Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02740
• Subject: NM_001033329.3
• Aligned Length: 1552
• Identities: 1442
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ----ATGACGTTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCA  70
                |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATGAC----CTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCA  70

Query   71  ACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGC  144
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  ACCGGGAGTTGGCATTTAAGGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGC  144

Query  145  CAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGA  218
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  145  CAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGGGGTGGA  218

Query  219  GGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTAC  292
            |||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  219  GGAAGGGCCCAGTGATGTGCAGAATGGGCACCTGGACCCCAACTCAGACTGCCTTTGTCTGGGCCGGCCACTAC  292

Query  293  AGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  293  AGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATCATGAGCACGGAGCGCCATTACATCAAGCACCTC  366

Query  367  AAGGATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGT  440
            |||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  367  AAGGACATTTGCGAGGGCTACCTGAAGCAGTGCCGAAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAGCTGAAGGT  440

Query  441  AATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACA  514
            .||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  441  CATCTTTGGAAACATTGAAGACATATACAGATTTCAGATGGGCTTCGTGAGAGACCTGGAGAAGCAGTACAACA  514

Query  515  ATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAG  588
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  515  ATGATGATCCCCACCTCAGTGAGATAGGACCCTGCTTCTTAGAGCATCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAA  588

Query  589  TATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTT  662
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  589  TATTGTAACAACCACCTGGATGCCTGCATGGAACTCTCCAAGCTGATGAAGGACAGCCGCTATCAACACTTCTT  662

Query  663  TGAGGCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGA  736
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  663  TGAGGCCTGCCGCCTCTTGCAGCAGATGATCGACATTGCTATTGATGGTTTTCTTTTGACTCCAGTACAGAAGA  736

Query  737  TCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTG  810
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.
Sbjct  737  TCTGCAAATATCCCTTACAATTGGCCGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGATCACAGTGATTACAGATACGTT  810

Query  811  GCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGA  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  811  GCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAATGAACGCAAGCGACGTCTGGAGAATATTGA  884

Query  885  CAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGA  958
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CAAGATTGCGCAATGGCAGGCCTCTGTCCTAGACTGGGAGGGAGAGGACATCTTAGACAGGAGCTCGGAGCTGA  958

Query  959  TCTACACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGAC  1032
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  959  TCTACACTGGAGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTATGGCCGCAACCAGCAGAGAGTCTTCTTCCTGTTTGAC  1032

Query 1033  CACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGA  1106
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1033  CACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTATACTACAAGGGGCGCATTGACATGGA  1106

Query 1107  TAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGC  1180
            |||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1107  TAAATATGAGGTAATTGACATCGAAGATGGCAGAGATGATGACTTTAATGTCAGCATGAAAAATGCTTTCAAGC  1180

Query 1181  TTCACAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGG  1254
            ||||.||||||||.||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1181  TTCATAACAAGGAAACGGAAGAAGTGCATCTGTTCTTTGCCAAGAAACTGGAGGAGAAAATACGTTGGCTTAGA  1254

Query 1255  GCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAG  1328
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1255  GCTTTCAGAGAAGAGAGAAAAATGGTACAAGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAGATTTCTGAAAATCAGAAGAG  1328

Query 1329  GCAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCT  1402
            .|||||||||||||||||||||||||...||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  ACAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGCTTCTAAACAGAAAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCT  1402

Query 1403  ACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTT  1476
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1403  ACCCACCACCACAGGACCCGTTAAACCAGGGCCAGTACCTGGTCCCCGATGGCATCGCTCAGTCTCAAGTGTTT  1476

Query 1477  GAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1548
            ||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  GAGTTCACTGAACCGAAACGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGTAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1548