Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02746
• Subject: NM_134015.3
• Aligned Length: 1689
• Identities: 1460
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCAT------------------------------  44
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||                              
Sbjct    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAAGACAAGACCATCGAGCTCATGTGTTCTGTGCCAAGGTCTTTGTGGCTAGG  74

Query   45  ------------------------------------------------------------------------GA  46
                                                                                    ||
Sbjct   75  CTGCGCCAACCTGGTAGAGAGCATGTGCGCACTGAGTTGCCTGCAGAGCATGCCCAGTGTCAGATGTCTCCAGA  148

Query   47  ACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAGTGCTCTTTGGCAGATCAGTAATGGA  222

Query  121  ACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAA  194
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  ACGTCATCTGTGATTGTCTCCAGAAAGAGGCCGTCAGAGGGGAACTACCAGAAAGAAAAGGACTTGTGCATTAA  296

Query  195  ATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATC  268
            .||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  GTACTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGATCAGGTGGAATTTGTGGAGCATCTTATCTCACGGATGTGTCATTATC  370

Query  269  AGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGC  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATCACTGCTTTACCAGAGCAAGGC  444

Query  343  TTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAA  416
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  TTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTCTCCTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTGTGTAA  518

Query  417  AGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCC  490
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct  519  AGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGGATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAGAGGATGGTGCGCACCGACCCTC  592

Query  491  TATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCA  564
            |.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  TCTGGAAGGGACTCTCAGAAAGAAGAGGCTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCTACAGATGGCCCTCCC  666

Query  565  AATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGG  638
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  AACTCATTTTATAGATCATTATACCCAAAGATTATCCAGGACATAGAGACCATAGAATCCAACTGGCGGTGTGG  740

Query  639  ACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATG  712
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  741  ACGACACAACTTGCAGAGGATCCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAGGGTGTCTACTGTTTGCAATATGATGATG  814

Query  713  AAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTG  786
            |.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAAAATTATCAGTGGCCTCCGGGACAACTCTATCAAGATCTGGGATAAAAGCAGCTTGGAATGTTTGAAAGTG  888

Query  787  TTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTC  860
            .||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  889  CTAACGGGCCACACAGGCTCTGTCCTCTGCCTCCAGTATGATGAGCGAGTCATTGTAACTGGTTCTTCAGACTC  962

Query  861  TACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGC  934
            .|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.||.|||.|||
Sbjct  963  CACGGTGAGAGTCTGGGATGTGAACACTGGTGAGGTGCTCAACACACTCATCCACCACAATGAAGCCGTACTGC  1036

Query  935  ACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCT  1008
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGTGACTTGTTCCAAGGACCGTTCCATTGCCGTGTGGGACATGGCTTCT  1110

Query 1009  GCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAA  1082
            ||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111  GCCACCGATATCACTTTACGCCGTGTTCTGGTTGGCCACCGTGCTGCTGTCAATGTAGTAGACTTTGATGATAA  1184

Query 1083  GTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTC  1156
            .||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1185  ATACATCGTGTCTGCTTCAGGAGACAGGACCATTAAAGTGTGGAGCACGAGCACATGTGAGTTTGTCCGCACTC  1258

Query 1157  TCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAAT  1230
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAATGGGCACAAGCGAGGCATCGCCTGTCTGCAGTACCGCGACCGGCTTGTTGTTAGTGGATCATCAGATAAT  1332

Query 1231  ACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATG  1304
            |||||..||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1333  ACCATCCGGTTATGGGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGGCACGAAGAATTGGTCCGGTG  1406

Query 1305  CATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTG  1378
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1407  CATCCGTTTTGATAACAAGAGGATTGTCAGTGGCGCCTATGATGGGAAGATTAAAGTCTGGGACTTGCAGGCTG  1480

Query 1379  CTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGG  1452
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCTTGACCCTCGGGCCCCAGCAAGCACATTGTGTCTGCGCACCTTGGTGGAACACTCTGGACGTGTGTTTCGG  1554

Query 1453  CTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGT  1526
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGT  1628

Query 1527  GCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1587
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1629  GCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGCTCTCCCTCCAGAACCTACACCTATATCTCCAGA  1689