Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02742
• Subject: NM_015209.2
• Aligned Length: 1263
• Identities: 981
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGATGGAAGACAATAAGCAGCTCGCGCTCCGCATCGATGGGGCGGTCCAGTCGGCCAGCCAGGAGGTGACCAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTGCGAGCCGAACTCACGGCCACCAACCGGAGACTGGCGGAACTGAGCGGCGGCGGCGGCCCCGGCCCGGGCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CGGGAGCCGCGGCCAGCGCCTCGGCGGCGGGGGACTCGGCGGCGACGAACATGGAGAACCCCCAGCTTGGAGCG  222

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGAAGGAGATGTT  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGTGCTCCTGCGGGAAGAAGTGTCGCGGCTCCAGGAGGAAGTTCACCTTCTCCGGCAGATGAAGGAGATGTT  296

Query   15  GGCGAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGC  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCGAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGC  370

Query   89  TGGCCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTA  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGCCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTA  444

Query  163  AAGGGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCT  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCT  518

Query  237  CCGAGACTTCATCCGCAACTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGA  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGAGACTTCATCCGCAACTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGA  592

Query  311  AGGACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTG  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTG  666

Query  385  CGCTCCCAGCTGGACCTCAAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTT  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCTCCCAGCTGGACCTCAAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTT  740

Query  459  AGCTACGCTGACCAAGGACGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACC  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCTACGCTGACCAAGGACGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACC  814

Query  533  AGGAGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCA  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGAGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCA  888

Query  607  CACCCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTC  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACCCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTC  962

Query  681  CGACGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACT  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGACGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACT  1036

Query  755  CCCTCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGAT  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCTCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGAT  1110

Query  829  CTTGAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGG  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTGAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGG  1184

Query  903  GAAGCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGG  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGG  1258

Query  977  ACTGG  981
            |||||
Sbjct 1259  ACTGG  1263