Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02740
• Subject: NM_001369045.1
• Aligned Length: 1548
• Identities: 1002
• Gaps: 546

Alignment

Query    1  ATGACGTTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATC  444
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------ATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATC  30

Query  445  TTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   31  TTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGA  104

Query  519  TGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  105  TGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATT  178

Query  593  GTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  GTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAG  252

Query  667  GCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  253  GCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTG  326

Query  741  CAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  327  CAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAG  400

Query  815  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  401  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAG  474

Query  889  ATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  475  ATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGG----------------------------------------  508

Query  963  CACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  1036
                                                                                      
Sbjct  509  --------------------------------------------------------------------------  508

Query 1037  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAA  1110
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  ------------------AGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAA  564

Query 1111  TATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  TATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCA  638

Query 1185  CAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  CAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTT  712

Query 1259  TCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  TCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAG  786

Query 1333  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTACCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTACCC  860

Query 1407  ACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  ACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGT  934

Query 1481  TCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  TCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1002