Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02693
• Subject: XM_011541025.2
• Aligned Length: 1338
• Identities: 1126
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT  74

Query   75  GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT  148

Query  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222

Query  223  CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT  296

Query  297  GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA  370

Query  371  AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA  444

Query  445  GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA  518

Query  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC  592

Query  593  AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC  666

Query  667  TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT  740

Query  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG  814

Query  815  GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888

Query  889  TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC  962

Query  963  TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA  1036

Query 1037  TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTA-----CGAATGTCTGCGACAACG  1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |.||.||.|   |..|.|
Sbjct 1037  TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTAATCCTCCAAAGTTT---AATAGG  1107

Query 1106  A----GC-------TCCTGCACTGCCAGAACGGAGG-----GACGTGCCACAACAACGT--GCGC-TGCCTGTG  1160
            |    ||       |.||.|.||        .||||     .||   |||.|||||.||  |.|| ||      
Sbjct 1108  ATATGGCCGAATATTTCTTCCCT--------TGAGGTTTCTAAC---CCAAAACAAGGTAGGAGCATG------  1164

Query 1161  CCCGGCCGCATACACGGGCATCCTCTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTG  1234
                                                                                      
Sbjct 1165  --------------------------------------------------------------------------  1164

Query 1235  GCCAGGGCGCGCCCCCGCACGGCTCCCCAGCGCTGCTGCTGCTGACCACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTG  1308
                                                                                      
Sbjct 1165  --------------------------------------------------------------------------  1164

Query 1309  GTGTTC  1314
                  
Sbjct 1165  ------  1164