Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02717
Subject:
XM_005245787.2
Aligned Length:
2988
Identities:
2979
Gaps:
9

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTACGCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTACGCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGAAGA  74

Query   75  CCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCCCTG  148

Query  149  GATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATCTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATCTTG  222

Query  223  TGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGATCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGATCAC  296

Query  297  TGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCCTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCCTGG  370

Query  371  ACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAGAAG  444

Query  445  ACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAGCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAGCAT  518

Query  519  CCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATGTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATGTGA  592

Query  593  ACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAGCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAGCAC  666

Query  667  CTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCAAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCAAAC  740

Query  741  TTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTGGAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTGGAT  814

Query  815  TCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTGTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTGTCC  888

Query  889  CCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGCCCT  962

Query  963  AGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGTGCAGAAAAGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGTGCAGAAAAGTA  1036

Query 1037  GCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTCAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTCAAT  1110

Query 1111  CAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAGCCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAGCCT  1184

Query 1185  GGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCTACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCTACC  1258

Query 1259  GGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTGGCAGGGAAGGTGGTGCTGTGGAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTGGCAGGGAAGGTGGTGCTGTGGAGC  1332

Query 1333  CGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGAGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGAGCT  1406

Query 1407  GGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGC---------AGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGTCTC  1471
            ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGCAGCAATTCAAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGTCTC  1480

Query 1472  AGCTTATCCTGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGTCAG  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCTTATCCTGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGTCAG  1554

Query 1546  ATTAAGAATGAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGTAAC  1619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATTAAGAATGAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGTAAC  1628

Query 1620  AGCCTCAGGCAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATGTCA  1693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGCCTCAGGCAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATGTCA  1702

Query 1694  AGCCAGACTCCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACCCTG  1767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCCAGACTCCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACCCTG  1776

Query 1768  CTGGTGAAGGACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCAGGT  1841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGTGAAGGACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCAGGT  1850

Query 1842  AGCTCCCCCAGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCAAGG  1915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGCTCCCCCAGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCAAGG  1924

Query 1916  TGTTGCTGTTGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTACAT  1989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGTTGCTGTTGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTACAT  1998

Query 1990  GAGCTTGCCCCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCGAAA  2063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGCTTGCCCCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCGAAA  2072

Query 2064  GGATCTCACCACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGGGGA  2137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGATCTCACCACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGGGGA  2146

Query 2138  AACGCAGCAGTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTGAAC  2211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AACGCAGCAGTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTGAAC  2220

Query 2212  CCCAACCTGCTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCTCAT  2285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCCAACCTGCTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCTCAT  2294

Query 2286  TGATGGCGTCACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGCATT  2359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGATGGCGTCACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGCATT  2368

Query 2360  CAGAGAACTGGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTCTAT  2433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CAGAGAACTGGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTCTAT  2442

Query 2434  GAGGGCACTGAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCAGCA  2507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAGGGCACTGAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCAGCA  2516

Query 2508  GTCCTATATCTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGACACC  2581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GTCCTATATCTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGACACC  2590

Query 2582  TGCTGATTGGACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAGATC  2655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGCTGATTGGACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAGATC  2664

Query 2656  CCAACAGAACAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATTCAT  2729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CCAACAGAACAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATTCAT  2738

Query 2730  CAACTATAACCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTTTGG  2803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CAACTATAACCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTTTGG  2812

Query 2804  TTGTGGCCTATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGATGAC  2877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TTGTGGCCTATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGATGAC  2886

Query 2878  TATGACTACGTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGCACA  2951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TATGACTACGTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGCACA  2960

Query 2952  GGTGAAGCTCCTGAATCGGGCCTGGCGA  2979
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GGTGAAGCTCCTGAATCGGGCCTGGCGA  2988