Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02663
- Subject:
- NM_001014451.3
- Aligned Length:
- 1437
- Identities:
- 1344
- Gaps:
- 93
Alignment
Query 1 ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTGAGTCGTTGAGCAACTTGCATCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTGAGTCGTTGAGCAACTTGCATCT 74
Query 75 TAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATG 148
Query 149 AAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACA 222
Query 223 AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCT 296
Query 297 GAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGC 370
Sbjct 297 -------------------------------------------------------------------------- 296
Query 371 CACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 -------------------CCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTC 351
Query 445 GTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 GTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGA 425
Query 519 GCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 GCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG 499
Query 593 TTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 TTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTG 573
Query 667 GACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 GACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCAT 647
Query 741 GATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 648 GATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGC 721
Query 815 TTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 TTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAA 795
Query 889 CTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 CTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTT 869
Query 963 CCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 CCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAG 943
Query 1037 CTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 CTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAA 1017
Query 1111 CAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 CAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG 1091
Query 1185 CGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 CGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACA 1165
Query 1259 ATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 ATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGAC 1239
Query 1333 AGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 AGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGA 1313
Query 1407 TGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC 1437
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 TGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC 1344