Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02721
• Subject: NM_001286748.2
• Aligned Length: 1284
• Identities: 1242
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGGCTGCCTCCATAGTGCGGCGCGGGATGCTCCTGGCGCGGCAAGTGGTTCTTCCTCAGCTCTCTCCTGCAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCCTCCATAGTGCGGCGCGGGATGCTCCTGGCGCGGCAAGTGGTTCTTCCTCAGCTCTCTCCTGCAGG  74

Query   75  TAAAAGATACCTGCTTTCTTCAGCCTATGTAGACAGCCACAAATGGGAAGCAAGAGAAAAAGAACATTACTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAAAGATACCTGCTTTCTTCAGCCTATGTAGACAGCCACAAATGGGAAGCAAGAGAAAAAGAACATTACTGTC  148

Query  149  TTGCTGATCTTGCATCTTTAATGGATAAAACATTTGAGAGAAAGTTGCCTGTTAGTTCTTTAACAATATCACGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGCTGATCTTGCATCTTTAATGGATAAAACATTTGAGAGAAAGTTGCCTGTTAGTTCTTTAACAATATCACGG  222

Query  223  CTTATAGACAACATTTCCTCTCGGGAAGAGATAGATCATGCAGAGTATTACCTTTACAA---------------  281
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct  223  CTTATAGACAACATTTCCTCTCGGGAAGAGATAGATCATGCAGAGTATTACCTTTACAAAAAGGGAGAATGCTC  296

Query  282  ---------------------------GTTTCGACACAGCCCCAACTGCTGGTACCTGAGAAACTGGACTATCC  328
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCCAGCAATCCACAGAATTATTCCAGGTTTCGACACAGCCCCAACTGCTGGTACCTGAGAAACTGGACTATCC  370

Query  329  ACACCTGGATTAGGCAGTGTCTAAAATATGATGCACAAGACAAAGCCCTATATACCCTTGTAAATAAGGTTCAA  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACACCTGGATTAGGCAGTGTCTAAAATATGATGCACAAGACAAAGCCCTATATACCCTTGTAAATAAGGTTCAA  444

Query  403  TATGGAATTTTTCCAGATAACTTTACATTCAATTTACTGATGGATTCTTTCATAAAGAAAGAAAATTACAAAGA  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGGAATTTTTCCAGATAACTTTACATTCAATTTACTGATGGATTCTTTCATAAAGAAAGAAAATTACAAAGA  518

Query  477  TGCTTTATCTGTGGTTTTTGAGGTCATGATGCAAGAAGCCTTTGAAGTGCCTTCCACCCAACTTCTCTCCCTCT  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTTTATCTGTGGTTTTTGAGGTCATGATGCAAGAAGCCTTTGAAGTGCCTTCCACCCAACTTCTCTCCCTCT  592

Query  551  ATGTTTTATTTCATTGCCTGGCAAAGAAGACAGACTTCAGTTGGGAAGAGGAGAGGAACTTTGGTGCATCCCTT  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTTTTATTTCATTGCCTGGCAAAGAAGACAGACTTCAGTTGGGAAGAGGAGAGGAACTTTGGTGCATCCCTT  666

Query  625  TTGCTTCCAGGCCTAAAACAAAAGAACTCAGTGGGTTTCAGTTCCCAGTTGTATGGCTATGCACTTCTTGGGAA  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGCTTCCAGGCCTAAAACAAAAGAACTCAGTGGGTTTCAGTTCCCAGTTGTATGGCTATGCACTTCTTGGGAA  740

Query  699  GGTGGAGTTGCAGCAAGGGCTACGGGCTGTGTACCACAACATGCCTCTGATATGGAAACCAGGCTACCTTGACA  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGGAGTTGCAGCAAGGGCTACGGGCTGTGTACCACAACATGCCTCTGATATGGAAACCAGGCTACCTTGACA  814

Query  773  GAGCCCTTCAAGTGATGGAGAAAGTGGCTGCCTCCCCAGAAGACATAAAGCTGTGTAGAGAAGCGCTCGATGTG  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGCCCTTCAAGTGATGGAGAAAGTGGCTGCCTCCCCAGAAGACATAAAGCTGTGTAGAGAAGCGCTCGATGTG  888

Query  847  CTGGGTGCAGTGCTGAAGGCTCTGACTTCAGCTGATGGGGCTTCAGAGGAGCAGTCCCAAAATGATGAAGACAA  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGGTGCAGTGCTGAAGGCTCTGACTTCAGCTGATGGGGCTTCAGAGGAGCAGTCCCAAAATGATGAAGACAA  962

Query  921  CCAGGGGTCAGAAAAACTGGTGGAGCAGTTAGACATCGAGGAAACAGAGCAGTCCAAGCTTCCTCAATACCTGG  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGGGGTCAGAAAAACTGGTGGAGCAGTTAGACATCGAGGAAACAGAGCAGTCCAAGCTTCCTCAATACCTGG  1036

Query  995  AACGATTTAAGGCCTTACATTCTAAGCTTCAAGCTCTGGGCAAAATTGAGTCAGAAGGTCTTTTAAGTCTGACC  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AACGATTTAAGGCCTTACATTCTAAGCTTCAAGCTCTGGGCAAAATTGAGTCAGAAGGTCTTTTAAGTCTGACC  1110

Query 1069  ACCCAGCTTGTCAAGGAAAAACTCTCCACCTGTGAAGCAGAGGACATCGCCACCTATGAGCAGAATCTGCAGCA  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCCAGCTTGTCAAGGAAAAACTCTCCACCTGTGAAGCAGAGGACATCGCCACCTATGAGCAGAATCTGCAGCA  1184

Query 1143  GTGGCATCTAGACCTTGTACAGTTGATCCAGAGAGAACAGCAACAGAGGGAGCAAGCGAAGCAGGAGTACCAGG  1216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTGGCATCTAGACCTTGTACAGTTGATCCAGAGAGAACAGCAACAGAGGGAGCAAGCGAAGCAGGAGTACCAGG  1258

Query 1217  CTCAGAAAGCAGCAAAGGCATCTGCC  1242
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCAGAAAGCAGCAAAGGCATCTGCC  1284