Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02483
• Subject: XM_006517634.3
• Aligned Length: 1200
• Identities: 1020
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGTCGGACGGTTTCGATCGGGCCCCAGAGCAAACGAGGCCCCTGAGAGCTCCACCTAGTTCACAGGATAAAAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCACAGCAGAACTCGGAGTCAGCAATGGCTAAGCCCCAGGTGGTTGTAGCTCCTGTATTAATGTCTAAGCTGT  148
                                     |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------ATGGCTAAGCCCCAGGTGGTTGTGGCTCCTGTGTTAATGTCTAAGCTGT  49

Query  149  CTGTGAATGCCCCTGAATTTTACCCTTCAGGTTATTCTTCCAGTTACACAGAATCCTATGAGGATGGTTGTGAG  222
            |||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   50  CTGCGAACGCCCCCGAATTTTACCCATCAGGTTATTCTTCTAATTATACAGAATCCTATGAGGATGGTTGTGAG  123

Query  223  GATTATCCTACTCTATCAGAATATGTTCAGGATTTTTTGAATCATCTTACAGAGCAGCCTGGCAGTTTTGAAAC  296
            |||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  124  GATTACCCGACTCTCTCAGAATACGTTCAGGATTTTCTGAATCATCTGACAGAACAGCCTGGTAGTTTTGAAAC  197

Query  297  TGAAATTGAACAGTTTGCAGAGACCCTGAATGGTTGTGTTACAACAGATGATGCTTTGCAAGAACTTGTGGAAC  370
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  198  AGAAATTGAACAGTTTGCAGAAACCCTGAATGGATGGGTCACAACAGATGATGCTTTGCAAGAACTTGTGGAAC  271

Query  371  TCATCTATCAACAGGCCACATCTATCCCAAATTTCTCTTATATGGGAGCTCGCCTGTGTAATTACCTGTCCCAT  444
            |.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  272  TTATCTACCAACAGGCCACGTCTATCCCAAATTTCTCTTACATGGGAGCTCGCCTGTGTAATTACCTGTCCCAT  345

Query  445  CATCTGACAATTAGCCCACAGAGTGGCAACTTCCGCCAATTGCTACTTCAAAGATGTCGGACTGAATATGAAGT  518
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||.||.|||||||.
Sbjct  346  CATCTGACAATTAGTCCACAGAGTGGCAACTTCCGCCAATTGCTACTTCAAAGGTGCAGGACGGAGTATGAAGC  419

Query  519  TAAAGATCAAGCTGCAAAAGGGGATGAAGTTACTCGAAAACGATTTCATGCATTTGTACTCTTTCTGGGAGAAC  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  420  TAAAGACCAAGCTGCAAAAGGGGATGAAGTGACTCGAAAACGATTTCATGCATTTGTTCTGTTTCTGGGAGAAC  493

Query  593  TTTATCTTAACCTGGAGATCAAGGGAACAAATGGACAGGTTACAAGAGCAGATATTCTTCAGGTTGGTCTTCGA  666
            |.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  494  TATATCTTAACCTGGAGATTAAAGGAACAAATGGACAAGTTACAAGAGCAGATATTCTTCAGGTTGGTCTTCGG  567

Query  667  GAATTGCTGAATGCCCTGTTTTCTAATCCTATGGATGACAATTTAATTTGTGCAGTAAAATTGTTAAAGTTGAC  740
            |||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  568  GAACTGCTGAATGCTCTGTTTTCTAATCCTATGGATGACAACTTAATTTGTGCAGTAAAATTGCTAAAGTTGAC  641

Query  741  AGGATCAGTTTTGGAAGATGCTTGGAAGGAAAAAGGAAAGATGGATATGGAAGAAATTATTCAGAGAATTGAAA  814
            ||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.|..||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  642  AGGATCAGTTTTAGAAGATACTTGGAAGGAAAAGGGGAAAACTGATATGGAAGAAATAATTCAGAGAATTGAAA  715

Query  815  ACGTTGTCCTAGATGCAAACTGCAGTAGAGATGTAAAACAGATGCTCTTGAAGCTTGTAGAACTCCGGTCAAGT  888
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  716  ATGTTGTCCTAGATGCAAACTGCAGCAGAGATGTAAAACAGATGCTCTTGAAGCTTGTTGAACTTCGATCAAGT  789

Query  889  AACTGGGGCAGAGTCCATGCAACTTCAACATATAGAGAAGCAACACCAGAAAATGATCCTAACTACTTTATGAA  962
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  790  AACTGGGGTAGGGTCCATGCAACTTCAACATACAGAGAAGCTACCCCTGAAAATGACCCTAATTACTTCATGAA  863

Query  963  TGAACCAACATTTTATACATCTGATGGTGTTCCTTTCACTGCAGCTGATCCAGATTACCAAGAGAAATACCAAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  864  TGAACCAACATTTTATACATCTGATGGTGTTCCTTTCACTGCAGCGGACCCAGATTACCAAGAAAAGTATCAAG  937

Query 1037  AATTACTTGAAAGAGAGGACTTTTTTCCAGATTATGAAGAAAATGGAACAGATTTATCCGGGGCTGGTGATCCA  1110
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  938  AGTTACTTGAAAGAGAGGACTTTTTTCCAGATTATGAAGAAAATGGAACAGATTTATCAGGGGCTGGTGACCCA  1011

Query 1111  TACTTGGATGATATTGATGATGAGATGGACCCAGAGATAGAAGAAGCTTATGAAAAGTTTTGTTTGGAATCAGA  1184
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012  TATTTGGATGATATCGATGATGAGATGGACCCAGAAATTGAAGAAGCTTATGAAAAGTTTTGTTTGGAATCAGA  1085

Query 1185  GCGTAAGCGAAAACAG  1200
            |||.||||||||||||
Sbjct 1086  GCGCAAGCGAAAACAG  1101