Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02708
• Subject: XM_006538236.3
• Aligned Length: 1967
• Identities: 1726
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGGCT---GCAGCAGCAGCTTCTCACCTGAACCTGGATGCCCTCCGGGAAGTGCTAGAATGCCCCATCTGCAT  71
            ||||||   ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGGCTGCAGCAGCTTCTCACCTGAACCTGGATGCCCTCCGGGAAGTGCTAGAATGTCCCATCTGCAT  74

Query   72  GGAGTCCTTCACAGAAGAGCAGCTGCGTCCCAAGCTTCTGCACTGTGGCCATACCATCTGCCGCCAGTGCCTGG  145
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  GGAGTCCTTCACTGAAGAGCAGCTGCGACCCAAGCTGCTGCACTGTGGCCATACCATCTGCCGCCAGTGTCTGG  148

Query  146  AGAAGCTATTGGCCAGTAGCATCAATGGTGTCCGCTGTCCCTTTTGCAGCAAGATTACCCGCATAACCAGCTTG  219
            |||||||..|||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||
Sbjct  149  AGAAGCTCCTGGCCAGCAGCATCAATGGCGTCCGCTGCCCCTTTTGCAGCAAGATTACTCGCATCACCAGCCTG  222

Query  220  ACCCAGCTGACAGACAATCTGACAGTGCTAAAGATCATTGATACAGCTGGGCTCAGCGAGGCTGTGGGGCTGCT  293
            |||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  223  ACCCAGCTGACCGACAACCTGACGGTGCTGAAGATCATTGACACAGCTGGGCTCAGTGAGGCCGTCGGCCTGCT  296

Query  294  CATGTGTCGGTCCTGTGGGCGGCGTCTGCCCCGGCAATTCTGCCGGAGCTGTGGTTTGGTGTTATGTGAGCCCT  367
            ||||||.||...||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||||
Sbjct  297  CATGTGCCGAGGCTGTGGCCGGCGGCTGCCTCGGCAGTTCTGCCGAAGCTGTGGTGTGGTGTTGTGTGAACCCT  370

Query  368  GCCGGGAGGCAGACCATCAGCCTCCTGGCCACTGTACACTCCCTGTCAAAGAAGCAGCTGAGGAGCGGCGTCGG  441
            |||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||..||
Sbjct  371  GCCGGGAGGCAGATCACCAACCCCCTGGCCACTGCACACTTCCGGTCAAGGAGGCAGCTGAGGAGCGGCGGAGG  444

Query  442  GACTTTGGAGAGAAGTTAACTCGTCTGCGGGAACTTATGGGGGAGCTGCAGCGGCGGAAGGCAGCCTTGGAAGG  515
            |||||.||.||||||||.||||||||..|||||||||..||.|||||||||.||.||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GACTTCGGGGAGAAGTTGACTCGTCTAAGGGAACTTACTGGAGAGCTGCAGAGGAGGAAGGCAGCCTTGGAGGG  518

Query  516  TGTCTCCAAGGACCTTCAGGCAAGGTATAAAGCAGTTCTCCAGGAGTATGGGCATGAGGAGCGCAGGGTCCAGG  589
            .|||||||.|||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||.|..||||||
Sbjct  519  CGTCTCCAGGGATCTTCAGGCAAGGTATAAGGCTGTTCTTCAAGAATATGGCCATGAGGAACGCCGCATCCAGG  592

Query  590  ATGAGCTGGCTCGCTCTCGGAAGTTCTTCACAGGCTCTTTGGCTGAAGTTGAGAAGTCCAATAGTCAAGTGGTA  663
            |.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  AAGAGCTAGCCCGCTCTCGGAAGTTCTTCACAGGCTCCTTGGCTGAGGTTGAGAAGTCCAACAGTCAAGTGGTA  666

Query  664  GAGGAGCAGAGTTACCTGCTTAACATTGCAGAGGTGCAGGCTGTGTCTCGCTGTGACTACTTCCTGGCCAAGAT  737
            |||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  667  GAGGAGCAGAGCTACCTACTCAACATTGCTGAGGTGCAGGCCGTGTCTCGCTGTGACTACTTTCTAGCGAAGAT  740

Query  738  CAAGCAGGCAGATGTAGCACTACTGGAGGAGACAGCTGATGAGGAGGAGCCAGAGCTCACTGCCAGCTTGCCTC  811
            ||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.|
Sbjct  741  CAAGCAAGCTGATGTAGCCCTCCTGGAGGAGACAGCGGATGAGGAGGAGCCCGAGCTCACTGCCAGCCTACCCC  814

Query  812  GGGAGCTCACCCTGCAAGATGTGGAGCTCCTTAAGGTAGGTCATGTTGGCCCCCTCCAAATTGGACAAGCTGTT  885
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||
Sbjct  815  GGGAGCTTACCCTGCAAGATGTGGAGCTCCTTAAGGTAGGACACGTTGGTCCTCTGCAAATTGGCCAGGCTGTT  888

Query  886  AAGAAGCCCCGGACAGTTAACGTGGAAGATTCCTGGGCCATGGAGGCCA-----CAGCGTCTGCTGCCTCTACC  954
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||...|||||  |     ||||.|||.|||||||..||
Sbjct  889  AAGAAGCCCCGGACAGTTAACATGGAAGATTCCTGGGCAGGGGAGG--AGGGAGCAGCATCTTCTGCCTCAGCC  960

Query  955  TCTGTTACTTTTAGAGAGATGGACATGAGCCCGGAGGAAGTGGTTGCCAGCCCTAGGGCCTCACCTGCTAAACA  1028
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|.|||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct  961  TCGGTAACCTTTAGAGAGATGGACATGAGCCCTGAGGAAGTAGCTCCCAGCCCTAGGGCTTCCCCCGCGAAACA  1034

Query 1029  GCGGGGTCCTGAGGCAGCCTCCAATATCCAGCAGTGCCTCTTTCTCAAGAAGATGGGGGCCAAAGGCAGCACTC  1102
            ||||.||.||||||||||.|||..||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1035  GCGGAGTTCTGAGGCAGCTTCCGGTATCCAGCAGTGTCTGTTTCTCAAGAAGATGGGGGCGAAAGGCAGCACTC  1108

Query 1103  CAGGAATGTTCAATCTTCCAGTCAGTCTCTACGTGACCAGTCAAGGTGAAGTACTAGTCGCTGACCGTGGTAAC  1176
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1109  CCGGCATGTTCAATCTTCCAGTCAGTCTCTATGTGACCAGTCAGAGTGAGGTGCTGGTTGCCGACCGGGGCAAC  1182

Query 1177  TATCGTATACAAGTCTTTACCCGCAAAGGCTTTTTGAAGGAAATCCGCCGCAGCCCCAGTGGCATTGATAGCTT  1250
            ||||||||.|||||.||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1183  TATCGTATCCAAGTGTTCAACCGCAAAGGCTTTTTGAAGGAGATCCGCCGCAGCCCCAGCGGCATTGATAGCTT  1256

Query 1251  TGTGCTAAGCTTCCTTGGGGCAGATCTACCCAACCTCACTCCTCTCTCAGTGGCAATGAACTGCCAGGGGCTGA  1324
            .|||||||||||||||||.||.||..|.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1257  CGTGCTAAGCTTCCTTGGAGCCGACTTGCCCAATCTCACTCCACTTTCAGTGGCCATGAACTGCCATGGGCTGA  1330

Query 1325  TTGGTGTGACTGACAGCTATGATAACTCCCTCAAGGTATATACCTTGGATGGCCACTGCGTGGCCTGTCACAGG  1398
            |||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1331  TTGGTGTCACTGATAGCTACGACAACTCCCTTAAAGTCTATACCATGGATGGCCACTGTGTGGCCTGTCACAGG  1404

Query 1399  AGCCAGCTGAGCAAACCATGGGGTATCACAGCCTTGCCATCTGGCCAGTTTGTAGTAACCGATGTGGAAGGTGG  1472
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1405  AGCCAGCTGAGCAAACCATGGGGCATCACAGCCCTACCATCTGGCCAGTTTGTGGTGACTGACGTGGAAGGCGG  1478

Query 1473  AAAGCTTTGGTGTTTCACAGTTGATCGAGGATCAGGGGTGGTCAAATACAGCTGCCTATGTAGTGCTGTGCGGC  1546
            .|||||.|||||||||||.||.||.||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||
Sbjct 1479  GAAGCTCTGGTGTTTCACTGTAGACCGAGGAGCAGGAGTGGTCAAATACAGCTGCCTCTGCAGTGCTGTGAGGC  1552

Query 1547  CCAAATTTGTCACCTGTGATGCTGAGGGCACCGTCTACTTCACCCAGGGCTTAGGCCTCAATCTGGAGAATCGG  1620
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||.||.||.
Sbjct 1553  CCAAGTTTGTCACCTGTGATGCTGAAGGCACAGTCTACTTCACCCAAGGCTTGGGGCTCAATGTGGAAAACCGA  1626

Query 1621  CAGAATGAGCACCACCTGGAGGGTGGCTTTTCCATTGGCTCTGTAGGCCCTGATGGGCAGCTGGGTCGCCAGAT  1694
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1627  CAGAATGAACACCACCTGGAGGGTGGCTTCTCCATCGGTTCTGTTGGCCCCGATGGGCAGCTGGGCCGGCAAAT  1700

Query 1695  TAGCCACTTCTTCTCGGAGAATGAGGATTTCCGCTGCATTGCTGGCATGTGTGTGGATGCTCGTGGTGATCTCA  1768
            .||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1701  CAGCCACTTCTTCTCTGAGAATGAAGATTTCCGCTGCATCGCTGGCATGTGTGTAGATGCTCGGGGCGACCTCA  1774

Query 1769  TCGTGGCTGACAGTAGTCGCAAGGAAATTCTCCATTTTCCTAAGGGTGGGGGCTATAGTGTCCTTATTCGAGAG  1842
            |.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1775  TTGTGGCAGATAGCAGCCGCAAGGAAATTCTCCATTTTCCCAAGGGCGGTGGCTACAGCGTCCTTATTCGAGAG  1848

Query 1843  GGACTTACCTGTCCGGTGGGCATAGCCCTAACTCCTAAGGGGCAGCTGCTGGTCTTGGACTGTTGGGATCATTG  1916
            ||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1849  GGCCTTACCTGTCCAGTGGGCATCGCCCTCACACCCAAGGGGCAGCTGCTGGTCTTGGACTGTTGGGATCACTG  1922

Query 1917  CATCAAGATCTACAGCTACCATCTGAGAAGATATTCCACCCCA  1959
            |.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1923  CGTCAAGATCTACAGCTATCATCTGAGAAGATATTCCACCCCT  1965