Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02746
- Subject:
- XM_006514434.3
- Aligned Length:
- 1587
- Identities:
- 1404
- Gaps:
- 57
Alignment
Query 1 ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATGAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGA 74
|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------ATGGAAGATCAAAATGA 17
Query 75 AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA 148
||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 18 AGATGAGTCCCCAAAGAAAAGTGCTCTTTGGCAGATCAGTAATGGAACGTCATCTGTGATTGTCTCCAGAAAGA 91
Query 149 GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT 222
||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 GGCCGTCAGAGGGGAACTACCAGAAAGAAAAGGACTTGTGCATTAAGTACTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT 165
Query 223 CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA 296
||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 CAGGTGGAATTTGTGGAGCATCTTATCTCACGGATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA 239
Query 297 GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT 370
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 240 GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATCACTGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTCT 313
Query 371 CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA 444
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 314 CCTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTGTGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGG 387
Query 445 ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG 518
|||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 388 ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAGAGGATGGTGCGCACCGACCCTCTCTGGAAGGGACTCTCAGAAAGAAGAGG 461
Query 519 GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA 592
.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 462 CTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCTACAGATGGCCCTCCCAACTCATTTTATAGATCATTATACCCAA 535
Query 593 AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC 666
|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 536 AGATTATCCAGGACATAGAGACCATAGAATCCAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATCCAGTGC 609
Query 667 CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA 740
|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 610 CGCTCTGAAAATAGTAAGGGTGTCTACTGTTTGCAATATGATGATGACAAAATTATCAGTGGCCTCCGGGACAA 683
Query 741 TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT 814
.|||||.|||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 684 CTCTATCAAGATCTGGGATAAAAGCAGCTTGGAATGTTTGAAAGTGCTAACGGGCCACACAGGCTCTGTCCTCT 757
Query 815 GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG 888
|.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 758 GCCTCCAGTATGATGAGCGAGTCATTGTAACTGGTTCTTCAGACTCCACGGTGAGAGTCTGGGATGTGAACACT 831
Query 889 GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT 962
|||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 GGTGAGGTGCTCAACACACTCATCCACCACAATGAAGCCGTACTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT 905
Query 963 GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC 1036
|||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 906 GACTTGTTCCAAGGACCGTTCCATTGCCGTGTGGGACATGGCTTCTGCCACCGATATCACTTTACGCCGTGTTC 979
Query 1037 TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG 1110
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 980 TGGTTGGCCACCGTGCTGCTGTCAATGTAGTAGACTTTGATGATAAATACATCGTGTCTGCTTCAGGAGACAGG 1053
Query 1111 ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG 1184
|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1054 ACCATTAAAGTGTGGAGCACGAGCACATGTGAGTTTGTCCGCACTCTGAATGGGCACAAGCGAGGCATCGCCTG 1127
Query 1185 TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG 1258
|||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1128 TCTGCAGTACCGCGACCGGCTTGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATCCGGTTATGGGATATTGAATGTG 1201
Query 1259 GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC 1332
|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGGCACGAAGAATTGGTCCGGTGCATCCGTTTTGATAACAAGAGGATTGTC 1275
Query 1333 AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC 1406
|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1276 AGTGGCGCCTATGATGGGAAGATTAAAGTCTGGGACTTGCAGGCTGCTCTTGACCCTCGGGCCCCAGCAAGCAC 1349
Query 1407 ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA 1480
|||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 ATTGTGTCTGCGCACCTTGGTGGAACACTCTGGACGTGTGTTTCGGCTGCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA 1423
Query 1481 GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1424 GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGC 1497
Query 1555 TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA 1587
||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1498 TCTCCCTCCAGAACCTACACCTATATCTCCAGA 1530