Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02721
• Subject: NM_001286751.2
• Aligned Length: 1242
• Identities: 1074
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGGCTGCCTCCATAGTGCGGCGCGGGATGCTCCTGGCGCGGCAAGTGGTTCTTCCTCAGCTCTCTCCTGCAGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAAAAGATACCTGCTTTCTTCAGCCTATGTAGACAGCCACAAATGGGAAGCAAGAGAAAAAGAACATTACTGTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGCTGATCTTGCATCTTTAATGGATAAAACATTTGAGAGAAAGTTGCCTGTTAGTTCTTTAACAATATCACGG  222
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGGATAAAACATTTGAGAGAAAGTTGCCTGTTAGTTCTTTAACAATATCACGG  54

Query  223  CTTATAGACAACATTTCCTCTCGGGAAGAGATAGATCATGCAGAGTATTACCTTTACAAGTTTCGACACAGCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  CTTATAGACAACATTTCCTCTCGGGAAGAGATAGATCATGCAGAGTATTACCTTTACAAGTTTCGACACAGCCC  128

Query  297  CAACTGCTGGTACCTGAGAAACTGGACTATCCACACCTGGATTAGGCAGTGTCTAAAATATGATGCACAAGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  CAACTGCTGGTACCTGAGAAACTGGACTATCCACACCTGGATTAGGCAGTGTCTAAAATATGATGCACAAGACA  202

Query  371  AAGCCCTATATACCCTTGTAAATAAGGTTCAATATGGAATTTTTCCAGATAACTTTACATTCAATTTACTGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  AAGCCCTATATACCCTTGTAAATAAGGTTCAATATGGAATTTTTCCAGATAACTTTACATTCAATTTACTGATG  276

Query  445  GATTCTTTCATAAAGAAAGAAAATTACAAAGATGCTTTATCTGTGGTTTTTGAGGTCATGATGCAAGAAGCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  GATTCTTTCATAAAGAAAGAAAATTACAAAGATGCTTTATCTGTGGTTTTTGAGGTCATGATGCAAGAAGCCTT  350

Query  519  TGAAGTGCCTTCCACCCAACTTCTCTCCCTCTATGTTTTATTTCATTGCCTGGCAAAGAAGACAGACTTCAGTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  TGAAGTGCCTTCCACCCAACTTCTCTCCCTCTATGTTTTATTTCATTGCCTGGCAAAGAAGACAGACTTCAGTT  424

Query  593  GGGAAGAGGAGAGGAACTTTGGTGCATCCCTTTTGCTTCCAGGCCTAAAACAAAAGAACTCAGTGGGTTTCAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  GGGAAGAGGAGAGGAACTTTGGTGCATCCCTTTTGCTTCCAGGCCTAAAACAAAAGAACTCAGTGGGTTTCAGT  498

Query  667  TCCCAGTTGTATGGCTATGCACTTCTTGGGAAGGTGGAGTTGCAGCAAGGGCTACGGGCTGTGTACCACAACAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  TCCCAGTTGTATGGCTATGCACTTCTTGGGAAGGTGGAGTTGCAGCAAGGGCTACGGGCTGTGTACCACAACAT  572

Query  741  GCCTCTGATATGGAAACCAGGCTACCTTGACAGAGCCCTTCAAGTGATGGAGAAAGTGGCTGCCTCCCCAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  GCCTCTGATATGGAAACCAGGCTACCTTGACAGAGCCCTTCAAGTGATGGAGAAAGTGGCTGCCTCCCCAGAAG  646

Query  815  ACATAAAGCTGTGTAGAGAAGCGCTCGATGTGCTGGGTGCAGTGCTGAAGGCTCTGACTTCAGCTGATGGGGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  ACATAAAGCTGTGTAGAGAAGCGCTCGATGTGCTGGGTGCAGTGCTGAAGGCTCTGACTTCAGCTGATGGGGCT  720

Query  889  TCAGAGGAGCAGTCCCAAAATGATGAAGACAACCAGGGGTCAGAAAAACTGGTGGAGCAGTTAGACATCGAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  TCAGAGGAGCAGTCCCAAAATGATGAAGACAACCAGGGGTCAGAAAAACTGGTGGAGCAGTTAGACATCGAGGA  794

Query  963  AACAGAGCAGTCCAAGCTTCCTCAATACCTGGAACGATTTAAGGCCTTACATTCTAAGCTTCAAGCTCTGGGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  AACAGAGCAGTCCAAGCTTCCTCAATACCTGGAACGATTTAAGGCCTTACATTCTAAGCTTCAAGCTCTGGGCA  868

Query 1037  AAATTGAGTCAGAAGGTCTTTTAAGTCTGACCACCCAGCTTGTCAAGGAAAAACTCTCCACCTGTGAAGCAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  AAATTGAGTCAGAAGGTCTTTTAAGTCTGACCACCCAGCTTGTCAAGGAAAAACTCTCCACCTGTGAAGCAGAG  942

Query 1111  GACATCGCCACCTATGAGCAGAATCTGCAGCAGTGGCATCTAGACCTTGTACAGTTGATCCAGAGAGAACAGCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  GACATCGCCACCTATGAGCAGAATCTGCAGCAGTGGCATCTAGACCTTGTACAGTTGATCCAGAGAGAACAGCA  1016

Query 1185  ACAGAGGGAGCAAGCGAAGCAGGAGTACCAGGCTCAGAAAGCAGCAAAGGCATCTGCC  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017  ACAGAGGGAGCAAGCGAAGCAGGAGTACCAGGCTCAGAAAGCAGCAAAGGCATCTGCC  1074