Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02765
- Subject:
- XM_005254264.4
- Aligned Length:
- 3411
- Identities:
- 3186
- Gaps:
- 225
Alignment
Query 1 ATGAGCGACATAGTGGAGAAGACGCTGACGGCGCTGCCGGGACTCTTTCTGCAGAACCAGCCCGGTGGTGGGCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCGGCCGCCAAGGCGTCCTTCTCCTCGAGGCTGGGCAGCCTTGTCCGCGGCATCACAGCCCTCACCTCCAAGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACGAAGAAGAAAAATTAATCCAGCAGGAACTGAGTAGTCTGAAAGCGACTGTTTCTGCTCCTACTACAACACTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAAATGATGAAGGAATGTATGGTGAGACTTATATATTGTGAAATGCTTGGATATGATGCTTCCTTTGGCTATAT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---ATGATGAAGGAATGTATGGTGAGACTTATATATTGTGAAATGCTTGGATATGATGCTTCCTTTGGCTATAT 71
Query 297 TCATGCAATCAAGTTAGCCCAACAAGGAAACCTCTTAGAAAAAAGAGTAGGTTATTTGGCTGTTTCCTTATTTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 TCATGCAATCAAGTTAGCCCAACAAGGAAACCTCTTAGAAAAAAGAGTAGGTTATTTGGCTGTTTCCTTATTTC 145
Query 371 TACATGAAAGTCATGAATTATTGCTTCTCCTTGTGAATACAGTTGTAAAGGATCTGCAGAGCACTAACCTAGTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 TACATGAAAGTCATGAATTATTGCTTCTCCTTGTGAATACAGTTGTAAAGGATCTGCAGAGCACTAACCTAGTA 219
Query 445 GAAGTGTGTATGGCACTGACTGTTGTTAGCCAGATTTTCCCCTGCGAAATGATTCCAGCTGTTCTTCCATTAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 GAAGTGTGTATGGCACTGACTGTTGTTAGCCAGATTTTCCCCTGCGAAATGATTCCAGCTGTTCTTCCATTAAT 293
Query 519 AGAAGATAAACTTCAACATTCTAAGGAGATTGTACGAAGAAAAGCTGTTCTGGCATTATACAAATTCCATCTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 AGAAGATAAACTTCAACATTCTAAGGAGATTGTACGAAGAAAAGCTGTTCTGGCATTATACAAATTCCATCTCA 367
Query 593 TTGCTCCTAATCAAGTACAACATATTCATATTAAGTTTCGGAAAGCACTTTGTGACAGAGATGTTGGGGTCATG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 TTGCTCCTAATCAAGTACAACATATTCATATTAAGTTTCGGAAAGCACTTTGTGACAGAGATGTTGGGGTCATG 441
Query 667 GCTGCCTCCTTGCATATATATCTTAGAATGATTAAGGAGAATTCATCTGGATATAAAGACTTGACTGGGAGTTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 GCTGCCTCCTTGCATATATATCTTAGAATGATTAAGGAGAATTCATCTGGATATAAAGACTTGACTGGGAGTTT 515
Query 741 TGTAACCATTTTGAAGCAAGTAGTTGGAGGAAAGCTCCCAGTAGAATTCAATTACCACAGTGTGCCAGCACCAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 TGTAACCATTTTGAAGCAAGTAGTTGGAGGAAAGCTCCCAGTAGAATTCAATTACCACAGTGTGCCAGCACCAT 589
Query 815 GGTTACAAATTCAGCTCTTGAGAATACTGGGACTTCTAGGAAAAGATGATCAAAGGACAAGTGAATTAATGTAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 GGTTACAAATTCAGCTCTTGAGAATACTGGGACTTCTAGGAAAAGATGATCAAAGGACAAGTGAATTAATGTAT 663
Query 889 GATGTTCTTGATGAATCCTTACGAAGAGCTGAGTTAAATCACAATGTCACATATGCTATTTTGTTTGAATGTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GATGTTCTTGATGAATCCTTACGAAGAGCTGAGTTAAATCACAATGTCACATATGCTATTTTGTTTGAATGTGT 737
Query 963 GCATACAGTCTATTCTATTTATCCTAAATCGGAATTACTTGAGAAGGCTGCCAAGTGCATTGGAAAATTTGTTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 GCATACAGTCTATTCTATTTATCCTAAATCGGAATTACTTGAGAAGGCTGCCAAGTGCATTGGAAAATTTGTTC 811
Query 1037 TGTCACCTAAAATAAATCTAAAATATTTAGGACTGAAGGCTCTTACCTATGTTATCCAACAGGATCCTACTCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 TGTCACCTAAAATAAATCTAAAATATTTAGGACTGAAGGCTCTTACCTATGTTATCCAACAGGATCCTACTCTG 885
Query 1111 GCTCTTCAACACCAGATGACAATAATTGAATGTTTAGATCATCCTGATCCCATTATTAAAAGAGAGACTCTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 GCTCTTCAACACCAGATGACAATAATTGAATGTTTAGATCATCCTGATCCCATTATTAAAAGAGAGACTCTGGA 959
Query 1185 ACTTCTTTACAGAATTACTAATGCACAGAATATAACAGTTATTGTCCAGAAAATGCTTGAATATTTACATCAGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACTTCTTTACAGAATTACTAATGCACAGAATATAACAGTTATTGTCCAGAAAATGCTTGAATATTTACATCAGA 1033
Query 1259 GCAAAGAAGAGTATGTCATCGTCAATTTGGTCGGCAAAATAGCAGAGCTGGCTGAGAAATATGCTCCTGATAAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 GCAAAGAAGAGTATGTCATCGTCAATTTGGTCGGCAAAATAGCAGAGCTGGCTGAGAAATATGCTCCTGATAAT 1107
Query 1333 GCATGGTTTATTCAGACAATGAATGCTGTGTTTTCAGTAGGAGGAGATGTAATGCATCCTGATATTCCCAATAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GCATGGTTTATTCAGACAATGAATGCTGTGTTTTCAGTAGGAGGAGATGTAATGCATCCTGATATTCCCAATAA 1181
Query 1407 CTTTCTGAGACTACTAGCGGAAGGTTTTGATGATGAAACAGAAGATCAGCAATTAAGACTCTATGCAGTTCAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CTTTCTGAGACTACTAGCGGAAGGTTTTGATGATGAAACAGAAGATCAGCAATTAAGACTCTATGCAGTTCAGT 1255
Query 1481 CTTATCTCACTTTACTGGATATGGAAAATGTGTTCTATCCACAGAGATTTCTTCAAGTTATGAGTTGGGTATTA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 CTTATCTCACTTTACTGGATATGGAAAATGTGTTCTATCCACAGAGATTTCTTCAAGTTATGAGTTGGGTATTA 1329
Query 1555 GGGGAATATTCCTACCTCTTAGATAAGGAAACGCCAGAGGAAGTTATAGCTAAGCTCTACAAGTTACTTATGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 GGGGAATATTCCTACCTCTTAGATAAGGAAACGCCAGAGGAAGTTATAGCTAAGCTCTACAAGTTACTTATGAA 1403
Query 1629 TGACTCTGTGTCTTCAGAAACAAAAGCCTGGTTAATTGCTGCTGTGACCAAATTGACATCTCAGGCGCACTCTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 TGACTCTGTGTCTTCAGAAACAAAAGCCTGGTTAATTGCTGCTGTGACCAAATTGACATCTCAGGCGCACTCTT 1477
Query 1703 CTAATACAGTTGAGAGATTAATCCATGAATTTACCATATCTTTGGATACTTGTATGAGACAACATGCATTTGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 CTAATACAGTTGAGAGATTAATCCATGAATTTACCATATCTTTGGATACTTGTATGAGACAACATGCATTTGAA 1551
Query 1777 TTAAAACATTTGCATGAGAATGTGGAACTTATGAAGAGCTTGCTTCCAGTTGACAGGAGTTGTGAAGACTTGGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 TTAAAACATTTGCATGAGAATGTGGAACTTATGAAGAGCTTGCTTCCAGTTGACAGGAGTTGTGAAGACTTGGT 1625
Query 1851 GGTAGATGCTTCTTTATCTTTTCTGGATGGTTTTGTGGCTGAAGGACTCAGTCAGGGTGCAGCGCCTTACAAAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 GGTAGATGCTTCTTTATCTTTTCTGGATGGTTTTGTGGCTGAAGGACTCAGTCAGGGTGCAGCGCCTTACAAAC 1699
Query 1925 CTCCCCATCAACGCCAGGAGGAAAAGCTTTCTCAGGAAAAAGTTCTCAATTTTGAACCATATGGACTCTCCTTT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 CTCCCCATCAACGCCAGGAGGAAAAGCTTTCTCAGGAAAAAGTTCTCAATTTTGAACCATATGGACTCTCCTTT 1773
Query 1999 TCTTCATCTGGCTTCACTGGACGACAGTCTCCTGCTGGCATTTCTCTTGGTTCAGATGTATCTGGGAATAGTGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 TCTTCATCTGGCTTCACTGGACGACAGTCTCCTGCTGGCATTTCTCTTGGTTCAGATGTATCTGGGAATAGTGC 1847
Query 2073 TGAGACAGGACTGAAAGAGACAAATAGCTTGAAGCTGGAAGGTATAAAGAAATTGTGGGGGAAAGAAGGCTATC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 TGAGACAGGACTGAAAGAGACAAATAGCTTGAAGCTGGAAGGTATAAAGAAATTGTGGGGGAAAGAAGGCTATC 1921
Query 2147 TTCCCAAGAAGGAAAGCAAAACTGGTGATGAAAGTGGAGCTCTGCCTGTTCCTCAAGAGAGTATAATGGAGAAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TTCCCAAGAAGGAAAGCAAAACTGGTGATGAAAGTGGAGCTCTGCCTGTTCCTCAAGAGAGTATAATGGAGAAT 1995
Query 2221 GTAGATCAAGCTATAACTAAAAAGGATCAATCTCAAGTTCTTACCCAATCTAAAGAGGAGAAAGAAAAGCAGCT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 GTAGATCAAGCTATAACTAAAAAGGATCAATCTCAAGTTCTTACCCAATCTAAAGAGGAGAAAGAAAAGCAGCT 2069
Query 2295 GCTGGCATCATCATTATTTGTTGGTCTAGGATCAGAAAGTACAATCAACCTGCTGGGAAAAGCAGATACTGTCT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 GCTGGCATCATCATTATTTGTTGGTCTAGGATCAGAAAGTACAATCAACCTGCTGGGAAAAGCAGATACTGTCT 2143
Query 2369 CTCACAAGTTCAGAAGGAAATCAAAAGTCAAAGAAGCTAAAAGTGGCGAAACAACCAGTACTCATAATATGACC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 CTCACAAGTTCAGAAGGAAATCAAAAGTCAAAGAAGCTAAAAGTGGCGAAACAACCAGTACTCATAATATGACC 2217
Query 2443 TGTTCTTCCTTTAGTTCTTTGTCAAATGTGGCATATGAAGATGATTATTATTCGAATACTTTGCACGATACAGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 TGTTCTTCCTTTAGTTCTTTGTCAAATGTGGCATATGAAGATGATTATTATTCGAATACTTTGCACGATACAGG 2291
Query 2517 AGACAAGGAATTAAAGAAATTTTCTCTCACTTCAGAACTTTTGGATTCTGAGTCACTCACAGAACTGCCCTTGG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 AGACAAGGAATTAAAGAAATTTTCTCTCACTTCAGAACTTTTGGATTCTGAGTCACTCACAGAACTGCCCTTGG 2365
Query 2591 TTGAGAAATTCTCATATTGTAGTCTGTCTACACCTTCATTGTTTGCTAATAACAACATGGAAATTTTTCACCCT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 TTGAGAAATTCTCATATTGTAGTCTGTCTACACCTTCATTGTTTGCTAATAACAACATGGAAATTTTTCACCCT 2439
Query 2665 CCTCAATCTACTGCAGCCTCAGTTGCCAAGGAAAGCTCTTTAGCTTCATCTTTTTTGGAAGAAACTACTGAATA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 CCTCAATCTACTGCAGCCTCAGTTGCCAAGGAAAGCTCTTTAGCTTCATCTTTTTTGGAAGAAACTACTGAATA 2513
Query 2739 CATACACTCAAATGCTATGGAAGTCTGTAATAATGAAACTATATCAGTGTCTTCTTATAAAATTTGGAAAGATG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 CATACACTCAAATGCTATGGAAGTCTGTAATAATGAAACTATATCAGTGTCTTCTTATAAAATTTGGAAAGATG 2587
Query 2813 ATTGTTTATTGATGGTCTGGTCAGTCACTAATAAGAGTGGTTTGGAATTGAAAAGTGCTGACTTAGAAATTTTT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 ATTGTTTATTGATGGTCTGGTCAGTCACTAATAAGAGTGGTTTGGAATTGAAAAGTGCTGACTTAGAAATTTTT 2661
Query 2887 CCTGCAGAAAATTTCAAGGTGACTGAGCAACCTGGATGCTGTTTGCCTGTAATGGAAGCAGAAAGCACCAAAAG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662 CCTGCAGAAAATTTCAAGGTGACTGAGCAACCTGGATGCTGTTTGCCTGTAATGGAAGCAGAAAGCACCAAAAG 2735
Query 2961 CTTTCAATATAGTGTGCAGATAGAAAAACCTTTTACAGAAGGAAATCTTACTGGTTTTATTAGTTATCATATGA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 CTTTCAATATAGTGTGCAGATAGAAAAACCTTTTACAGAAGGAAATCTTACTGGTTTTATTAGTTATCATATGA 2809
Query 3035 TGGATACTCATTCTGCTCAGCTGGAATTTTCTGTAAACTTATCACTATTAGATTTCATTAGACCATTAAAAATC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 TGGATACTCATTCTGCTCAGCTGGAATTTTCTGTAAACTTATCACTATTAGATTTCATTAGACCATTAAAAATC 2883
Query 3109 TCAAGTGACGACTTTGGGAAACTCTGGTTATCCTTCGCAAATGATGTGAAACAAAATGTAAAAATGTCAGAATC 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884 TCAAGTGACGACTTTGGGAAACTCTGGTTATCCTTCGCAAATGATGTGAAACAAAATGTAAAAATGTCAGAATC 2957
Query 3183 TCAAGCTGCACTTCCTTCTGCACTAAAGACTCTGCAACAGAAACTAAGACTCCATATTATTGAGATTATAGGCA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958 TCAAGCTGCACTTCCTTCTGCACTAAAGACTCTGCAACAGAAACTAAGACTCCATATTATTGAGATTATAGGCA 3031
Query 3257 ATGAAGGGCTATTGGCCTGTCAGCTGCTCCCATCCATCCCCTGCTTACTGCATTGCCGAGTTCATGCAGATGTA 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3032 ATGAAGGGCTATTGGCCTGTCAGCTGCTCCCATCCATCCCCTGCTTACTGCATTGCCGAGTTCATGCAGATGTA 3105
Query 3331 TTAGCCCTGTGGTTCAGATCCTCCTGTTCTACTCTTCCTGACTATTTACTGTATCAGTGTCAAAAGGTGATGGA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3106 TTAGCCCTGTGGTTCAGATCCTCCTGTTCTACTCTTCCTGACTATTTACTGTATCAGTGTCAAAAGGTGATGGA 3179
Query 3405 GGGATCC 3411
|||||||
Sbjct 3180 GGGATCC 3186