Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02663
• Subject: NM_001190800.1
• Aligned Length: 1437
• Identities: 1262
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTGAGTCGTTGAGCAACTTGCATCT  74
            |||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTACGGATTCTTGGGCCCTAGCAGTAGACGAACAGGAAGCCGCAGCTGAGTCTTTGAGCAACTTGCATCT  74

Query   75  TAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATG  148
            ||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.|
Sbjct   75  TAAGGAGGAGAAAATCAAACCAGATGCCAATGGTGCTGTTGTTAAGACCAATGCAAACACAGAGAAGACAGAGG  148

Query  149  AAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACA  222
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  149  AAGATGAGAAAGAGGACAGAGCTGCTCAGTCTTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAATCTTGTGGATAACACC  222

Query  223  AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCGGCT  296
            |||||||||||||||||||||.||||.||||.||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  223  AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGAGGGACCCAAGCTCCCCGCTCTACTCAGTGAAGTCCTTCGAAGAGCTTCGCCT  296

Query  297  GAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGC  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  297  GAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCTATGGGTTTCAACCGCCCTTCCAAAATACAGGAAAATGCATTGC  370

Query  371  CACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTC  444
            |..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  CTTTGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAACTTAATTGCCCAGTCTCAGTCTGGTACGGGTAAAACAGCTGCCTTT  444

Query  445  GTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGA  518
            ||..||||..||||.|||||||||||.|||||||||||.|...||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  445  GTTTTGGCTGTGCTCAGCCAAGTAGAGCCTGCAAACAAGTTTGCCCAGTGTCTCTGCCTCTCTCCAACCTATGA  518

Query  519  GCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG  592
            |||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTTGCTCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG  592

Query  593  TTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTG  666
            ||||||||||.||||||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..||
Sbjct  593  TTCGAGGCAACAAATTGGAGAGGGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTCTTG  666

Query  667  GACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCAT  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  667  GACTGGTGCTCCAAGCTGAAGTTCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGTGAT  740

Query  741  GATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGC  814
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GATAGCGACTCAGGGCCACCAAGACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGCTGC  814

Query  815  TTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAA  888
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.|||||.
Sbjct  815  TTTTCTCGGCCACCTTTGAAGACTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATCAAG  888

Query  889  CTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTT  962
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.||||||||
Sbjct  889  CTGAAGCGTGAGGAGGAGACTCTGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAAGTT  962

Query  963  CCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAG  1036
            |||||||.||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  CCAGGCCCTGTGCAATCTGTATGGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAACAG  1036

Query 1037  CTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAA  1110
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  CTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTGGAG  1110

Query 1111  CAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG  1184
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAGGGCTGCGGTGATCGAGCGCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG  1184

Query 1185  CGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACA  1258
            .||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  TGGTATCGATGTTGAACAGGTGTCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGACGGGAACCCAGACA  1258

Query 1259  ATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGAC  1332
            |||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1259  ATGAGACCTACCTGCACCGCATTGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTCAACATGGTGGAC  1332

Query 1333  AGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGA  1406
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||     ||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1333  AGCAAGCACAGCATGAATATCCTCAACAGGATCCAGGAGCATTTTA-----AAGATAGAAAGACTGGACACAGA  1401

Query 1407  TGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1437
                                           
Sbjct 1402  -------------------------------  1401