Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02693
- Subject:
- NM_001113226.3
- Aligned Length:
- 1617
- Identities:
- 1314
- Gaps:
- 303
Alignment
Query 1 ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT 74
Query 75 GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT 148
Query 149 GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC 222
Query 223 CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT 296
Query 297 GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA 370
Query 371 AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA 444
Query 445 GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA 518
Query 519 GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC 592
Query 593 AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC 666
Query 667 TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT 740
Query 741 GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG 814
Query 815 GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG 888
Query 889 TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC 962
Query 963 TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA 1036
Query 1037 TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTA----------------------- 1087
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTAATTGTGAATGCTTCGGCCACTCC 1110
Query 1088 -------------------------------------------------------------------------- 1087
Sbjct 1111 AATCGATGCAGTTATATCGATCTGCTAAATACAGTCATTTGCGTGAGCTGTAAACACAACACTAGAGGGCAGCA 1184
Query 1088 -------------------------------------------------------------------------- 1087
Sbjct 1185 CTGTGAGTTATGCAGGCTGGGCTACTTCAGAAATGCTTCTGCACAACTGGACGATGAGAATGTGTGCATAGAGT 1258
Query 1088 -------------------------------------------------------------------------- 1087
Sbjct 1259 GTTATTGTAACCCTTTGGGCTCAATCCATGATCGTTGTAATGGCTCAGGATTTTGTGAGTGTAAGACTGGAACA 1332
Query 1088 ----------------------------------------------------------CGAATGTCTGCGACAA 1103
||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACAGGGCCTAAGTGTGATGAGTGTCTGCCGGGAAATTCCTGGCACTACGGCTGTCAACCGAATGTCTGCGACAA 1406
Query 1104 CGAGCTCCTGCACTGCCAGAACGGAGGGACGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGG 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGAGCTCCTGCACTGCCAGAACGGAGGGACGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGG 1480
Query 1178 GCATCCTCTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCG 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GCATCCTCTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCG 1554
Query 1252 CACGGCTCCCCAGCGCTGCTGCTGCTGACCACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC 1314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CACGGCTCCCCAGCGCTGCTGCTGCTGACCACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC 1617