Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02746
- Subject:
- XM_017009280.2
- Aligned Length:
- 1587
- Identities:
- 1530
- Gaps:
- 57
Alignment
Query 1 ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATGAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGA 74
|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------ATGGAAGATCAAAATGA 17
Query 75 AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA 91
Query 149 GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT 165
Query 223 CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA 239
Query 297 GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT 313
Query 371 CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314 CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA 387
Query 445 ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388 ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG 461
Query 519 GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA 535
Query 593 AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC 609
Query 667 CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA 683
Query 741 TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT 757
Query 815 GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG 831
Query 889 GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT 905
Query 963 GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 906 GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC 979
Query 1037 TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG 1053
Query 1111 ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG 1127
Query 1185 TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG 1201
Query 1259 GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC 1275
Query 1333 AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276 AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC 1349
Query 1407 ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA 1423
Query 1481 GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424 GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT 1497
Query 1555 TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA 1587
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA 1530