Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_02753
Subject:
XM_017022037.1
Aligned Length:
2628
Identities:
2570
Gaps:
51

Alignment

Query    1  ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA  74

Query   75  GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGGTTGCAACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGGTTGCAACA  148

Query  149  GATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCCAAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCCAAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAG  222

Query  223  TTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGTCCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGTCCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTAC  296

Query  297  GGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACCTCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACCTCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTAC  370

Query  371  GGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTCTGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTCTGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGG  444

Query  445  GACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTGTGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTGTGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGA  518

Query  519  CTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCT  592

Query  593  TAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGG  666

Query  667  ATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCAT  740

Query  741  TGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAA  814

Query  815  GGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATC  888

Query  889  CCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGA  962

Query  963  AATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCT  1036

Query 1037  TCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGC  1110

Query 1111  CTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTTGCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTTGCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGG  1184

Query 1185  GGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGC  1258

Query 1259  TGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAG  1332

Query 1333  CTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCT  1406

Query 1407  ACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGC  1480

Query 1481  TTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCTCTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCTCTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCC  1554

Query 1555  AACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGAT  1628

Query 1629  TTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAGATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAGATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGG  1702

Query 1703  AAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTAT  1776

Query 1777  CTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGA  1850

Query 1851  GAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGG  1924

Query 1925  AAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGC  1998

Query 1999  CGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACA  2072

Query 2073  TGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACT  2146

Query 2147  ATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATT  2220

Query 2221  CACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAAAGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAAAGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGA  2294

Query 2295  GCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATAC  2368

Query 2369  GCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTC  2442

Query 2443  CATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAA  2516

Query 2517  GGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGTGCATTTGCAA-GATACCCCAATGG--AGTGGTCGTCC  2587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|       || ||.|.|   ||||  ..|||..||||
Sbjct 2517  GGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGAG-------AAGGAGAAC---ATGGCTGCTGGCTGTCC  2580

Query 2588  ATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGCTGACACT  2625
                                                  
Sbjct 2581  --------------------------------------  2580