTGCTCACACTAAAGAC  339

Query  889  TGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTAAACACG-  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  340  TGTCCCAAGTGCAACATCTGCATTGAGAAGAATGGAGGCTGCAATCACATGCAATGCTCCAAATGTAAACACGG  413

Query  962  --------------------------------------------------------------------ACTTCT  967
                                                                                ||||||
Sbjct  414  TGAGTTCCAAGCTTGGTGTGTAAGGCCCAGTGGCACTTTCTTGTGGTTGGGTCTCCGTTACTATTTAAACTTCT  487

Query  968  GCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTACAAGGAGAATCCT  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  GCTGGATGTGTCTAGGAGATTGGAAGACTCATGGCAGTGAATACTATGAGTGCAGTCGTTACAAGGAGAATCCT  561

Query 1042  GACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTACTTTGAGAGGTG  1115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  GACATCGTGAACCAGAGCCAACAAGCCCAGGCGAGGGAAGCCCTCAAGAAGTACTTATTCTACTTTGAGAGGTG  635

Query 1116  GGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGATTCAGGAGAGGG  1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  GGAAAACCACAATAAAAGCTTGCAGCTAGAGGCACAGACATACCAGCGGATTCACGAGAAGATTCAGGAGAGGG  709

Query 1190  TCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTGGCCAAGTGTCGA  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  TCATGAACAATCTGGGGACATGGATCGACTGGCAGTACCTACAGAATGCTGCCAAGCTCTTGGCCAAGTGTCGA  783

Query 1264  TACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCTGTTTGAATACCA  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  TACACCCTGCAATACACCTACCCATATGCATATTACATGGAGTCCGGACCCAGGAAGAAGCTGTTTGAATACCA  857

Query 1338  GCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCTATGACAGAGGGG  1411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  GCAGGCTCAGCTGGAGGCTGAGATCGAAAACCTCTCATGGAAAGTGGAGCGTGCAGACAGCTATGACAGAGGGG  931

Query 1412  ACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCATGACACC  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  ACTTGGAGAACCAGATGCATATAGCGGAGCAGCGGAGGAGAACCCTGCTGAAAGATTTCCATGACACC  999