Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02742
- Subject:
- NM_001370231.1
- Aligned Length:
- 1260
- Identities:
- 981
- Gaps:
- 279
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTTATAAGGGGTGTGCGGGCGTGGAGTTATTTTAATGGATTTACTCTCCGTGGGGACTCCAGGCTTTCTCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGTCTGCTTTTTGGATGCCTTCAAGAGAGGCCAGTTAGAGGATATCAATTGTGGCAATTCCCCAGAGCCCTCAT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAGATGGCATTAGCCCGTCATGTGCTGCAGTGGCACCCAGTTTGGAGGAAATTCGGAACCAGAAGAGTGTGACA 222
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGAAGGAGATGTTGGC 17
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Sbjct 223 GTGCTCCTGCGGGAAGAAGTGTCGCGGCTCCAGGAGGAAGTTCACCTTCTCCGGCAGATGAAGGAGATGTTGGC 296
Query 18 GAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGG 91
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Sbjct 297 GAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGG 370
Query 92 CCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAG 165
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Sbjct 371 CCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAG 444
Query 166 GGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCG 239
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Sbjct 445 GGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCG 518
Query 240 AGACTTCATCCGCAACTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGG 313
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Sbjct 519 AGACTTCATCCGCAACTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGG 592
Query 314 ACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGC 387
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Sbjct 593 ACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGC 666
Query 388 TCCCAGCTGGACCTCAAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGC 461
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Sbjct 667 TCCCAGCTGGACCTCAAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGC 740
Query 462 TACGCTGACCAAGGACGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGG 535
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Sbjct 741 TACGCTGACCAAGGACGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGG 814
Query 536 AGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACAC 609
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Sbjct 815 AGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACAC 888
Query 610 CCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGA 683
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Sbjct 889 CCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGA 962
Query 684 CGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCC 757
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Sbjct 963 CGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCC 1036
Query 758 TCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTT 831
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Sbjct 1037 TCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTT 1110
Query 832 GAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAA 905
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Sbjct 1111 GAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAA 1184
Query 906 GCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACT 979
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Sbjct 1185 GCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACT 1258
Query 980 GG 981
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Sbjct 1259 GG 1260