Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02746
• Subject: XM_005265857.2
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1545
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATGAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGA  74
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGA  32

Query   75  AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA  106

Query  149  GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT  180

Query  223  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA  254

Query  297  GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255  GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT  328

Query  371  CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA  402

Query  445  ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG  476

Query  519  GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA  550

Query  593  AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC  624

Query  667  CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA  698

Query  741  TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  699  TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT  772

Query  815  GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG  846

Query  889  GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847  GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT  920

Query  963  GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  921  GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC  994

Query 1037  TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  995  TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG  1068

Query 1111  ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069  ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG  1142

Query 1185  TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143  TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG  1216

Query 1259  GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217  GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC  1290

Query 1333  AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291  AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC  1364

Query 1407  ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365  ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA  1438

Query 1481  GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439  GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT  1512

Query 1555  TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1587
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513  TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1545