Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02571
• Subject: XM_011528501.1
• Aligned Length: 936
• Identities: 828
• Gaps: 96

Alignment

Query   1  ATGGCCCCCAAATTCCCAGACTCTGTGGAGGAGCTCCGCGCCGCCGGCAATGAGAGTTTCC-----GCAAC--G  67
                                                            ||||.||.|..|     .||||  |
Sbjct   1  -------------------------------------------------ATGAAAGATATCAAATATCAACATG  25

Query  68  GC--CAGTACGCCGAGGCCTCCGCGCTCTACGGCCGCGCGCTGCGGGTGCTGCAGGCGCAAGGTTCTTCAGACC  139
           ||  |||.|..|.|||                                  ||.|    .||.||||||||||||
Sbjct  26  GCAACAGGATACTGAG----------------------------------TGAA----AAAAGTTCTTCAGACC  61

Query 140  CAGAAGAAGAAAGTGTTCTCTACTCCAACCGAGCAGCATGTCACTTGAAGGATGGAAACTGCAGAGACTGCATC  213
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  62  CAGAAGAAGAAAGTGTTCTCTACTCCAACCGAGCAGCATGTCACTTGAAGGATGGAAACTGCAGAGACTGCATC  135

Query 214  AAAGATTGCACTTCAGCACTGGCCTTGGTTCCCTTCAGCATTAAGCCCCTGCTGCGGCGAGCATCTGCTTATGA  287
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136  AAAGATTGCACTTCAGCACTGGCCTTGGTTCCCTTCAGCATTAAGCCCCTGCTGCGGCGAGCATCTGCTTATGA  209

Query 288  GGCTCTGGAGAAGTACCCTATGGCCTATGTTGACTATAAGACTGTGCTGCAGATTGATGATAATGTGACGTCAG  361
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210  GGCTCTGGAGAAGTACCCTATGGCCTATGTTGACTATAAGACTGTGCTGCAGATTGATGATAATGTGACGTCAG  283

Query 362  CCGTAGAAGGCATCAACAGAATGACCAGAGCTCTCATGGACTCGCTTGGGCCTGAGTGGCGCCTGAAGCTGCCC  435
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284  CCGTAGAAGGCATCAACAGAATGACCAGAGCTCTCATGGACTCGCTTGGGCCTGAGTGGCGCCTGAAGCTGCCC  357

Query 436  TCAATCCCCTTGGTGCCTGTTTCAGCTCAGAAGAGGTGGAATTCCTTGCCTTCGGAGAACCACAAAGAGATGGC  509
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358  TCAATCCCCTTGGTGCCTGTTTCAGCTCAGAAGAGGTGGAATTCCTTGCCTTCGGAGAACCACAAAGAGATGGC  431

Query 510  TAAAAGCAAATCCAAAGAAACCACAGCTACAAAGAACAGAGTGCCTTCTGCTGGGGATGTGGAGAAAGCCAGAG  583
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432  TAAAAGCAAATCCAAAGAAACCACAGCTACAAAGAACAGAGTGCCTTCTGCTGGGGATGTGGAGAAAGCCAGAG  505

Query 584  TTCTGAAGGAAGAAGGCAATGAGCTTGTAAAGAAGGGAAACCATAAGAAAGCTATTGAGAAGTACAGTGAAAGC  657
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506  TTCTGAAGGAAGAAGGCAATGAGCTTGTAAAGAAGGGAAACCATAAGAAAGCTATTGAGAAGTACAGTGAAAGC  579

Query 658  CTCTTGTGTAGTAACCTGGAATCTGCCACGTACAGCAACAGAGCACTCTGCTATTTGGTCCTGAAGCAGTACAC  731
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580  CTCTTGTGTAGTAACCTGGAATCTGCCACGTACAGCAACAGAGCACTCTGCTATTTGGTCCTGAAGCAGTACAC  653

Query 732  AGAAGCAGTGAAGGACTGCACAGAAGCCCTCAAGCTGGATGGAAAGAACGTGAAGGCATTCTACAGACGGGCTC  805
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654  AGAAGCAGTGAAGGACTGCACAGAAGCCCTCAAGCTGGATGGAAAGAACGTGAAGGCATTCTACAGACGGGCTC  727

Query 806  AAGCCCACAAAGCACTCAAGGACTATAAATCCAGCTTTGCAGACATCAGCAACCTCCTACAGATTGAGCCTAGG  879
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728  AAGCCCACAAAGCACTCAAGGACTATAAATCCAGCTTTGCAGACATCAGCAACCTCCTACAGATTGAGCCTAGG  801

Query 880  AATGGTCCTGCACAGAAGTTGCGGCAGGAAGTGAAGCAGAACCTACAC  927
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802  AATGGTCCTGCACAGAAGTTGCGGCAGGAAGTGAAGCAGAACCTACAC  849