Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02746
• Subject: XM_006514436.3
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1224
• Gaps: 255

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATGAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA  296
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA  41

Query  297  GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   42  GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATCACTGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTCT  115

Query  371  CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA  444
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  116  CCTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTGTGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGG  189

Query  445  ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG  518
            |||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  190  ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAGAGGATGGTGCGCACCGACCCTCTCTGGAAGGGACTCTCAGAAAGAAGAGG  263

Query  519  GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA  592
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  264  CTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCTACAGATGGCCCTCCCAACTCATTTTATAGATCATTATACCCAA  337

Query  593  AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC  666
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  338  AGATTATCCAGGACATAGAGACCATAGAATCCAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATCCAGTGC  411

Query  667  CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  412  CGCTCTGAAAATAGTAAGGGTGTCTACTGTTTGCAATATGATGATGACAAAATTATCAGTGGCCTCCGGGACAA  485

Query  741  TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT  814
            .|||||.|||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  486  CTCTATCAAGATCTGGGATAAAAGCAGCTTGGAATGTTTGAAAGTGCTAACGGGCCACACAGGCTCTGTCCTCT  559

Query  815  GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG  888
            |.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  560  GCCTCCAGTATGATGAGCGAGTCATTGTAACTGGTTCTTCAGACTCCACGGTGAGAGTCTGGGATGTGAACACT  633

Query  889  GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT  962
            |||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  GGTGAGGTGCTCAACACACTCATCCACCACAATGAAGCCGTACTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT  707

Query  963  GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC  1036
            |||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  708  GACTTGTTCCAAGGACCGTTCCATTGCCGTGTGGGACATGGCTTCTGCCACCGATATCACTTTACGCCGTGTTC  781

Query 1037  TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG  1110
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  782  TGGTTGGCCACCGTGCTGCTGTCAATGTAGTAGACTTTGATGATAAATACATCGTGTCTGCTTCAGGAGACAGG  855

Query 1111  ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG  1184
            |||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  856  ACCATTAAAGTGTGGAGCACGAGCACATGTGAGTTTGTCCGCACTCTGAATGGGCACAAGCGAGGCATCGCCTG  929

Query 1185  TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG  1258
            |||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||.|.||||||||||||||||
Sbjct  930  TCTGCAGTACCGCGACCGGCTTGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATCCGGTTATGGGATATTGAATGTG  1003

Query 1259  GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC  1332
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGGCACGAAGAATTGGTCCGGTGCATCCGTTTTGATAACAAGAGGATTGTC  1077

Query 1333  AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC  1406
            |||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1078  AGTGGCGCCTATGATGGGAAGATTAAAGTCTGGGACTTGCAGGCTGCTCTTGACCCTCGGGCCCCAGCAAGCAC  1151

Query 1407  ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA  1480
            |||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  ATTGTGTCTGCGCACCTTGGTGGAACACTCTGGACGTGTGTTTCGGCTGCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA  1225

Query 1481  GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1226  GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGC  1299

Query 1555  TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1587
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1300  TCTCCCTCCAGAACCTACACCTATATCTCCAGA  1332