Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02742
• Subject: NM_001018000.3
• Aligned Length: 1245
• Identities: 981
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGGGCGGCCGACTCGGGCTCGTGGGAGCGCGTCCGCCAGCTCGCGGCGCAGGGCGAGCCGGCGCCTTCCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGGGGCGGGGGCCGGGCCCGCGCGGCCCCCGGGACCCGCAGCCTGCGAGCAGTGCGTGGACGCGGCGGGGCCCG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCGATCGGCCCCGCGCCGGGGTTCCCCGGGTCCGAGCGGATGGCGACTGCAGCCAGCCCGTGCTCCTGCGGGAA  222

Query    1  ------------------------------------------ATGAAGGAGATGTTGGCGAAGGACCTGGAGGA  32
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGTGTCGCGGCTCCAGGAGGAAGTTCACCTTCTCCGGCAGATGAAGGAGATGTTGGCGAAGGACCTGGAGGA  296

Query   33  GTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGGCCCAGAAGGAGCAGG  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGGCCCAGAAGGAGCAGG  370

Query  107  AGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAGGGCGAGAAGACAGAC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAGGGCGAGAAGACAGAC  444

Query  181  CTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCGAGACTTCATCCGCAA  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCGAGACTTCATCCGCAA  518

Query  255  CTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGGACCTGCTGGAGCGTG  328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGGACCTGCTGGAGCGTG  592

Query  329  AGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGCTCCCAGCTGGACCTC  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGCTCCCAGCTGGACCTC  666

Query  403  AAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGCTACGCTGACCAAGGA  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGCTACGCTGACCAAGGA  740

Query  477  CGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGGAGTGGGTGGTGCAGG  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGGAGTGGGTGGTGCAGG  814

Query  551  CGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACACCCCCCTCACCCTGCG  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACACCCCCCTCACCCTGCG  888

Query  625  GACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGACGCATCTGCCGCCGA  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGACGCATCTGCCGCCGA  962

Query  699  AGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCCTCTGCAACGGCGACA  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCCTCTGCAACGGCGACA  1036

Query  773  GTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTTGAAGACCAAAAACGG  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTTGAAGACCAAAAACGG  1110

Query  847  AAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAAGCAGCGGAAGTCCCT  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAAGCAGCGGAAGTCCCT  1184

Query  921  CGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACTGG  981
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACTGG  1245