Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02740
- Subject:
- NM_001353922.2
- Aligned Length:
- 1569
- Identities:
- 1414
- Gaps:
- 153
Alignment
Query 1 ATGACGT---------------------TGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGA 53
|||..|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGTGGATAAGGGGCGGATCGGGAATGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGA 74
Query 54 TCACGTCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACA 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCACGTCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACA 148
Query 128 AGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAAC 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAAC 222
Query 202 CAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTG 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTG 296
Query 276 TCTGGGGCGGCCACTACAGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTC 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTGGGGCGGCCACTACAGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTC 370
Query 350 ACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGT 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGT 444
Query 424 GACGAGCAACTGAAGGTAATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCT 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACGAGCAACTGAAGGTAATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCT 518
Query 498 GGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGAT 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGAT 592
Query 572 TCTGGATATACTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGC 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTGGATATACTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGC 666
Query 646 CGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTT 740
Query 720 GACTCCAGTGCAGAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACA 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GACTCCAGTGCAGAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACA 814
Query 794 GTGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGA 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGA 888
Query 868 CGTTTAGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGA 941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGTTTAGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGG------------------- 943
Query 942 CAGGAGCTCGGAGCTGATCTACACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGG 1015
Sbjct 944 -------------------------------------------------------------------------- 943
Query 1016 TCTTCTTCCTGTTTGACCACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAA 1089
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 ---------------------------------------AGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAA 978
Query 1090 GGCCGCATTGACATGGATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCAT 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 GGCCGCATTGACATGGATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCAT 1052
Query 1164 GAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAA 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 GAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAA 1126
Query 1238 AAATACGCTGGCTCAGGGCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATT 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 AAATACGCTGGCTCAGGGCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATT 1200
Query 1312 TCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCG 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCG 1274
Query 1386 CTCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCG 1459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 CTCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCG 1348
Query 1460 CTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTA 1533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 CTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTA 1422
Query 1534 ACCCCCTTCAAAAAA 1548
|||||||||||||||
Sbjct 1423 ACCCCCTTCAAAAAA 1437