Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02669
• Subject: NM_013841.3
• Aligned Length: 1710
• Identities: 1554
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAACGTGGTTTTTGCTGTGAAGCAGTACATTTCCAAAATGATAGAGGACAGCGGGCCTGGTATGAAAGTACT  74
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGAATGTGGTCTTTGCTGTGAAGCAGTATATTTCCAAAATGATAGAGGACAGCGGGCCGGGCATGAAGGTACT  74

Query   75  TCTCATGGATAAAGAGACGACTGGCATAGTGAGTATGGTATACACACAATCGGAGATTCTACAGAAGGAAGTGT  148
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  TCTCATGGATAAAGAAACGACTGGTATAGTGAGTATGGTCTACACACAGTCAGAGATTCTTCAGAAGGAAGTAT  148

Query  149  ACCTCTTTGAACGCATTGATTCTCAAAATCGAGAGATCATGAAACACCTGAAGGCAATTTGTTTTCTTCGACCT  222
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  149  ACCTCTTCGAACGAATTGATTCTCAAAATCGAGAGATCATGAAACACCTAAAAGCAATTTGTTTCCTTCGACCC  222

Query  223  ACAAAGGAGAATGTGGATTATATTATTCAGGAGCTCCGAAGACCCAAATACACTATATATTTCATTTATTTCAG  296
            |||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.||||..||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  ACAAAGGAGAATGTGGAATATCTGATCCAGGAGCTCCGAAGACCCAAGTACAGCATATATTTTATTTATTTCAG  296

Query  297  TAATGTGATCAGCAAGAGTGACGTGAAGTCATTGGCTGAAGCTGATGAACAGGAAGTTGTGGCTGAGGTTCAGG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  TAATGTGATCAGCAAGAGTGACGTGAAGTCACTGGCTGAAGCTGACGAGCAGGAAGTTGTGGCTGAAGTTCAGG  370

Query  371  AATTTTATGGTGATTACATTGCTGTGAACCCACATTTGTTTTCCCTCAATATTTTGGGTTGCTGCCAGGGTCGA  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  AATTTTATGGTGATTACATTGCGGTGAATCCACATTTGTTTTCTCTCAATATTTTGGGTTGCTGTCAGGGTCGA  444

Query  445  AATTGGGATCCAGCCCAGCTATCTAGAACAACTCAAGGGCTTACAGCTCTCCTTTTATCTCTGAAGAAGTGTCC  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  AATTGGGATCCAGCCCAGCTATCAAGAACGACTCAAGGGCTGACAGCTCTCCTTTTGTCTCTGAAGAAGTGCCC  518

Query  519  CATGATTCGTTATCAGCTCTCATCAGAGGCAGCAAAGAGACTTGCAGAGTGCGTTAAGCAAGTGATAACTAAAG  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|.|||.||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct  519  CATGATTCGTTATCAGCTTTCATCAGAGGCTGCAAAGAGACTGGGAGAATGTGTTAAGCAAGTGATAAGTAAAG  592

Query  593  AATATGAACTGTTTGAATTCCGTCGGACAGAGGTTCCTCCATTGCTCCTTATTTTAGATCGCTGTGATGATGCC  666
            |.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|.||.||.|||.|.||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  AGTACGAACTCTTTGAATTCCGGCGGACAGAGGTTCCTCCGCTACTTCTCATTCTGGATCGCTGCGATGACGCC  666

Query  667  ATCACCCCATTGCTAAACCAGTGGACATATCAGGCCATGGTCCACGAACTACTAGGCATAAACAACAATCGGAT  740
            ||.|||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  ATTACCCCGCTGCTCAACCAGTGGACATATCAGGCCATGGTCCATGAACTACTGGGCATAAACAACAACCGGAT  740

Query  741  TGATCTTTCCAGAGTGCCGGGAATCAGTAAAGACTTAAGAGAAGTGGTCCTATCTGCTGAAAATGATGAATTCT  814
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATCTTTCCAGAGTGCCAGGAATCAGCAAAGACTTAAGAGAGGTGGTCCTGTCCGCTGAAAATGATGAATTCT  814

Query  815  ATGCTAATAATATGTACCTGAACTTTGCTGAGATTGGTAGCAATATAAAGAATCTCATGGAAGATTTTCAGAAG  888
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  815  ATGCTAATAACATGTACCTGAACTTTGCCGAGATTGGTAGCAATATAAAGAATCTCATGGAAGACTTCCAGAAG  888

Query  889  AAGAAACCAAAAGAACAGCAAAAACTAGAATCAATAGCAGACATGAAGGCGTTTGTTGAGAATTATCCACAGTT  962
            ||||.|||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAGACCAAAAGAGCAGCAAAAGCTGGAATCCATAGCAGACATGAAGGCCTTTGTTGAAAATTATCCACAGTT  962

Query  963  CAAGAAAATGTCTGGGACTGTTTCAAAGCATGTGACAGTGGTTGGAGAACTGTCTCGATTGGTCAGTGAACGGA  1036
            |||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  963  CAAAAAGATGTCTGGGACTGTCTCAAAGCACGTGACAGTGGTCGGGGAACTGTCTCGGTTGGTCAGTGAGCGGA  1036

Query 1037  ATCTGCTGGAGGTTTCAGAGGTTGAGCAAGAACTGGCCTGTCAAAATGACCATTCTAGTGCTCTCCAGAATATA  1110
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.
Sbjct 1037  ATCTGCTGGAGGTTTCAGAAGTTGAGCAAGAACTGGCCTGTCAGAATGACCATTCTAGTGCTCTTCAGAATGTG  1110

Query 1111  AAAAGGCTTCTGCAGAACCCCAAAGTGACAGAGTTTGATGCTGCCCGCCTGGTGATGCTTTATGCTTTACATTA  1184
            ||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|..|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1111  AAGAGACTCCTGCAGAATCCGAAAGTCACAGAATTTGATGCAGTTCGCCTGGTGATGCTTTATGCTCTACATTA  1184

Query 1185  TGAGCGACACAGCAGCAATAGCCTGCCAGGACTAATGATGGACCTCAGGAATAAAGGTGTTTCTGAGAAGTATC  1258
            .|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1185  CGAGCGCCACAGCAGCAACAGCCTGCCAGGACTCATAGTGGACCTCAGGAGTAAAGGTGTTGCTGAGAAGTATC  1258

Query 1259  GAAAGCTCGTGTCTGCAGTTGTTGAATATGGTGGTAAACGAGTCAGAGGAAGTGACCTCTTCAGCCCCAAAGAT  1332
            |.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  GGAAGCTTGTGTCGGCAGTTGTTGAATATGGTGGTAAACGGGTTAGAGGAAGTGACCTCTTCAGTCCCAAAGAT  1332

Query 1333  GCTGTGGCTATCACCAAACAATTCCTCAAAGGACTGAAGGGAGTAGAAAATGTATATACACAGCATCAACCTTT  1406
            |||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1333  GCTGTGGCTATTACCAAGCAGTTTCTCAAAGGACTGAAGGGAGTGGAAAATGTGTATACACAGCACCAGCCTTT  1406

Query 1407  CCTACATGAAACCCTGGATCATCTCATCAAAGGAAGGCTTAAGGAAAACCTATATCCTTATTTAGGCCCCAGCA  1480
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTGCATGAGACCCTGGATCATCTCATCAAAGGAAGGCTTAAGGAAAACCTCTATCCTTATTTAGGCCCCAGCA  1480

Query 1481  CACTCAGAGACAGACCTCAGGATATCATTGTGTTTGTAATTGGAGGAGCCACCTATGAAGAGGCTCTAACAGTT  1554
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1481  CACTCAGAGACAGGCCTCAGGATATCATCGTGTTTATTATTGGAGGAGCCACCTATGAAGAGGCTCTGACAGTC  1554

Query 1555  TATAACCTGAACCGCACCACTCCTGGAGTGAGGATTGTCCTGGGAGGCACCACAGTGCACAACACGAAAAGTTT  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||.|.||||||||.|||||.||
Sbjct 1555  TATAACCTGAACCGCACCACTCCTGGAGTGAGGATCGTTCTGGGAGGAACAACAATACACAACACAAAAAGCTT  1628

Query 1629  CCTAGAGGAAGTTCTGGCTTCTGGACTGCACAGCCGAAGCAAGGAGAGCTCTCAAGTCACATCAAGGTCAGCGA  1702
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||.||.|.|||.|||||||||||.|
Sbjct 1629  CCTAGAGGAAGTCCTGGCTTCTGGGCTGCACAGCCGCAGCAGGGAGAGCTCGCAGGCCACCTCAAGGTCAGCAA  1702

Query 1703  GCAGAAGA  1710
            .|||||||
Sbjct 1703  ACAGAAGA  1710