Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02663
• Subject: NM_001190786.1
• Aligned Length: 1494
• Identities: 1290
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  -------------ATGGCC---ACTGACTCATGGGCCCTGGC--GGT---GGACGAGCAGG-------------  40
                         ||||||   .|||           |||||  |||   ||.|||||..|             
Sbjct    1  ATGTTGCGCCGCGATGGCCGGAGCTG-----------CTGGCCGGGTCGAGGTCGAGCCCGAGCCCGAGCCCAA  63

Query   41  ----AAGCTGCGG------------------CTGAGTCG-TTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAAGAGAAAATCA  91
                ||||| |||                  ||||.|.| |||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   64  GCCCAAGCT-CGGAATCCACTTTCCCTGCCCCTGACTGGTTTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAGGAGAAAATCA  136

Query   92  AACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATGAAGAAGAGAAAGAGGAC  165
            ||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  137  AACCAGATGCCAATGGTGCTGTTGTTAAGACCAATGCAAACACAGAGAAGACAGAGGAAGATGAGAAAGAGGAC  210

Query  166  AGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAACCAAGTGGAAGTCCT  239
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  211  AGAGCTGCTCAGTCTTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAATCTTGTGGATAACACCAACCAAGTGGAAGTCCT  284

Query  240  GCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCTGAAACCACAGCTTCTCC  313
            ||||.||||.||||.||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  285  GCAGAGGGACCCAAGCTCCCCGCTCTACTCAGTGAAGTCCTTCGAAGAGCTTCGCCTGAAACCACAGCTTCTCC  358

Query  314  AAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGAG  387
            |.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||..|||||||||||||.
Sbjct  359  AGGGAGTCTATGCTATGGGTTTCAACCGCCCTTCCAAAATACAGGAAAATGCATTGCCTTTGATGCTTGCTGAA  432

Query  388  CCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAG  461
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||..||||..||||.||
Sbjct  433  CCCCCACAGAACTTAATTGCCCAGTCTCAGTCTGGTACGGGTAAAACAGCTGCCTTTGTTTTGGCTGTGCTCAG  506

Query  462  CCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAG  535
            |||||||||.|||||||||||.|...||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  507  CCAAGTAGAGCCTGCAAACAAGTTTGCCCAGTGTCTCTGCCTCTCTCCAACCTATGAGCTTGCTCTTCAAACAG  580

Query  536  GAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTG  609
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  581  GAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAACAAATTG  654

Query  610  GAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCT  683
            ||.||.||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||
Sbjct  655  GAGAGGGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTCTTGGACTGGTGCTCCAAGCT  728

Query  684  CAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCC  757
            .|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  729  GAAGTTCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGTGATGATAGCGACTCAGGGCC  802

Query  758  ACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTT  831
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  803  ACCAAGACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCGGCCACCTTT  876

Query  832  GAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGA  905
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  877  GAAGACTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATCAAGCTGAAGCGTGAGGAGGA  950

Query  906  GACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACC  979
            |||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.|||||||||||||||.||||.||.|
Sbjct  951  GACTCTGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAAGTTCCAGGCCCTGTGCAATC  1024

Query  980  TCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCA  1053
            |.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1025  TGTATGGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAACAGCTAGCTGGCTGGCAGCA  1098

Query 1054  GAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGAT  1127
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1099  GAGCTCTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTGGAGCAGAGGGCTGCGGTGAT  1172

Query 1128  TGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAAC  1201
            .||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1173  CGAGCGCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGTGGTATCGATGTTGAAC  1246

Query 1202  AAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCAC  1275
            |.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  AGGTGTCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGACGGGAACCCAGACAATGAGACCTACCTGCAC  1320

Query 1276  CGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAA  1349
            ||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  CGCATTGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTCAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAA  1394

Query 1350  CATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTG  1423
            .|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  TATCCTCAACAGGATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGACTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTG  1468

Query 1424  AGAAAATAGCCAAC  1437
            |||||||.||||||
Sbjct 1469  AGAAAATCGCCAAC  1482