Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02746
• Subject: XM_005265855.5
• Aligned Length: 1689
• Identities: 1587
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCAT------------------------------  44
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATGTGTTCTGTGCCAAGGTCTTTGTGGCTAGG  74

Query   45  ------------------------------------------------------------------------GA  46
                                                                                    ||
Sbjct   75  CTGCGCCAACCTGGTAGAGAGCATGTGCGCACTGAGTTGCCTGCAGAGCATGCCCAGTGTCAGATGTCTCCAGA  148

Query   47  ACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGA  222

Query  121  ACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAA  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAA  296

Query  195  ATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATC  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATC  370

Query  269  AGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGC  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGC  444

Query  343  TTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAA  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAA  518

Query  417  AGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCC  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCC  592

Query  491  TATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCA  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCA  666

Query  565  AATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGG  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGG  740

Query  639  ACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATG  814

Query  713  AAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTG  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTG  888

Query  787  TTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTC  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTC  962

Query  861  TACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGC  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGC  1036

Query  935  ACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCT  1110

Query 1009  GCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAA  1184

Query 1083  GTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTC  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTC  1258

Query 1157  TCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAAT  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAAT  1332

Query 1231  ACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATG  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATG  1406

Query 1305  CATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTG  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTG  1480

Query 1379  CTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGG  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGG  1554

Query 1453  CTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGT  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGT  1628

Query 1527  GCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1587
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1689