Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02727
• Subject: NM_183017.2
• Aligned Length: 1946
• Identities: 1659
• Gaps: 43

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCGAG--CGGGGTCCCGAGCGCCGGCCTGCGGAGCGTAGCAGCCCGGGCCAGACGCCG-GAG---GA  68
            ||||||..|.||  ||||   |||     |.|||||         ||||.||.||||  .||||| |||   ||
Sbjct    1  ATGGAGATCCAGTCCGGG---CCG-----CAGCCTG---------GCAGTCCCGGCC--GCGCCGAGAGGCTGA  55

Query   69  GGGCGCGCAGGCCTTGGCCGAGTTCGCGGCGCTGCACGGCCCGGCGCTGCGCGCTTCGGGGGTCCCCGAACGTT  142
            ..|||||...||  |||.||||||||.|.|||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||.||.||  
Sbjct   56  ACGCGCGGCTGC--TGGACGAGTTCGTGTCGCTGCACGGCCCTACGCTGCGCGCCTCGGGAGTCCCAGAGCG--  125

Query  143  AC--TGGGGCCGCCTCCTGCACAAGCTGGAGCACGAGGTTTTCGACGCTGGGGAAGTGTTTGGGATCATGCAAG  214
            ||  |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|
Sbjct  126  ACTATGGGGCCGCCTTCTGCACAAGCTGGAGCACGAGGTTTTCGATGCCGGGGAGATGTTTGGGATAATGCAGG  199

Query  215  TGGAGGAGGTAGAAGAGGAGGAGGACGAGGCAGCCCGGGAGGTGCGGAAGCAGCAGCCCAACCCGGGGAACGAG  288
            ||||||||||.||.||||..|||||||||||.|||.||||||..|.||.|.|||||||||||||.|||..||||
Sbjct  200  TGGAGGAGGTGGAGGAGGCTGAGGACGAGGCCGCCAGGGAGGCTCAGAGGAAGCAGCCCAACCCTGGGGGCGAG  273

Query  289  CTGTGCTACAAGGTCATCGTGACCAGGGAGAGCGGGCTCCAGGCAGCCCACCCCAACAGCATCTTCCTCATCGA  362
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|||.|||.|.|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  CTGTGCTACAAGGTCATTGTGACCAGTGAGAGCGGCGTCCGGGCTGACGACCCCAACAGCATCTTCCTCATCGA  347

Query  363  CCACGCCTGGACGTGCCGTGTGGAGCACGCGCGCCAGCAGCTGCAGCAGGTGCCCGGGCTGCTGCACCGCATGG  436
            |||.|||||||||||||||||||||||.||.|||.|.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  348  CCATGCCTGGACGTGCCGTGTGGAGCATGCACGCAAACAGCTGCAGCAGGTACCTGGACTCCTGCACCGGATGG  421

Query  437  CCAACCTGATGGGCATTGAGTTCCACGGTGAGCTGCCCAGTACAGAGGCTGTGGCCCTGGTGCTGGAGGAGATG  510
            |||||||.||||||||.||||||||.||.||..|||||||..||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  422  CCAACCTCATGGGCATCGAGTTCCATGGGGAAGTGCCCAGCCCAGAGGTTGTGGCCCTAGTGCTGGAGGAGATG  495

Query  511  TGGAAGTTCAACCAGACCTACCAGCTGGCCCATGGGACAGCTGAGGAGAAGATGCCGGTGTGGTATATCATGGA  584
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||
Sbjct  496  TGGAAATTCAACCAGACCTATCAGCTGGCCCATGGGACAGCCGAAGAGAAGGTGCCAGTGTGGTACATCATGGA  569

Query  585  CGAGTTCGGTTCGCGGATCCAGCACGCGGACGTGCCCAGCTTCGCCACGGCACCCTTCTTCTACATGCCGCAGC  658
            ||||||.||.|||.|||||||||||.|.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  570  CGAGTTTGGCTCGAGGATCCAGCACTCAGACATGCCCAGCTTCGCCACTGCTCCCTTCTTCTACATGCCCCAGC  643

Query  659  AGGTGGCCTACACGCTGCTGTGGCCCCTGAGGGACCTGGACACTGGCGAGGAGGTGACCCGAGACTTTGCCTAC  732
            |||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  644  AGGTGGCATACACGCTGCTGTGGCCCCTAAGGGACCTAGACACAGGCGAGGAGGTGACCCGGGACTTTGCCTAC  717

Query  733  GGAGAGACGGACCCCCTGATCCGGAAGTGCATGCTGCTGCCCTGGGCCCCCACCGACATGCTGGACCTCAGCTC  806
            ||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct  718  GGAGAGGCAGACCCTCTGATCCGGAAATGCATGCTGCTGCCCTGGGCCCCCGCCGACATGCTGGACCTCAGCTT  791

Query  807  TTGCACACCCGAGCCGCCCGCCGAGCACTACCAGGCCATTCTGGAGGAAAACAAGGAGAAGCTGCCACTTGACA  880
            .|..||.||.|||||.||.|||.||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.||.|.||
Sbjct  792  CTCTACGCCTGAGCCTCCTGCCAAGTACTACCAGGCCATTTTGGAGGAGAACAAGGAGAAACTGCCGCTCGCCA  865

Query  881  TCAACCCCGTGGTGCAC--CCCCACGGCCACATCTTCAAGGTCTACACGGACGTGCAGCAGGT----GGCCAGC  948
            |.|.|||.|||  ||||  |||||.||||||.||||||..|||.||...||||||||||||||    |||||  
Sbjct  866  TTAGCCCAGTG--GCACGTCCCCAGGGCCACGTCTTCAGAGTCCACTGCGACGTGCAGCAGGTGCTCGGCCA--  935

Query  949  AGCCTCACCCACCCGCGCTTCACCCTCACCCAGAGTGAGGCGGACGCCGACATCCTCTTCAACTTCTCACACTT  1022
              |||.||||||||.|||||||||.||||..|.||.|||||.||.|||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  936  --CCTTACCCACCCTCGCTTCACCTTCACTGATAGCGAGGCTGATGCCGACATCTTCTTCCACTTCTCACACTT  1007

Query 1023  CAAGGACTACAGGAAACTCAGCCAGGAGAGGCCAGGCGTGCTGCTGAACCAGTTCCCCTGCGAGAACCTGCTGA  1096
            |||||||||||.||||||||||||.|||||.|||...|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1008  CAAGGACTACATGAAACTCAGCCAAGAGAGCCCACAGGTGCTACTCAACCAGTTCCCCTGTGAGAATCTGCTGA  1081

Query 1097  CTGTCAAGGACTGCCTGGCCTCCATCGCGCGCCGGGCAGGTGGCCCCGAGGGCCCACCCTGGCTGCCCCGAACC  1170
            ||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1082  CTGTTAAGGACTGTCTGGCCTCCATCGCTCGCCGGGCTGGGGGTCCTGAGGGTCCCCCCTGGCTACCCCGAACC  1155

Query 1171  TTCAACCTGCGCACTGAGCTGCCCCAGTTTGTCAGCTACTTCCAGCAGCGGGAAAGGTGGGGCGAGGACAACCA  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||||||||
Sbjct 1156  TTCAACCTGCGCACTGAGCTGCCCCAGTTTGTCAGCTATTTCCAGCACCGGGAGAGGCGGGGTGAAGACAACCA  1229

Query 1245  CTGGATCTGCAAGCCCTGGAACCTGGCGCGCAGCCTGGACACCCACGTCACCAAGAGCCTGCACAGCATCATCC  1318
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|.|||.|||||.|||||.|
Sbjct 1230  CTGGATCTGCAAGCCCTGGAACCTGGCCCGCAGCCTGGACACTCACGTCACCAACAACCTCCACAGTATCATTC  1303

Query 1319  GGCACCGAGAGAGCACCCCCAAGGTTGTGTCCAAGTACATCGAAAGTCCCGTGTTGTTCCTTCGAGAAGACGTG  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1304  GGCACCGAGAGAGCACCCCCAAGGTTGTGTCCAAGTACATCGAAAGTCCCGTCTTGTTCCTCCGAGAAGATGTG  1377

Query 1393  GGAAAGGTCAAGTTCGACATCCGCTACATCGTGCTGCTGCGGTCAGTGAGGCCCCTACGGTTGTTCGTGTATGA  1466
            ||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||..|||||||.|..||.||
Sbjct 1378  GGGAACGTCAAGTTTGACATCCGCTACATTGTGCTGCTGCGCTCAGTGAGGCCGCTGAGGTTGTTTGCTTACGA  1451

Query 1467  TGTGTTCTGGCTGCGGTTCTCCAACCGGGCCTTTGCACTCAACGACCTGGATGACTACGAGAAGCACTTCACGG  1540
            ||||||.|||||.||.||||||||.|||.||||.||.|||.|.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1452  TGTGTTTTGGCTACGCTTCTCCAATCGGCCCTTCGCCCTCGATGACCTAGACGACTATGAGAAGCATTTCACCG  1525

Query 1541  TCATGAACTATGACCCGGATGTGGTGCTGAAGCAGGTGCACTGTGAAGAGTTCATCCCCGAGTTTGAGAAGCAA  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||..|||||||||||||.
Sbjct 1526  TCATGAACTATGACCCGGATGTGGTGCTGAAGCAGGTGCACTATAATGAGTTCATCCCTCAGTTTGAGAAGCAG  1599

Query 1615  TACCCAGAATTTCCCTGGACGGACGTCCAGGCTGAGATCTTCCGGGCCTTCACGGAGCTGTTCCAGGTGGCCTG  1688
            ||||||||.||||||||||..||.||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1600  TACCCAGAGTTTCCCTGGAGTGATGTTCAGGCTGAGATCTTCAAGGCCTTCACGGAGCTGTTCCAAGTGGCATG  1673

Query 1689  TGCCAAGCCACCACCCCTGGGCCTCTGCGACTACCCCTCATCCCGGGCCATGTATGCCGTCGACCTCATGCTGA  1762
            ||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|
Sbjct 1674  TGCCAAGCCACCGCCCATGGGCCTCTGTGACTACCCCTCATCCCGGGCCATGTATGCCATTGATCTCATGCTCA  1747

Query 1763  AGTGGGACAACGGCCCAGATGGAAGGCGGGTGATGCAGCCGCAGATCCTGGAGGTGAACTTCAACCCCGACTGT  1836
            |.|||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1748  ACTGGGACAACCACCCAGATGGAAAGCGGGTGATGCAGCCCCAAATCCTGGAGGTGAACTTCAACCCCGACTGC  1821

Query 1837  GAGCGAGCCTGCAGGTACCACCCCACCTTCTTCAACGACGTCTTCAGCACCTTGTTTCTGGACCAGCCCGGTGG  1910
            ||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||.||.|.|....
Sbjct 1822  GAGCGAGCCTGCAGATACCACCCCTCATTCTTCAATGATGTCTTCAGCACTTTGTTTCTGGACGAGACTGACAA  1895

Query 1911  CTGCCACGTTACCTGCCTTGTC  1932
            ||||||.||.|||.||.|..||
Sbjct 1896  CTGCCATGTCACCCGCATCATC  1917