Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02569
- Subject:
- NM_001297747.1
- Aligned Length:
- 888
- Identities:
- 692
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 ATGAAGAATGAAATTGCTGCCGTTGTCTTCTTTTTCACAAGGCTAGTTCGAAAACATGATAAGTTGAAAAAAGA 74
||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGAACGAAATTGCGGCTGTTGTCTTCTTTTTCACAAGGCTAGTTCGAAAGCATGACAAGTTGAAAAAAGA 74
Query 75 GGCAGTTGAGAGGTTTGCTGAGAAATTGACCCTAATACTTCAAGAAAAATATAAAAATCACTGGTATCCAGAAA 148
.||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCAGTTGAGAGGTTTGCTGAGAAATTAACTCAAATACTTCAAGAGAAATATAAAAATCACTGGTATCCAGAAA 148
Query 149 AACCATCGAAAGGACAGGCCTACAGATGTATTCGTGTCAATAAATTTCAGAGAGTTGATCCTGATGTCCTGAAA 222
|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 AACCATCCAAAGGTCAGGCCTACAGATGCATTCGTGTCAATAAGTTTCAGAGAGTTGATCCCGATGTCCTGAAA 222
Query 223 GCCTGTGAAAACAGCTGCATCTTGTATAGTGACCTGGGCTTGCCAAAGGAGCTCACTCTCTGGGTGGACCCATG 296
||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 223 GCCTGTGAGAACAGCTGCATCTTGTACAGCGACCTGGGCTTGCCTAAGGAGCTTACACTCTGGGTGGATCCGTG 296
Query 297 TGAGGTGTGCTGTCGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGCTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCC 370
||||||||||||.||
Sbjct 297 TGAGGTGTGCTGCCG----------------------------------------------------------- 311
Query 371 GCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGCGCTGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCCTCCTTTTTGATTATG 444
|
Sbjct 312 -------------------------------------------------------------------------G 312
Query 445 TATGGAGAGAAAAACAATGCATTCATTGTTGCCAGCTTTGAAAATAAAGATGAGAACAAGGATGAGATCTCCAG 518
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 313 TATGGAGAGAAAAACAATGCGTTCATTGTTGCCAGCTTTGAAAATGAGGACGAGAACAAGGATGAAATCTCCAA 386
Query 519 GAAAGTTACCAGGGCCCTTGATAAGGTTACCTCTGATTATCATTCAGGATCCTCTTCTTCAGATGAAGAAACAA 592
||||||||.||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 387 GAAAGTTAGCAGGGCTCTGGATAAGGTGACCTCTGATTATCACTCAGGGTCCTCTTCCTCAGATGAAGACACAA 460
Query 593 GTAAGGAAATGGAAGTGAAACCCAGTTCGGTGACTGCAGCCGCAAGTCCTGTGTACCAGATTTCAGAACTTATA 666
|.||||||.||||.|||||||||||.||.|||.|.|||.|..||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 461 GCAAGGAAGTGGACGTGAAACCCAGCTCAGTGGCGGCAACACCAAGCCCCGTGTACCAGATTTCAGAACTGATA 534
Query 667 TTTCCACCTCTTCCAATGTGGCACCCTTTGCCCAGAAAAAAGCCAGGAATGTATCGAGGGAATGGCCATCAGAA 740
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.
Sbjct 535 TTCCCACCTCTTCCAATGTGGCACCCTTTGCCCAGAAAAAAGCCAGGAATGTATCGAGGGAGCGGCCATCAGAC 608
Query 741 TCACTATCCTCCTCCTGTTCCATTTGGTTATCCAAATCAGGGAAGAAAAAATAAACCATATCGCCCAATTCCAG 814
||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||.||.||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 609 TCACTACCCTCCTCCTGTTCCATTTGCTTATCCAAATCCAGGAAGGAAGAATAAACCATTCCGCCCAATTCCAG 682
Query 815 TGACATGGGTACCTCCTCCTGGAATGCATTGTGACCGGAATCACTGGATTAATCCTCACATGTTAGCACCTCAC 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 TGACATGGGTACCTCCTCCTGGAATGCATTGTGACCGAAATCACTGGATTAATCCTCACATGTTAGCACCTCAC 756