Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02746
- Subject:
- XM_006514433.2
- Aligned Length:
- 1601
- Identities:
- 1445
- Gaps:
- 22
Alignment
Query 1 ATG-GAGCCCGACTCGGTGA-TTG-----AGGACAAGACCA---TCGAG----CTCATGAACACTTCAGTTATG 60
||| |.||.| ||| ||| ||..||.|.||| || || |||..||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGCGCAC-------TGAGTTGCCTGCAGAGCATGCCCAGTGTC-AGATGTCTCCAGAACACTTCAGTTATG 66
Query 61 GAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGAT 134
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 67 GAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAGTGCTCTTTGGCAGATCAGTAATGGAACGTCATCTGTGAT 140
Query 135 CGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGT 208
.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 141 TGTCTCCAGAAAGAGGCCGTCAGAGGGGAACTACCAGAAAGAAAAGGACTTGTGCATTAAGTACTTTGACCAGT 214
Query 209 GGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATT 282
||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 GGTCTGAATCAGATCAGGTGGAATTTGTGGAGCATCTTATCTCACGGATGTGTCATTATCAGCATGGACATATT 288
Query 283 AACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGC 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 AACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATCACTGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGC 362
Query 357 AGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAG 430
||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 363 AGAAAACATTCTCTCCTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTGTGTAAAGAATGGCAGCGAG 436
Query 431 TGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTT 504
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct 437 TGATCTCAGAAGGGATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAGAGGATGGTGCGCACCGACCCTCTCTGGAAGGGACTC 510
Query 505 TCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAG 578
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 511 TCAGAAAGAAGAGGCTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCTACAGATGGCCCTCCCAACTCATTTTATAG 584
Query 579 GTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGC 652
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 ATCATTATACCCAAAGATTATCCAGGACATAGAGACCATAGAATCCAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGC 658
Query 653 AGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGT 726
|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 659 AGAGGATCCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAGGGTGTCTACTGTTTGCAATATGATGATGACAAAATTATCAGT 732
Query 727 GGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACAC 800
|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||.||.|||||
Sbjct 733 GGCCTCCGGGACAACTCTATCAAGATCTGGGATAAAAGCAGCTTGGAATGTTTGAAAGTGCTAACGGGCCACAC 806
Query 801 AGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGT 874
|||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 807 AGGCTCTGTCCTCTGCCTCCAGTATGATGAGCGAGTCATTGTAACTGGTTCTTCAGACTCCACGGTGAGAGTCT 880
Query 875 GGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGC 948
|||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 881 GGGATGTGAACACTGGTGAGGTGCTCAACACACTCATCCACCACAATGAAGCCGTACTGCACTTACGCTTCAGC 954
Query 949 AATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCAC 1022
|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 955 AATGGACTGATGGTGACTTGTTCCAAGGACCGTTCCATTGCCGTGTGGGACATGGCTTCTGCCACCGATATCAC 1028
Query 1023 TTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTG 1096
||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1029 TTTACGCCGTGTTCTGGTTGGCCACCGTGCTGCTGTCAATGTAGTAGACTTTGATGATAAATACATCGTGTCTG 1102
Query 1097 CCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAG 1170
|.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1103 CTTCAGGAGACAGGACCATTAAAGTGTGGAGCACGAGCACATGTGAGTTTGTCCGCACTCTGAATGGGCACAAG 1176
Query 1171 CGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTG 1244
||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||.|.||
Sbjct 1177 CGAGGCATCGCCTGTCTGCAGTACCGCGACCGGCTTGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATCCGGTTATG 1250
Query 1245 GGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATA 1318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1251 GGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGGCACGAAGAATTGGTCCGGTGCATCCGTTTTGATA 1324
Query 1319 ACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGA 1392
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1325 ACAAGAGGATTGTCAGTGGCGCCTATGATGGGAAGATTAAAGTCTGGGACTTGCAGGCTGCTCTTGACCCTCGG 1398
Query 1393 GCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGA 1466
|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1399 GCCCCAGCAAGCACATTGTGTCTGCGCACCTTGGTGGAACACTCTGGACGTGTGTTTCGGCTGCAGTTTGATGA 1472
Query 1467 GTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCC 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 GTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCC 1546
Query 1541 AGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA 1587
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1547 AGAATGAGACCCGCTCTCCCTCCAGAACCTACACCTATATCTCCAGA 1593